Протеомика
Протеомика — наука, основным предметом изучения которой являются белки, их функции и взаимодействия в живых организмах, в том числе — в человеческом. Основная задача протеомики — количественный анализ экспрессии белков в клетках в зависимости от их типа, состояния или влияния внешних условий[1]. Протеомика осуществляет сравнительный анализ больших групп белков — от всех белков, вовлеченных в тот или иной биологический процесс[2] до полного протеома[3].
Содержание |
История [править]
Традиционно изучение белков являлось одним из разделов биохимии, но после определения структуры всей геномной ДНК человека и ряда других организмов у исследователей белков появились новые методы, с которыми и связывают появление в 1997 году[4] нового термина протеомика (от протеин и геномика). В частности, появились исчерпывающие базы данных, содержащие последовательности всех белков человека, а также их протеолитических фрагментов, полученных в стандартных условиях. Это позволяет идентифицировать белки по молекулярной массе их фрагментов методом масс-спектрометрии. Поскольку протеомика оперирует большим объемом данных, для обработки которых требуются специализированные алгоритмы и большие вычислительные мощности, она тесно связана с биоинформатикой.
Практические применения [править]
Обнаружение биомаркеров биологических процессов [править]
Биомаркер — молекула, наличие или отсутствие которой позволяет сделать вывод об протекании определнного клеточного процесса, или определить тип клетки. Нередко в роли биомаркеров выступают белки, например белок Oct-4 позволяет идентифицировать эмбриональные стволовые клетки.
Применения в медицине [править]
Сравнение протеомов здорового и больного пациентов позволяет выявить конкретные белки, потенциально вовлеченные в развитие болезни, которые в дальнейшем могут стать мишенями для новых лекарственных препаратов. Кроме того, если такие белки уже известны, анализ протеома может использоваться как метод ранней диагностики. Анализ протеома дает больше информации, чем сравнение уровня экспресии по мРНК, так как учитывает еще и посттрансляционные модификации и альтернативный сплайсинг.
Уточнение аннотации генома [править]
Исследование протеома позволяет подтверждать наличие предсказаных при помощи поиска открытых рамок считывания белков в клетке, обнаруживать варианты альтернативного спалайсинга
Примечания [править]
- ↑ Anderson NL, Anderson NG (1998). «Proteome and proteomics: new technologies, new concepts, and new words». Electrophoresis 19 (11): 1853–61. DOI:10.1002/elps.1150191103. PMID 9740045.
- ↑ Engholm-Keller K, Larsen MR (2013). «Technologies and challenges in large-scale phosphoproteomic». Proteomics 13 (6): 910–31. DOI:10.1002/pmic.201200484. PMID 9740045.
- ↑ 3
- ↑ P. James (1997). «Protein identification in the post-genome era: the rapid rise of proteomics.». Quarterly reviews of biophysics 30 (4): 279–331. DOI:10.1017/S0033583597003399. PMID 9634650.
Ссылки [править]
- Протеомика — самая быстро развивающаяся область науки
- Протеомика против геномики, или Сломанный ключ к наследственным болезням
 |
Это заготовка статьи по биохимии. Вы можете помочь проекту, исправив и дополнив её. |
 |
Для улучшения этой статьи желательно?:
|
