| Docking@Home |
| Платформа |
BOINC |
| Объём загружаемого ПО |
7.7 МБ |
| Объём загружаемых данных задания |
1.2 МБ |
| Объём отправляемых данных задания |
75—100 КБ |
| Объём места на диске |
11 МБ |
| Используемый объём памяти |
169 МБ |
| Графический интерфейс |
есть |
| Среднее время расчёта задания |
5.5 часов |
| Deadline |
14 дней |
| Возможность использования GPU |
нет |
Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1]
Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[2] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]
Детали проекта и статистика [править]
Графика из программы-клиента
Научные достижения [править]
- ↑ 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 pdf
- ↑ Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Träff, Jesper; Achim Streit; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1
 Проекты добровольных вычислений |
| Астрономия |
|
Биология и
медицина |
|
| Когнитивные |
|
| Климат |
|
| Математика |
|
Физико-
технические |
|
| Многоцелевые |
|
| Прочие |
|
| Утилиты |
|
