Гаплогруппа L0 (мтДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа L0
Тип мтДНК
Время появления 188—112,2 тыс. л. н.[1]
Место появления Южная Африка
Предковая группа Митохондриальная Ева
Субклады L0a'b'f'k, L0d
Мутации-маркеры 263!, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720[2]

Гаплогруппа L0 — в популяционной генетике — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

Гаплогруппа L0 является одной из двух ветвей от самого последнего общего предка (MRCA) для общей материнской линии человека. Гаплогруппа L0 состоит из пяти основных ветвей (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Четыре из них были первоначально классифицированы в клады L1 как L1a, L1d, L1f и L1K.

Разделение линий L0 и L1′2′3 произошло 124 тыс. л. н. (95% доверительный интервал — 97−151 тыс. л. н.)[3].

В 2014 году у образца возрастом 2330 лет из Южной Африки (St Helena Bay) была выявлена субклада L0d2c1c[4].

В 2016 году у мумии из региона Тули на севере Ботсваны (поздний железный век) выявили митохондриальную гаплогруппу L0[5].

В 2017 году у трёх человек каменного века (Ballito Bay A, Ballito Bay B и Doonside), живших ок. 2 тыс. л. н., и одного человека железного века из замка Шампань (Champagne Castle), жившей 448—282 л. н., определена субклада L0d2[6].

В 2017 году у южноафриканского образца I9133 из Faraoskop Rock Shelter возрастом 2000 л. н. определена субклада L0d1b2b1b, у образца I9134 из Kasteelberg возрастом 1310 л. н. определена субклада L0d1a1a (некалиброванные даты). Субклада L0a определена у танзанийского образца из Пембы (I1048) возрастом 1520 лет назад. У малавийских образцов определены субклады L0f (Fingira, 2400 л. н.), L0a2 (7230 л. н.), L0k2 (10000—5000 л. н.) — все с горы Хора (Hora), L0k1 (4525 л. н.), L0k2 (5400—4800 л. н.) — оба из Chencherere, L0d1c (5290 л. н.), L0d1b2b (5270 л. н.) — оба из Fingira[7].

Область в Африке, где Тишкофф и др. нашли наибольший уровень разнообразия митохондриальной гаплогруппы L0 (зелёный) и регион, где Бехар и др. постулировали самое древнее деление в человеческой популяции (светло-коричневый)

Установлено, что чаще всего гаплогруппа L0 встречается в странах Африки к югу от Сахары. Она достигает своей наивысшей частоты у койсанских народов (73 %)[8], достигая в Намиби (!Xun) 79 %, ЮАР (Khwe/!Xun) 83 % и Ботсване (!Xun) 100 %[9].

При изучении митохондриальных геномов в группе койсанов Бехар (Behar) и др. в 2008 году обнаружили, что древние геномы койсанов ограничивались митохондриальными гаплогруппами L0d и L0k, по их оценке ранней митохондриальной ветви L0k, возникших приблизительно 144 000 лет назад, что составляет около 3/4 времени появления ближайшего митохондриального родственника (митохондриальной Евы)[10]. Другие оценки относят ответвление митохондриальной линии L0k к периоду между 120 000 и 160 000 лет назад[11][12].


MRCA (мтДНК) 
   L0   
 
 
 
 

 L0a



 L0b




 L0f




 L0k




 L0d



 L1-6 
 

L1



 L2-6




Приведённое ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена и Манфреда Кайзера[2] и последующих опубликованных исследованиях.

  • Митохондриальная Ева (MRCA)
    • L0
      • L0d
        • L0d3
        • L0d1’2
          • L0d1
            • L0d1a
            • L0d1b
            • L0d1c
              • L0d1c1
          • L0d2
            • L0d2a’b
              • L0d2a
                • L0d2a1
              • L0d2b
            • L0d2c
      • L0a’b'f’k
        • L0k
          • L0k1
          • L0k2
        • L0a’b'f
          • L0f
            • L0f1
            • L0f2
              • L0f2a
              • L0f2b
          • L0a’b
            • L0a
              • L0a1
                • L0a1a
                  • L0a1a2
                • L0a1b
                  • L0a1b1
                    • L0a1b1a
                  • L0a1b2
                • L0a1c
                • L0a1d
              • L0a2
                • L0a2a
                  • L0a2a1
                    • L0a2a1a
                      • L0a2a1a1
                      • L0a2a1a2
                  • L0a2a2
                    • L0a2a2a
                • L0a2b
                  • L0a2ba
                • L0a2c
                • L0a2d
              • L0a3
              • L0a4
            • L0b

Примечания[править | править код]

  1. (2009) «Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock». The American Journal of Human Genetics 84 (6): 740–59. DOI:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMID 19500773.
  2. 1 2 (2009) «Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation». Human Mutation 30 (2): E386–94. DOI:10.1002/humu.20921. PMID 18853457.
  3. Emily H. M. Wong, Andrey Khrunin, Larissa Nichols, Dmitry Pushkarev, Denis Khokhrin, Dmitry Verbenko, Oleg Evgrafov, James Knowles, John Novembre, Svetlana Limborska, Anton Valouev. Reconstructing Genetic History of Siberian and Northeastern European Populations, 2015
  4. (2014) «First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African». Genome Biology and Evolution. DOI:10.1093/gbe/evu202. Проверено 17 April 2016.
  5. (January/February 2016) «Radiological and genetic analysis of a Late Iron Age mummy from the Tuli Block, Botswana». South African Journal of Science 112 (1/2). Проверено 26 April 2016.
  6. Carina M. Schlebusch et al.Ancient genomes from southern Africa pushes modern human divergence beyond 260,000 years ago, 2017
  7. Pontus Skoglund et al. Reconstructing Prehistoric African Population Structure, 21 September 2017
  8. (2004) «MtDNA Profile of West Africa Guineans: Towards a Better Understanding of the Senegambia Region». Annals of Human Genetics 68 (4): 340–52. DOI:10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. PMID 15225159.
  9. (2007) «History of Click-Speaking Populations of Africa Inferred from mtDNA and Y Chromosome Genetic Variation». Molecular Biology and Evolution 24 (10): 2180–95. DOI:10.1093/molbev/msm155. PMID 17656633.
  10. (May 2008) «The dawn of human matrilineal diversity». American Journal of Human Genetics 82 (5): 1130–40. DOI:10.1016/j.ajhg.2008.04.002. PMID 18439549.
  11. (June 2009) «Correcting for purifying selection: an improved human mitochondrial molecular clock». American Journal of Human Genetics 84 (6): 740–59. DOI:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMID 19500773.
  12. (December 2007) «Whole-mtDNA genome sequence analysis of ancient African lineages». Mol. Biol. Evol 24 (3): 757–68. DOI:10.1093/molbev/msl209. PMID 17194802.
  13. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African
  14. Alan G. Morris et al. First Ancient Mitochondrial Human Genome from a Pre-Pastoralist Southern African

См. также[править | править код]

Древо гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Ссылки[править | править код]

Общие сведения[править | править код]

Гаплогруппа L3[править | править код]

  • (2004) «MtDNA Profile of West Africa Guineans: Towards a Better Understanding of the Senegambia Region». Annals of Human Genetics 68 (4): 340–52. DOI:10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x. PMID 15225159. “Based on the previous knowledge of African complete sequences paraphyletic clade L1 is split into two monophyletic units L0, capturing previously defined L1a and L1d lineages, and L1 clade that includes L1b and L1c clades…”
  • (2005) «Utility of JC polyomavirus in tracing the pattern of human migrations dating to prehistoric times». Journal of General Virology 86 (5): 1315–26. DOI:10.1099/vir.0.80650-0. PMID 15831942. “The first axis of mtDNA, on the other hand, places the ancestral haplogroup L0 at the extreme left, since it gave rise to one sole lineage…”
  • (2004) «Mitochondrial DNA-like sequences in the nucleus (NUMTs): Insights into our African origins and the mechanism of foreign DNA integration». Human Mutation 23 (2): 125–33. DOI:10.1002/humu.10304. PMID 14722916. “haplogroup L0 mtDNAs, the haplogroup that we had previously concluded lies at the base of the human mtDNA. tree based on phylogenetic analysis…”
  • (2003) «African Y Chromosome and mtDNA Divergence Provides Insight into the History of Click Languages». Current Biology 13 (6): 464–73. DOI:10.1016/S0960-9822(03)00130-1. PMID 12646128.