Активатор апоптоза harakiri

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Активатор апоптоза harakiri
Обозначения
Символы HRK; harakiri, BCL2-interacting protein (contains only BH3 domain), Neuronal death protein DP5
Entrez Gene 8739
HGNC 5185
OMIM 603447
PDB 2L58
RefSeq NM_003806
UniProt O00198
Другие данные
Локус 12-я хр., 12q24.2

Активатор апоптоза harakiri (HRK) — белок семейства Bcl2, активатор апоптоза, который у человека кодируется геном HRK.

Структура гена, мРНК и белка[править | править вики-текст]

кДНК HRK была впервые независимо клонирована из клеток HeLa и симпатических нейронов крыс в 1997 году[1][2]. кДНК HRK человека имела длину около 700 нуклеотидов и включала 5'- и 3'-некодирующие области, кодирующую область и поли(А)-хвост. В 3'-некодирующей области был обнаружен сигнал дестабилизации мРНК 5'-ATTTA-3'[1].

Ген HRK кодирует белок длиной в 91 аминокислотный остаток. Гомологи HRK по первичной структуре пока не обнаружены. Фрагмент 37—44 гомологичен домену BH3 (англ. Bcl-2 homology domain 3)[1].

Распространение и внутриклеточная локализация[править | править вики-текст]

Методом нозерн-блота мРНК HRK была обнаружена в лимфоидных органах, особенно в селезёнке и костном мозге, а также в поджелудочной железе человека[1]. Хотя методом полногеномного секвенирования РНК присутствие мРНК HRK в селезёнке и костном мозге выявить не удалось, небольшие её количества были обнаружены в лимфатических узлах, коре головного мозга, щитовидной железе, надпочечниках и тестикулах[3].

мРНК HRK была обнаружена только в головном мозге взрослых крыс и отсутствовала в селезёнке, тимусе, тестикулах, тонком кишечнике, сердечной и скелетных мышцах[2].

Методом иммуногистохимии низкие и средние количества белка Hrk были обнаружены во многих органах, при этом препараты тонкого кишечника, поджелудочной железы, кожы, молочных желёз и лимфоидных тканей имели, как правило, отрицательную окраску (белок отсутствует)[3].

В клетках HRK локализуется преимущественно в митохондриях и взаимодействует там с белком митохондриального матрикса p32[4].

Примечания[править | править вики-текст]

  1. 1 2 3 4 Inohara N., Ding L., Chen S., Núñez G. harakiri, a novel regulator of cell death, encodes a protein that activates apoptosis and interacts selectively with survival-promoting proteins Bcl-2 and Bcl-X(L) // EMBO J. — 1997. — Vol. 16. — № 7. — P. 1686—94. — PMID 9130713.
  2. 1 2 Imaizumi K., Tsuda M., Imai Y., Wanaka A., Takagi T., Tohyama M. Molecular cloning of a novel polypeptide, DP5, induced during programmed neuronal death // J Biol Chem. — 1997. — Vol. 272. — № 30. — P. 18842—8. — PMID 9228060.
  3. 1 2 HRK в базе данных The Human Protein Atlas. Проверено 7 апреля 2014.
  4. Sunayama J., Ando Y., Itoh N., Tomiyama A., Sakurada K., Sugiyama A., Kang D., Tashiro F., Gotoh Y., Kuchino Y., Kitanaka C. Physical and functional interaction between BH3-only protein Hrk and mitochondrial pore-forming protein p32 // Cell Death Differ. — 2004. — Vol. 11. — № 7. — P. 771—81. — PMID 15031724.