Синдекан 1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Синдекан 1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ SDC1 ; CD138; SDC; SYND1; syndecan
Внешние ID OMIM: 186355 MGI1349162 HomoloGene2252 GeneCards: SDC1 Gene
Профиль экспрессии РНК
PBB GE SDC1 201286 at tn.png
PBB GE SDC1 201287 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 6382 20969
Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592
UniProt P18827 P18828
RefSeq (мРНК) NM_001006946 NM_011519
RefSeq (белок) NP_001006947 NP_035649
Локус (UCSC) Chr 2:
20.4 – 20.43 Mb
Chr 12:
8.77 – 8.79 Mb
PubMed поиск [1] [2]

Синдекан 1 (англ. syndecan 1; CD138) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Всего описано 4 белка этого семейства. Продукт гена человека SDC1.

Функции[править | править вики-текст]

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 1 участвует в клеточной пролиферации, клеточной миграции и клеточном взаимодействии с белками внеклеточного матрикса.[1]

Структура[править | править вики-текст]

Синдекан 1 несёт гепарансульфатные и хондроитинсульфатные цепи, которые обеспечивают связь цитоскелета с внеклеточным матриксом. Связывается с CDCP1.

Отщепление эктодомена приводит к образованию растворимой формы белка. Отщепление может происходить под действием гепараназы, тромбина и эпидермального фактора роста, а также при стрессе и в процессе заживлении раны.

Белок состоит из 288 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 32.5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (232 аминокислоты), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок. На внеклеточном домене находится 6 участков гликозилирования: 3 участка присоединения O-хондроитинсульфатных цепей, 2 участка присоединения O-гепарансульфатных цепей и 1 участок N-гликозилирования. Цитозольный фрагмент содержит фосфорилируемый тирозин.

Применение[править | править вики-текст]

Синдекан 1 используется в качестве маркёра плазматических клеток[2], если известно, что клетки произошли из клеток крови.[3]

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Entrez Gene: SDC1 syndecan 1.
  2. Rawstron AC (May 2006). «Immunophenotyping of plasma cells». Curr Protoc Cytom Chapter 6: Unit6.23. DOI:10.1002/0471142956.cy0623s36. PMID 18770841.
  3. O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS (February 2004). «CD138 (syndecan-1), a plasma cell marker immunohistochemical profile in hematopoietic and nonhematopoietic neoplasms». Am. J. Clin. Pathol. 121 (2): 254–63. DOI:10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L. PMID 14983940.

Литература[править | править вики-текст]

Ссылки[править | править вики-текст]