Прибнов-бокс

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск

Прибнов-бокс (также известен как Прибнов-Шаллер бокс (англ. Pribnow-Schaller box)) — специфическая нуклеотидная последовательность, обязательная для промоторного участка бактерий, с которой связывается РНК-полимераза[1][2]. Последовательность нуклеотидов Прибнов-бокса — ТАТААТ — считают консенсусной последовательностью[en], поскольку она встречается у многих организмов с небольшими различиями. Эта последовательность названа в честь Дэвида Прибнова и Хайнца Шаллера[1][2].

Прибнов-бокс называют также −10-последовательностью, так как она располагается приблизительно на 10 пар нуклеотидов выше точки начала транскрипции.

Фукнции данной последовательности сходны с ТАТА-боксом, встречающимся у эукариот и архей: он распознаётся и связывается участком РНК-полимеразы во время иницации транскрипции. Она также является первой точкой, где комплементарные цепи ДНК расходятся, чтобы дать возможность начаться синтезу РНК на матрице ДНК. Это облегчается большим количеством АТ-пар, поскольку связи между аденином и тимином менее прочны, чем между гуанином и цитозином[3].

Вероятность нахождения каждого нуклеотида[править | править вики-текст]

T A T A A T
82 % 89 % 52 % 59 % 49 % 89 %[4]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. 1 2 Pribnow D. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site at an early T7 promoter. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 1975. — Vol. 72. — № 3. — P. 784–788. — PMID 1093168. исправить
  2. 1 2 Schaller H., Gray C., Herrmann K. Nucleotide sequence of an RNA polymerase binding site from the DNA of bacteriophage fd. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 1975. — Vol. 72. — № 2. — P. 737–741. — PMID 1054851. исправить
  3. Yakovchuk P., Protozanova E., Frank-Kamenetskii M. D. Base-stacking and base-pairing contributions into thermal stability of the DNA double helix. (англ.) // Nucleic acids research. — 2006. — Vol. 34. — № 2. — P. 564–574. — DOI:10.1093/nar/gkj454 — PMID 16449200. исправить
  4. Harley C. B., Reynolds R. P. Analysis of E. coli promoter sequences. (англ.) // Nucleic acids research. — 1987. — Vol. 15. — № 5. — P. 2343–2361. — PMID 3550697. исправить