Энциклопедия элементов ДНК

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Изображение данных ENCODE в UCSC Genome Browser. Показаны несколько дорожек с информацией о регуляции экспрессии генов.

Энциклопедия элементов ДНК (англ. The Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE) — международный исследовательский консорциум, организованный и финансируемый американским Национальным институтом исследований генома человека (англ. National Human Genome Research Institute, NHGRI) в сентябре 2003 года[1][2][3]. Цель его работы — произвести полный анализ функций элементов генома человека, это один из самых важных проектов NHGRI после успешного завершения проекта «Геном человека». Все данные, полученные в ходе реализации проекта, будут опубликованы в общедоступных базах данных.

5 сентября 2012 года первые результаты проекта были опубликованы в виде 30 взаимосвязанных публикаций на сайтах журналов «Nature», «Genome Biology» и «Genome Research»[4][5]. Эти публикации показывают, что по крайней мере 80 % генома человека является биологически активным, до этого господствовало представление, что большая часть ДНК является «мусорной».

modENCODE[править | править вики-текст]

По аналогии с ENCODE проектом был также начат проект картирования функциональных элементов генома основных модельных объектов — Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans — англ. Model Organism ENCyclopedia Of DNA Elements (modENCODE). Преимущество данного проекта состоит в возможности проведения некоторых экспериментов, которые трудно или невозможно осуществить на человеке, на модельных организмах.

Основание проекта произошло в 2007 году Национальным институтом здравоохранения США (англ. National Institutes of Health (NIH). В 2010 году modENCODE консорциум представил ряд статей по аннотации и анализу распределения функциональных элементов в геноме Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans.

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Raney BJ, Cline MS, Rosenbloom KR, Dreszer TR, Learned K, Barber GP, Meyer LR, Sloan CA, Malladi VS, Roskin KM, Suh BB, Hinrichs AS, Clawson H, Zweig AS, Kirkup V, Fujita PA, Rhead B, Smith KE, Pohl A, Kuhn RM, Karolchik D, Haussler D, Kent, WJ (January 2011). «ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update)». Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D871–5. DOI:10.1093/nar/gkq1017. PMID 21037257.
  2. EGASP: the human ENCODE Genome Annotation Assessment Project. (англ.). PubMed.
  3. Клещенко Е. ДНК без мусора // The New Times. — 2012. — В. 29 (256).
  4. ENCODE project at UCSC. ENCODE Consortium. Проверено 5 сентября 2012. Архивировано из первоисточника 30 октября 2012.
  5. Walsh, Fergus. Detailed map of genome function (5 сентября 2012). Архивировано из первоисточника 6 сентября 2012. Проверено 6 сентября 2012.

Ссылки[править | править вики-текст]