Docking@Home

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Docking@Home
Docking@Home Logo.PNG
Docking atHome.png
Графика из программы-клиента
Тип

Распределённые вычисления

Операционная система

Кроссплатформенное ПО

Аппаратная платформа

x86

Последняя версия

• Charmm 34a2: 6.23

Состояние

Закрытие 23.05.2014

Сайт

docking.cis.udel.edu

Docking@Home
Платформа

BOINC

Объём загружаемого ПО

7.7 МБ

Объём загружаемых данных задания

1.2 МБ

Объём отправляемых данных задания

75—100 КБ

Объём места на диске

11 МБ

Используемый объём памяти

169 МБ

Графический интерфейс

есть

Среднее время расчёта задания

5.5 часов

Deadline

14 дней

Возможность использования GPU

нет

Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1] 7 апреля руководство Docking@Home объявило о закрытии проекта, состоявшегося 23 мая 2014 года.[2]

Докинг[править | править вики-текст]

Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[3] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]

Детали проекта и статистика[править | править вики-текст]

Научные достижения[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

См. также[править | править вики-текст]

Ссылки[править | править вики-текст]