PHYLIP
Материал из Википедии — свободной энциклопедии
| Тип | |
|---|---|
| Разработчик | |
| Операционная система | |
| Последняя версия |
3.69 (08.09.2009) |
| Лицензия | |
| Сайт |
PHYLIP (PHYLogeny Inference Package) — программное обеспечение для построения филогенетических деревьев. Пакет состоит из 35 программ, которые не имеют графического интерфейса. Входящие данные представлены в собственном формате PHYLIP. Файл outtree, содержащий дерево, представлен в универсальном Ньюик-формате.
С сентября 1980 года, момента первого выхода программы, имеет более 28000 официально зарегистрированных пользователей.
Существует ряд программных продуктов, предоставляющих графический интерфейс к функционалу PHYLIP. На русском языке бесплатно распространяется система UGENE, позволяющая строить деревья по алгоритмам PHYLIP, визуализировать их, а также сохранять в формате Newick.
Литература [править]
- Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach.: Felsenstein J. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach. J Mol Evol. 1981;17:368–376.
