Прибнов-бокс

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск

Прибнов-бокс (также известен как Прибнов-Шаллер бокс (англ. Pribnow-Schaller box)) — специфическая нуклеотидная последовательность, обязательная для промоторного участка бактерий, с которой связывается РНК-полимераза[1][2]. Последовательность нуклеотидов Прибнов-бокса — ТАТААТ называют также консенсусной последовательностью[en], поскольку она встречается у многих организмов с небольшими различиями. Назван в честь Дэвида Прибнова и Хайнца Шаллера[1][2].

Прибнов-бокс называют также —10-последовательностью, так как она располагается приблизительно на 10 пар нуклеотидов выше точки начала транскрипции.

Фукнции данной последовательности сходны с ТАТА-боксом, встречающимся у эукариот и архей: он распознаётся и связывается участком РНК-полимеразы во время иницации транскрипции. Она также является первой точкой, где комплементарные цепи ДНК расходятся, чтобы дать возможность начаться синтезу РНК на матрице ДНК. Это облегчается большим количеством АТ-пар, поскольку связи между аденином и тимином менее прочны, чем между гуанином и цитозином[3].

Вероятность нахождения каждого нуклеотида[править | править исходный текст]

T A T A A T
82% 89% 52% 59% 49% 89%

[4]

Примечания[править | править исходный текст]

  1. 1 2 Pribnow, David (March 1975). «Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter». PNAS 72 (3): 784–788. DOI:10.1073/pnas.72.3.784. ISSN 1091-6490. PMID 1093168.
  2. 1 2 Schaller, Heinz (February 1975). «Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site from the DNA of Bacteriophage fd». PNAS 72 (2): 737–741. DOI:10.1073/pnas.72.2.737. ISSN 1091-6490. PMID 1054851.
  3. Yakovchuk, Peter (January 2006). «Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix». Nucleic Acids Research 34 (2): 564–574. DOI:10.1093/nar/gkj454. ISSN 0305-1048. PMID 16449200.
  4. Harley, Calvin B. (March 1987). «Analysis of E. coli promoter sequences» (PDF, 0.9 MB). Nucleic Acids Research 15 (5): 2343–2361. DOI:10.1093/nar/15.5.2343. ISSN 0305-1048. PMID 3550697.