Гаплогруппа D (Y-ДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Не следует путать с Гаплогруппа D (мтДНК).
Гаплогруппа D
Тип Y-ДНК
Время появления 64,7-83 тыс. лет назад[1]
Место появления Африка, Азия[1]
Предковая группа DE
Сестринские группы E
Субклады D1, D2
Мутации-маркеры CTS3946, CTS4030/Z1605

Гаплогруппа D (CTS3946) — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Как гаплогруппа D, так и E содержат однонуклеотидный полиморфизм M168, который имеется во всех гаплогруппах, кроме A и B (см. группа CT), а также полиморфизм уникального события YAP, уникальный для гаплогруппы DE — общего предка D и Е.

Происхождение[править | править код]

Гаплогруппа D происходит от мутации Y-хромосомной гаплогруппы DE, произошедшей у мужчины, жившего предположительно 65,2 тыс. лет назад. Время жизни общего предка всех живущих носителей Y-хромосомной гаплогруппы D — 46,5 тыс. лет назад (даты определены по снипам компанией YFull[2]).

Крис Тайлер-Смит с коллегами считают, что гаплогруппа D образовалась в Африке около 73 тыс. л. н., а около 71 тыс. лет назад отделилась западноафриканская линия D0[1]. И гаплогруппа D, и гаплогруппа E содержат характеристику уникальный полиморфизм событий YAP, но показывают общее происхождение. Субклад гаплогруппы D1- M174 возник, с большой вероятностью в Азии, около 60 тыс. лет назад. Субклад гаплогруппы D1- M174 не встречается за пределами Азии. Гаплогруппа D2 была обнаружена незначительно в Африке и Передней Азии[3].

По мнению Т. Карафет, гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет назад[4][5].

Палеогенетика[править | править код]

  • Гаплогруппа D обнаружена у образца Ma91 (ок. 4319 л. н.) из Малайзии[6].
  • Субклад D1a2b1 (D1b2a-CTS220 в ISOGG 2018) выявлен у представителя культуры Дзёмон, жившего примерно 3500—3800 лет назад[7]. У образца I6341 (Burial 5, JOM_137, 1500—1000 лет до н. э., Funadomari, Ребун) определена Y-хромосомная гаплогруппа D-M174/F1344>D1b-M64.1>Z1516, у образца I13887 (1063 Burial 7, 2191—1982 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1570 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13886 (1062 Burial 6, 2136—1959 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1a2a3a-Z1575 (D1b1c1 в ISOGG 2018), у образца I13883 (1050 Burial 2, 984—835 лет до н. э., Rokutsu Shell Mound, Хонсю) — D1b-M64.1>D1b1c-CTS6609>D1b1c1-Z1574>Y11739 (ISOGG 2018)[8].
  • Гаплогруппа D1a2a1 определена у представителя кобанской культуры из могильника Заюково-3, расположенного близ села Заюково в Баксанском районе Кабардино-Балкарии (VIII—VII века до н. э.)[9].
  • D1b-M64.1>Z1516>CTS220 определили у образца I15926 (SRM 3826-1163, Pogrebeniye 2, Burial #2, 1800—1950 гг.) со стоянки Nevelsk 2 на Сахалине[8].

Обзор[править | править код]

В настоящее время встречается с высокой частотой среди населения Тибета, Японского архипелага[10] и Андаманских островов, однако, в силу неизвестных обстоятельств, пока не обнаружена на полуострове Индостан. Айны в Японии, а также народы джарава и онге на Андаманских островах имеют почти исключительно данную гаплогруппу, хотя у айнов кроме гаплогруппы D1a2 (81,3%[11]) с частотой около 15 % также встречается Y-хромосомная гаплогруппа C3.

Также Y-хромосомная гаплогруппа D обнаружена с низкой или умеренной частотой у народов Центральной Азии и севера Восточной Азии, а также у китайцев-хань и народов мяо-яо в Китае и некоторых национальных меньшинств китайских провинций Сычуань и Юньнань, говорящих на тибето-бирманских языках и проживающих в непосредственной близости от тибетцев. Субклад D1a1a-M15, выявленный в популяции народа И (Ляншань-Ийский автономный округ) был разветвлением расширения тибетских групп с запада на восток на плато[12].

В отличие от гаплогруппы C, гаплогруппа D не мигрировала из Азии через Берингию в Новый Свет.

Гаплогруппа D также примечательна своей исключительной географической дифференциацией, когда определённый подкласс гаплогруппы чётко локализуется в какой-либо популяции, где большой процент лиц имеют гаплогруппу D:

Такая, по-видимому, древняя диверсификация гаплогруппы D заставляет предположить, что её скорее следует охарактеризовать как «супергаплогруппу», «макрогаплогруппу».

Особо характерными являются примеры гаплогруппы D у населения Японских островов, поскольку они содержат комплекс из как минимум пяти отдельных мутаций, свойственных гаплогруппе D, что ясно отличает их от гаплогруппы D, обнаруженной у жителей Тибета и Андаманских островов. Этот факт является свидетельством того, что гаплогруппа D1a2 была модальной гаплогруппой доисторической культуры Дзёмон на Японских островах.

Подклассы[править | править код]

Филогенетическое дерево[править | править код]

ISOGG (version: 14.151)[13].

Примечания[править | править код]

  1. ↑ 1 2 3 4 Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa (англ.) // Genetics : journal. — 2019. — 13 June. — P. genetics.302368.2019. — ISSN 0016-6731. — doi:10.1534/genetics.119.302368. — PMID 31196864.
  2. ↑ D YTree. Дата обращения: 30 марта 2018. Архивировано 31 августа 2019 года.
  3. ↑ 1 2 Estes, Roberta Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries! (англ.). DNAeXplained - Genetic Genealogy (21 июня 2019). Дата обращения: 8 июля 2019. Архивировано 6 июля 2019 года.
  4. ↑ Shi et al. (2008) Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations Архивная копия от 31 марта 2010 на Wayback Machine, BMC Biology
  5. ↑ Tatiana M. Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. ↑ Hugh McColl et al. Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia, 2018
  7. ↑ POB-162 Phenotype and phylogeny of Neolithic Japanese hunter-gatherers, Jomon people, based on whole nuclear genome sequences // SMBE 2018 Архивная копия от 7 июля 2018 на Wayback Machine
  8. ↑ 1 2 Chuan-Chao Wang et al. Genomic Insights into the Formation of Human Populations in East Asia Архивная копия от 31 июля 2021 на Wayback Machine (Supplementary Tables // Table 1. Newly reported ancient individuals), 2021
  9. ↑ Eugenia Boulygina et al. Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the prehistoric Koban culture of the North Caucasus, 2020
  10. ↑ Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking and Satoshi Horai, «Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes», Journal of Human Genetics Volume 51, Number 1 / January, 2006.
  11. ↑ Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analysis of whole Y-chromosome sequences reveals the Japanese population history in the Jomon period Архивная копия от 30 сентября 2019 на Wayback Machine, 2019
  12. ↑ Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou. Genetic reconstruction and phylogenetic analysis by 193 Y-SNPs and 27 Y-STRs in a Chinese Yi ethnic group Архивная копия от 16 июля 2021 на Wayback Machine, 28 April 2021
  13. ↑ Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019. Дата обращения: 6 сентября 2019. Архивировано 11 октября 2019 года.
  14. ↑ 1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
  15. ↑ D YTree. www.yfull.com. Дата обращения: 3 сентября 2019. Архивировано 31 августа 2019 года.
  16. ↑ Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014. Дата обращения: 11 сентября 2017. Архивировано 28 мая 2017 года.

Литература[править | править код]

  • Shi; et al. (2008), "Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations" (PDF), BMC Biology, 6 (45), doi:10.1186/1741-7007-6-45 {{citation}}: Явное указание et al. в: |author= (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

См. также[править | править код]

Эволюционное древо гаплогрупп Y-хромосомы человека
Y-хромосомный Адам
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1  F2  F3    GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
I J LT (K1) K2
L (K1a)   T (K1b)       K2a/K2a1/NO/NO1 K2b
N O   K2b1     P (K2b2)/P1  
  S (K2b1a) M (K2b1b) Q R  

Ссылки[править | править код]

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Гаплогруппа_D_(Y-ДНК)&oldid=123390955