Свою профессиональную карьеру Ким Джон У начал в клубе «Ульсан Хёндэ», за который он отыграл три сезона. В 2006 году Ким решил попробовать себя в иностранном чемпионате, перейдя в японский «Нагоя Грампус», но проведя в нём два года он вернулся в Южную Корею. В 2008 и 2009 годах Ким выступал за «Соннам Ильхва Чхонма», а в 2010 году перешёл в «Кванджу Санму Финикс».
.svg){kind=small}
