LY6E

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
LY6E
Идентификаторы
ПсевдонимыLY6E, RIG-E, RIGE, SCA-2, SCA2, TSA-1, lymphocyte antigen 6 complex, locus E, lymphocyte antigen 6 family member E
Внешние IDOMIM: 601384 MGI: 106651 HomoloGene: 56411 GeneCards: LY6E
Расположение гена (человек)
8-я хромосома человека
Хр.8-я хромосома человека[1]
8-я хромосома человека
Расположение в геноме LY6E
Расположение в геноме LY6E
Локус8q24.3Начало143,017,982 bp[1]
Конец143,023,832 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
15-я хромосома мыши
Хр.15-я хромосома мыши[2]
15-я хромосома мыши
Расположение в геноме LY6E
Расположение в геноме LY6E
Локус15 D3|15 34.29 cMНачало74,826,900 bp[2]
Конец74,831,754 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right lobe of liver

  • stromal cell of endometrium

  • upper lobe of left lung

  • hippocampus proper
Наибольшая экспрессия в
  • superior surface of tongue

  • cardiac muscles
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

4061

17069

Ensembl

ENSG00000278032
ENSG00000160932

ENSMUSG00000022587

UniProt

Q16553

Q64253

RefSeq (мРНК)

NM_002346
NM_001127213

NM_001164036
NM_001164037
NM_001164038
NM_001164039
NM_001164040

NM_008529
NM_001374138

RefSeq (белок)

NP_001120685
NP_002337

NP_001157508
NP_001157509
NP_001157510
NP_001157511
NP_001157512

NP_032555
NP_001361067

Локус (UCSC)Chr 8: 143.02 – 143.02 MbChr 15: 74.83 – 74.83 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Лимфоцитарный антиген 6E — белок семейства лимфоцитарных антигенов LY6, GPI-заякоренный на поверхности клеток. Продукт гена LY6E[5][6][7].

Функция[править | править код]

Белок играет роль в развитии T-лимфоцитов. Действует как модулятор активности никотиновых ацетилхолиновых рецепторов (nAChR). In vitro максимально ингибирует α3β4-содержащие рецепторы.

Высокий уровень экспрессии ассоциирован с плохим прогнозом многих злокачественных опухолей[8]. Ly6E связан с возникновением резистентности к препаратам.[9]

Структура[править | править код]

LY6E состоит из 131 аминокислоты, молекулярная масса 13,5 кДа. Содержит 5 дисульфидный связей, один участок N-гликозилирования и участок связывания гликозилфосфатидилинозитола (GPI), который связывает белок с клеточной мембраной.

Тканевая локализация[править | править код]

Экспрессирован во многих тканях, наиболее высокий уровень экспрессии обнаружен в печени, почках, яичниках, селезёнке и лейкоцитах периферической крови.

Взаимодействия[править | править код]

Взаимодействует с α4-субъединицей nAChR CHRNA4 (nAChRα4).

Примечания[править | править код]

  1. ↑ 1 2 3 ENSG00000160932 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278032, ENSG00000160932 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022587 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ Capone M.C., Gorman D.M., Ching E.P., Zlotnik A. Identification through bioinformatics of cDNAs encoding human thymic shared Ag-1/stem cell Ag-2. A new member of the human Ly-6 family (англ.) // J Immunol  (англ.) (рус. : journal. — 1996. — September (vol. 157, no. 3). — P. 969—973. — PMID 8757598.
  6. ↑ Mao M., Yu M., Tong J.H., Ye J., Zhu J., Huang Q.H., Fu G., Yu L., Zhao S.Y., Waxman S., Lanotte M., Wang Z.Y., Tan J.Z., Chan S.J., Chen Z. RIG-E, a human homolog of the murine Ly-6 family, is induced by retinoic acid during the differentiation of acute promyelocytic leukemia cell (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — July (vol. 93, no. 12). — P. 5910—5914. — doi:10.1073/pnas.93.12.5910. — PMID 8650192. — PMC 39161.
  7. ↑ Entrez Gene: LY6E lymphocyte antigen 6 complex, locus E. Архивировано 5 декабря 2010 года.
  8. ↑ Luo, Linlin; McGarvey, Peter; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Gusev, Yuriy; Upadhyay, Geeta. Distinct lymphocyte antigens 6 (Ly6) family members Ly6D, Ly6E, Ly6K and Ly6H drive tumorigenesis and clinical outcome (англ.) // Oncotarget  (англ.) (рус. : journal. — 2016. — 3 February (vol. 7). — P. 11165—11193. — ISSN 1949-2553. — doi:10.18632/oncotarget.7163. — PMID 26862846. — PMC 4905465.
  9. ↑ Hossiny, Midrar A.; Luo, Linlin; Frazier, William R.; Steiner, Noriko; Gusev, Yuriy; Kallakury, Bhaskar; Glasgow, Eric; Creswell, Karen; Madhavan, Subha; Kumar, Rakesh; Upadhyay, Geeta. Ly6E/K signaling to TGF-ß promotes breast cancer progression, immune escape and drug resistance (англ.) // Cancer Research  (англ.) (рус. : journal. — American Association for Cancer Research  (англ.) (рус., 2016. — 11 April (vol. 76). — P. canres.2654.2015. — ISSN 0008-5472. — doi:10.1158/0008-5472.CAN-15-2654. Архивировано 15 апреля 2019 года.

Литература[править | править код]

  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene  (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Brakenhoff R.H., van Dijk M., Rood-Knippels E.M., Snow G.B. A gain of novel tissue specificity in the human Ly-6 gene E48 (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1997. — Vol. 159, no. 10. — P. 4879—4886. — PMID 9366413.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene  (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Shan X., Bourdeau A., Rhoton A., Wells D.E., Cohen E.H., Landgraf B.E., Palfree R.G. Characterization and mapping to human chromosome 8q24.3 of Ly-6-related gene 9804 encoding an apparent homologue of mouse TSA-1 (англ.) // J. Immunol.  (англ.) (рус. : journal. — 1998. — Vol. 160, no. 1. — P. 197—208. — PMID 9551972.
  • Kosugi A., Saitoh S., Noda S., Miyake K., Yamashita Y., Kimoto M., Ogata M., Hamaoka T. Physical and functional association between thymic shared antigen-1/stem cell antigen-2 and the T cell receptor complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 20. — P. 12301—12306. — doi:10.1074/jbc.273.20.12301. — PMID 9575182.
  • Ding L., Shevach E.M. Inhibition of the function of the FcγRIIB by a monoclonal antibody to thymic shared antigen-1, a Ly-6 family antigen (англ.) // Immunology : journal. — 2001. — Vol. 104, no. 1. — P. 28—36. — doi:10.1046/j.1365-2567.2001.01275.x. — PMID 11576217. — PMC 1783287.
  • Zammit D.J., Berzins S.P., Gill J.W., Randle-Barrett E.S., Barnett L., Koentgen F., Lambert G.W., Harvey R.P., Boyd R.L., Classon B.J. Essential Role for the Lymphostromal Plasma Membrane Ly-6 Superfamily Molecule Thymic Shared Antigen 1 in Development of the Embryonic Adrenal Gland (англ.) // Mol. Cell. Biol.  (англ.) (рус. : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 3. — P. 946—952. — doi:10.1128/MCB.22.3.946-952.2002. — PMID 11784869. — PMC 133557.
  • de Nooij-van Dalen A.G., van Dongen G.A., Smeets S.J., Nieuwenhuis E.J., Stigter-van Walsum M., Snow G.B., Brakenhoff R.H. Characterization of the human Ly-6 antigens, the newly annotated member Ly-6K included, as molecular markers for head-and-neck squamous cell carcinoma (англ.) // Int. J. Cancer  (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 103, no. 6. — P. 768—774. — doi:10.1002/ijc.10903. — PMID 12516096.
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=LY6E&oldid=125301604