SDF-1 (белок)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
SDF-1 (белок)
PDB 2j7z EBI.jpg
Stromal cell-derived factor-1
Обозначения
Символы SDF-1; CXCL12, SCYB12, TPAR1, IRH, PBSF
Entrez Gene 6387
HGNC 10672
OMIM 600835
PDB 2J7Z
RefSeq NM_000609
UniProt P48061
Другие данные
Локус 10-я хр., 10q11.1

SDF-1 (англ. Stromal cell-derived factor-1), или CXCL12 (англ. chemokine (C-X-C motif) ligand 12) — хемокин подсемейства CXC, который у человека закодирован геном CXCL12. SDF-1 связывается с рецепторами CXCR4 и CXCR7 и играет важную роль в эмбриональном развитии и гематопоэзе[1]. SDF-1 выступает не только в роли хемоаттрактанта: в некоторых случаях он может стимулировать пролиферацию клеток и способствовать их выживанию[2].

Структура гена и мРНК[править | править исходный текст]

Ген CXCL12 человека был впервые клонирован в 1995 году[3]. Ген располагается в длинном плече 10-й хромосомы , имеет размер более 88 000 пар нуклеотидов и содержит 5 экзонов[2].

Альтернативный сплайсинг приводит к синтезу мРНК, которые кодируют несколько изоформ SDF-1: SDF-1α (89 аминокислотных остатков), SDF-1β (93 а. о.), SDF-1γ (119 а. о.), SDF-1δ (140 а. о.), SDF-1ε (90 а. о.) и SDF-1φ (100 а. о.)[2]. Первые три экзона, входящие в состав всех вариантов мРНК одинаковы, поэтому N-концевые участки всех изоформ SDF-1 идентичны.

Распространение[править | править исходный текст]

SDF-1 синтезируется многими типами клеток. мРНК, кодирующие SDF-1α и SDF-1β, обнаруживают в сердце, почках, печени, лёгких, поджелудочной железе, плаценте, скелетных мышцах, селезёнке, лимфатических узлах, тимусе, миндалинах и костном мозге, но не в лейкоцитах периферической крови. Кроме того, в отличие от мРНК SDF-1β, мРНК SDF-1α присутствует в головном мозге. мРНК SDF-1α также синтезируется во многих эмбриональных тканях, мРНК SDF-1β встречается в чуть более узком наборе тканей эмбриона с преобладанием в селезёнке. мРНК SDF-1γ в небольших количествах присутствует во многих тканях взрослого организма с преобладанием в сердце. мРНК SDF-1δ, ε и φ детектируют в поджелудочной железе, сердце, печени, почках и некоторых других тканях взрослого организма. мРНК SDF-1δ синтезируется во многих органах эмбриона, в то время как мРНК SDF-1ε и φ присутствует только в почках[2].

Функции[править | править исходный текст]

SDF-1 выполняет множество функций как во взрослом организме, так и в ходе эмбрионального развития. В первую очередь, SDF-1 является хемоаттрактантом для клеток, которые имеют его рецепторы на мембране, например для B-лимфоцитов и гемопоэтических стволовых клеток. Клетки стромы костного мозга синтезируют SDF-1, который обеспечивает локализацию гемопоэтических клеток-предшественников в их клеточных нишах и не даёт им раньше времени покинуть костный мозг. В эмбриональном развитии SDF-1 управляет миграцией разных типов клеток и играет важную роль в формировании органов[4].

SDF-1 выступает как ростовой фактор для B-клеток и стимулирует их пролиферацию. Кроме того, SDF-1 может защищать злокачественные В-клетки от апоптоза при хроническом лимфоцитарном лейкозе[5].

Примечания[править | править исходный текст]

  1. Rankin S. M. Chemokines and adult bone marrow stem cells // Immunol Lett. — 2012. — В. 1—2. — Т. 145. — С. 47—54. — DOI:10.1016/j.imlet.2012.04.009 — PMID 22698183.
  2. 1 2 3 4 Yu L., Cecil J., Peng S. B., Schrementi J., Kovacevic S., Paul D., Su E. W., Wang J. Identification and expression of novel isoforms of human stromal cell-derived factor 1 // Gene. — 2006. — В. 374. — Т. 7. — С. 174—179. — PMID 16626895.
  3. Shirozu M., Nakano T., Inazawa J., Tashiro K., Tada H., Shinohara T., Honjo T. Structure and chromosomal localization of the human stromal cell-derived factor 1 (SDF1) gene // Genomics. — 1995. — В. 3. — Т. 28. — С. 495—500. — PMID 7490086.
  4. Lewellis S. W., Knaut H. Attractive guidance: how the chemokine SDF1/CXCL12 guides different cells to different locations // Semin Cell Dev Biol. — 2012. — В. 3. — Т. 23. — С. 333—340. — DOI:10.1016/j.semcdb.2012.03.009 — PMID 22414535.
  5. Burger J. A., Tsukada N., Burger M., Zvaifler N. J., Dell'Aquila M., Kipps T. J. Blood-derived nurse-like cells protect chronic lymphocytic leukemia B cells from spontaneous apoptosis through stromal cell-derived factor-1 // Blood. — 2000. — В. 8. — Т. 96. — С. 2655—2663. — PMID 11023495.