Бактериородопсин

Тример бактериородопсина
Обозначения в базах данных
Pfam	PF01036
InterPro	IPR001425
PROSITE	PDOC00291
SCOP	2brd
TCDB	3.E.1
OPM family	6
OPM protein	1vgo

Бактериородопсины — семейство мембранных светочувствительных белков археот (например, галобактерий). Бактериородопсины осуществляют перенос протона через плазматическую мембрану, по строению сходны с родопсинами млекопитающих.

Состав белка

Трансмембранная часть бактериородопсина сложена из 7 регулярных $\alpha$-спиралей, идущих от одного до другого края мембраны, а одинокая $\beta$-шпилька и все нерегулярные участки цепи (соединяющие спирали-петли) выходят из мембраны. Сидящие на $\alpha$-спиралях гидрофобные группы обращенны «наружу» к липидам (тоже гидрофобным) мембраны. Полярные же группы (их немного) обращены внутрь очень узкого канала, по которому идет протон.

Процесс переноса протона через мембрану

Протонная проводимость осуществляется при содействии прикрепленной внутри пучка спиралей молекулы кофактора — ретиналя. Он перекрывает центральный канал бактериородопсина. Поглотив фотон, ретиналь переходит из полностью-транс в 13-цис форму. При этом он изгибается и переносит протон с одного конца семиспирального пучка на другой. А потом ретиналь разгибается и возвращается назад, но уже без протона.

Литература

• А. В. Финкельштейн, О. Б. Птицын, «Физика белка», 2002

См. также

• Родопсин
• Ретинол
• Сенсорный родопсин II