Гаплогруппа L3 (мтДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Гаплогруппа L3
[[Файл:|200px|]]
Тип мтДНК
Время появления 84000 - 104000 гг. тому назад[1]
Место появления Восточная Африка[2]
Предковая группа Митохондриальная Ева
Субклады L3a, L3b, L3c, L3d, L3e, L3f, L3h, L3i, L3j, L3k, L3x, M, N [3]
Мутации-маркеры 769, 1018, 16311

Гаплогруппа L3 — в популяционной генетике — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Происхождение[править | править исходный текст]

Предполагается, что гаплогруппа возникла около 85 — 105 тыс. лет тому назад.

Распространение[править | править исходный текст]

Чаще всего данная гаплогруппа встречается в Восточной Африке, в отличие от других территорий Африки, где 2/3 всех митохондриальных ДНК представляют гаплогруппы L1 и L2.[4]

L3 подразделяется на несколько подгрупп, одна из которых, как предполагается, является предком макро-гаплогрупп M и N, от которых произошло большинство неафриканских народов.

Одна из этих линий, которая определяется потерей участка DdeI на np 10394, представляет лишь небольшой процент африканских мтДНК, однако является, по-видимому, предком почти половины всех европейских, азиатских и индейских мтДНК."[5]

По мнению Мака-Майер и др. (Maca-Meyer et al. 2001), «L3 больше связана с евразийскими гаплогруппами, чем с наиболее разнообразными африканскими кластерами L1 и L2».[6] L3 — это гаплогруппа, от которой происходят все современные люди за пределами Африки.[7]

Подклассы (потомки) гаплогруппы L3[править | править исходный текст]

Филогенетическое дерево[править | править исходный текст]

Приведенное ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена (Van Oven 2008) и последующих опубликованных исследованиях.

  • L3
    • L3a 152, 523-524d, 12816 16316
    • L3b 3450, 5773, 6221, 9449, 10086, 13914A, 15311, 15824, 15944d, 16124, 16278, 16362 (западная Африка)
      • L3b1 10373, 16519
        • L3b1a 11002
        • L3b1b 152, 9079, 15664
      • L3b2 3420, 16183C, 16189
    • L3c 195, 498.1C, 678, 3582, 4491, 5393, 7394, 9337, 9682, 12373, 14221, 14371, 14560, 14587, 16311, 16362
    • L3d 5147, 7424, 8618, 13886, 14284, 16124 (западная Африка)
      • L3d1 6680
        • L3d1a 4048, 7648, 11887
          • L3d1a 4048, 7648, 11887
            • L3d1a1 1503, 16319
        • L3d1b 5046
        • L3d1c 3203, 9111, 11239, 12870, 13542, 16166
        • L3d1d 7765, 9151, 16086, 16256, 16368, 16519
      • L3d2 3394, 11518, 12873, 14272, 14584, 15115
      • L3d3 4688
        • L3d3a 2416, 15208
    • L3j 5821, 6182, 6722, 8676, 9365, 9731A, 12280, 12534, 14260, 15314, 15479, 15514
    • L3e 2352, 14212 (центральная Африка/Судан)
      • L3e1 189, 200, 6221, 6587, 14152, 15670, 15942, 16327
        • L3e1a 16185
          • L3e1a1 185, 8650, 16311
          • L3e1a2 195, 207, 5774A, 9254, 11024, 14569, 16209
          • L3e1a3 10398
        • L3e1b 14926, 16325d
        • L3e1c 3675, 5460, 8289.1CCCCCTCTA, 8701, 14323
        • L3e1d 152, 8703, 9300, 12738, 16176
        • L3e1e 10370, 14571A
      • L3e2 195, 14905, 16320, 16519
        • L3e2a 4823, 13105, 14869
        • L3e2b 16172, 16183C, 16189
          • L3e2b1 408A, 2483, 9377, 16188.1C
          • L3e2b2 11377, 16182C
      • L3e3 195, 2000, 6524, 9554, 10667, 10816, 13101C, 16265T
        • L3e3a 10286, 12397
        • L3e3b 4655, 12248, 13197, 13651, 15812
      • L3e4 3915, 5584, 11257, 13749, 16051
      • L3e5 398, 8392, 16041
    • L3i 7645
      • L3i1 10679, 11260, 13800A
        • L3i1a 13967, 14060, 15758
        • L3i1b 2158, 13687, 16153
      • L3i2 152, 189, 504, 523-524d, 5441, 8222, 12630, 14818, 15388, 15944d, 16260, 16311 (Эфиопия — ранее называлась L3w)
    • L3k 235, 494, 3918, 6620G, 9467, 13135, 13992, 15314
    • L3x 3483, 5899.1C, 6401, 8311, 8817, 13708, 16169 (Эфиопия, оромо)[8]
      • L3x1 204, 15172, 16278
      • L3x2 249d, 494, 9941, 16195
        • L3x2a 3435, 16193, 16223
    • L3f 3396, 4218, 15514, 15944d, 16209, 16519 (восточная Африка)
      • L3f1 5601, 9950
        • L3f1a 3693, 4350, 5194, 14148, 15106
        • L3f1b 189, 200, 1822, 7819A, 8527, 8932, 11440, 14769, 16292, 16311
          • L3f1b1 8410, 10070, 16129, 16295
          • L3f1b2 7235A
          • L3f1b3 711, 6806, 7158
      • L3f2 745.1T, 16311
        • L3f2b 374.1A, 2442, 5342, 11016, 12338, 15466, 15658
        • L3f3 189, 318, 959, 4643, 5181, 6602, 8158, 8251, 9932, 10604, 11770, 15940, 16176, 16234 (Чадский бассейн, центральная Африка)[9]
    • L3h- 7861, 9575
      • L3h1 1719, 4388, 5300, 9509, 11590, 16311
        • L3h1a 5492
          • L3h1a1 516, 709, 4117, 5316, 8047, 8485, 9080, 12432, 13708, 13926, 14110
          • L3h1a2 8781A
            • L3h1a2a 146, 4688, 4742, 8943, 12175, 12236, 12519, 14587, 14862, 15646, 16399
        • 'L3h1b 189C, 195, 523-524d, 10044, 14410, 16284, 16256A
          • L3h1b1 3777

Примечания[править | править исходный текст]

  1. Tishkoff et al., Whole-mtDNA Genome Sequence Analysis of Ancient African Lineages, Mol. Biol. Evol, 24(3):757-68. 2007
  2. Salas et al. (2002), The Making of the African mtDNA Landscape, Am J Hum Genet. 2002 November; 71(5): 1082–1111
  3. van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org, mtDNA tree Build 2 (14 Oct 2008)
  4. Wallace DC et al. (2000), Origin of haplogroup M in Ethiopia, Am J Hum Genet 67(Suppl):217
  5. Wallace et al., Mitochondrial DNA variation in human evolution and disease, Gene, 1999 Sep 30;238(1):211-30
  6. Maca-Meyer et al. (2001), Major genomic mitochondrial lineages delineate early human expansions, BMC Genetics 2001, 2:13
  7. Cambridge DNA Services
  8. Kivisild et al. 2004 November. «Ethiopian Mitochondrial DNA Heritage: Tracking Gene Flow Across and Around the Gate of Tears» American Journal of Human Genetics 75(5): 759
  9. Černý et al., (2009). Migration of Chadic speaking pastoralists within Africa based on population structure of Chad Basin and phylogeography of mitochondrial L3f haplogroup. BMC Evolutionary Biology, 9:63, 2.

См. также[править | править исходный текст]

Дерево гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Ссылки[править | править исходный текст]

Общие сведения[править | править исходный текст]

Гаплогруппа L3[править | править исходный текст]