Е-бокс

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Е-бокс (Enhancer Box) — ДНК-последовательность, найденная в некоторых промоторных областях у эукариот, которые действует в качестве связывающего сайта белка и, как было установлено, регулируют экспрессию генов в нейронах, мышцах и других тканях.[1] Спецификация такой ДНК-последовательности — CANNTG (где N может быть любой нуклеотид), с палиндромной канонической последовательностью[en]. CACGTG[2] распознаётся и связывается факторами транскрипции для инициации транскрипции генов. После того, как факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты могут связываться с промотором и облегчать транскрипцию мРНК из ДНК.

Открытие[править | править код]

E-бокс был обнаружен в сотрудничестве между Сусуму Тонегава (англ. Susumu Tonegawa) и Уолтером Гилбертом (англ. Walter Gilbert) лабораториями в 1985 году в качестве элемента управления иммуноглобулином тяжелой цепью усилителей.[3][4] Они обнаружили, что область 140 спаренных оснований в тканеспецифической транскрипции усилительного элемента было достаточно для повышения различных уровней транскрипции в различных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки, созданные определенными тканями, участвуют в этих этих усилителях, чтобы активировать наборы генов при дифференцировке клеток.

В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора обнаружили первые два связанных Е-боксом белка, E12 и E47.[5] Эти усилители иммуноглобулинов можно связать, как гетеродимеры белков через bHLH домены. В 1990 году на примере другого E-белка, ITF-2A (позднее переименованный в E2-2Alt) было обнаружено, что можно привязать иммуноглобулин к легкой цепи усилителей.[6] Два года спустя, третий E-бокс, связывающий белок, HEB, был обнаружен при обследовании кДНК библиотеки из HeLa клеток.[7] Вариант сплайсинга E2-2 был обнаружен в 1997 г. и была обнаружена ингибиция промотора мышечноспециализированными генами.[8]

С тех пор, исследователи установили, что E-бокс влияет на транскрипцию генов у некоторых эукариот и нашел связывающие факторы Е-бокса, которые идентифицируют консесуальные последовательности[en] E-Box.[9] В частности, несколько экспериментов показали, что E-бокс неотъемлемая часть транскрипционно-трансляционной, петли обратной связи, которая содержит циркадные часы .

Связывание с помощью Е-бокса[править | править код]

Связывающие белки E-боксов играют важную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат основной спираль-петля-спираль (англ. Basic helix-loop-helix) структурный мотив белка, который позволяет им связываться как димеры.[10] Этот мотив состоит из двух амфипатических α-спиралей, разделенных небольшой последовательностью аминокислот, образующих один или более β-поворотов. В гидрофобных взаимодействиях между этими α-спиралями стабилизируется димеризация. Кроме того, каждый мономер bHLH имеет основную область, которая помогает взаимному опознаванию между мономером bHLH и E-боксом (основная область взаимодействует с большим желобком ДНК). В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» или «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Относительное положение CTRR и E-Box

Связывание Е-боксом модулируется у мышей посредством Zn2+. CT-Rich регионы (CTRR), расположенные на примерно 23 нуклеотида выше Е-бокса, имеют важное значение для связывания E-боксом, трансактивации (увеличение скорости генетической экспрессии), и транскрипции циркадных генов BMAL1/NPAS2 и BMAL1/CLOCK комплексов.[11]

Специфичность связывания различных Е-боксов отражается на их функции. E-боксы с различными функциями имеют различное количество и тип факторов связывания.[12]

Консенсуальная последовательность E-бокса, как правило, — CANNTG; Однако, существуют другие Е-боксы со сходными последовательностями, называемые неканонические E-боксами. Они включают, но не ограничиваются ими:

  • CACGTT последовательность 20 bp выше гена PER2 и регулирует свою экспрессию[13]
  • CAGCTT последовательность использует MyoD как основной усилитель[14]
  • CACCTCGTGAC последовательность в проксимальной промоторной области человеческого и крысиного APOE, являющегося белковым компонентом липопротеинов.[15]

Роль в циркадных часах[править | править код]

Связь между генным регулированием Е-боксов и и циркадными часами была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен, и Хардин (Биологический факультет в Техасском университете A&M) проанализировали ритмичность периода осцилляций гена в Drosophila melanogaster.[16] Они нашли циркадный усилитель транскрипции гена в 69 bp фрагмента ДНК. В зависимости от уровней белков, усилитель повышает уровни транскрипции мРНК как в условиях LD (свет-темнота), так и DD (постоянная темнота). Усилитель был необходим для повышения уровня экспрессии гена, но не для циркадной ритмичности. Он также работает независимо как цель BMAL1/CLOCK комплекса.

E-бокс играет важную роль в циркадных генах; до сих пор, девять управляемых циркадных генов были идентифицированы: PER1, Per2, BHLHB2, BHLHB3, CRY1, DBP, Nr1d1, Nr1d2 и RORC.[17] Так как E-бокс подключен к нескольким циркадным генам, возможно, что гены и белки, связанные с ним «важные и уязвимые точки в циркадной системе».[18]

E-бокс является одним из пяти крупнейших семей транскрипционных факторов, связанных с циркадной фазой и находится в большинстве тканей.[19] Всего 320 E-боксов, управляющих генами, находятся в SCN (супрахиазматическое ядро), печени, аорты, надпочечников, WAT (белой жировой ткани), головного мозга, предсердия, желудочка, префронтальной коры, скелетных мышц, ВАТ (бурой жировой ткани) и кости свода черепа.

E-бокс, подобно CLOCK-зависимым элементам (EL-box; GGCACGAGGC) также важен в поддержании циркадной ритмичности в clock-управляющих генах . Аналогично обычному E-боксу, E-бокс, подобный clock-управляющим элементам, может также вызвать транскрипцию BMAL1/CLOCK, которая затем может привести к экспрессии в других EL-box, содержащих гены (Ank, DBP, Nr1d1).[20] Тем не менее, есть различия между EL-box и регулярным E-боксом. Подавление Dec1 и DEC2 имеет сильное влияние на E-бокс, чем на EL-box. Кроме того, Hes1, который может связываться с другой консенсуальной последовательностью (CACNAG, известной как N-box), показывает эффект подавления в EL-box, но не в E-боксе.

Оба неканонические E-бокс и подобная E-бокс последовательность, имеют решающее значение для циркадного колебания. Последние исследования в этой области формирует гипотезу, что каждый канонический или неканоническими E-бокс, следующий за подобной Е-бокс последовательностью, с интервалом 6 спаренных оснований между ними, — необходимое сочетание для циркадной транскрипции.[21] Силикоанализ также показывает, что интервал существовал и у других известных clock-управляющих генов.

Роль белков в связывании E-боксов[править | править код]

Есть несколько белков, которые связываются с E-боксом и влияют на транскрипцию генов .

Комплекс CLOCK-BMAL1[править | править код]

Этот комплекс является неотъемлемой частью циркадного цикла млекопитающих и имеет жизненно важное значение в поддержании циркадной ритмичности.

Зная, что связывание активирует транскрипцию гена в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что в DEC1 и DEC2 (транскрипционные факторы bHLH) репрессируют комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия на BMAL1 и/или конкуренции для элементов Е-бокса. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 были регуляторами молекулярных часов млекопитающих.[22]

В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса E-боксом ускоряет циркадную транскрипцию DBP и переходы хроматина (изменение от хроматина до факультативного гетерохроматина).[23] Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путём связывания с E-боксом мотивов усиливающих областей, расположенных в первом и втором интронах.

C-Myc (онкоген)[править | править код]

C-Myc , ген, кодирующий транскрипционный фактор Myc, играет важную роль в регулировании клеточной пролиферации и апоптоза млекопитающих.

В 1991 году исследователи протестировали, может ли с-Мус связываться с ДНК путём димеризации его с E12. Димеры химерного белка с E6 , способны связываться с элементом E-бокса (GGCCACGTGACC), который был опознаваем другими белками HLH.[24] Экспрессия E6 подавила функцию с-Мус, которая определяла связь между ними обоими.

В 1996 году было обнаружено, что Мус гетеродимеризуется с MAX и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с CAC (G/A)TG последовательностью Е-бокса и активировать транскрипцию.[25]

В 1998 году был сделан вывод, что функция с-Мус зависит от активации транскрипции определенных генов через элементы E-бокса.[26]

MyoD[править | править код]

MyoD происходит от семьи Mrf bHLH и его основная роль заключается в миогенезе, формировании мышечной ткани.[9] Другие члены этого семейства включают миогенин, Myf5, Myf6, Mist1 и NEX-1.

Когда MyoD связывается с мотивом CANNTG E-бокса, инициируется мышечная дифференцировка и экспрессия мышечно-специфических белков.[27] Исследователи удаляли различные части рекомбинантной MyoD и пришли к выводу, что MyoD использует включённые элементы, чтобы связать E-бокс и тетраплексную структуру промоторной последовательности мышечно-специфического гена интегрина α7 и саркомерного sMtCK .

MyoD регулирует HB-EGF (связывающий гепарин EGF-подобный фактор роста[en]), член семьи EGF (Эпидермальный фактор роста), стимулирует рост и пролиферацию клеток.[9] Он играет важную роль в развитии гепатоцеллюлярной карциномы, рака предстательной железы, рака молочной железы, рака пищевода, и рака желудка.

MyoD может также связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать свою экспрессию.[28]

MyoG[править | править код]

MyoG принадлежит семейству факторов транскрипции MyoD. Связывающий MyoG Е-бокс является необходимым для формирования нервно-мышечного синапса в качестве сигнального пути HDAC-Dach2-миогенина в экспрессии генов скелетных мышц.[29] У пациентов с симптомом атрофии мышц была выявлена пониженная экспрессией MyoG.[30]

MyoG и MyoD, как также было выявлено, обладают дифференциацией миобластов.[31] Они действуют путём трансактивации катепсином B промоторной активности и вызывают его экспрессию в мРНК.

E47[править | править код]

E47 производится путём альтернативного сплайсинга Е2А в E47 специфически кодированных bHLH экзонов. Его роль заключается в регулировании специфической экспрессии гена в ткани и дифференциации. Многие киназы были связаны с Е47 в том числе 3PK и MK2. Эти два белка образуют комплекс с Е47 и уменьшают его транскрипционную активность.[32] CKII и PKA, как также было выявлено in vitro, фосфорилируют E47.[33][34][35]

Как и в других E-боксах, связывающих белки, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-боксе. У гомозиготных нокаутных мышей E2A, развитие В-клеткок останавливается до стадии размещения DJ и В-клетки не могут созревать.[36] E47, как было выявлено, связывается как гетеродимер (с E12)[37] или как гомодимер (но слабее).[38]

Последние исследования[править | править код]

Хотя структурная основа взаимодействия BMAL1/CLOCK с E-боксом неизвестна, недавние исследования показали, что мотивы bHLH белковых доменов BMAL1/CLOCK очень похожи на bHLH других содержащих его белков, например, Myc/Max, кристализованных E-боксами.[39] Это предполагает, что необходимы специфические основания, для поддержки этого высокого сродства связывания. Кроме того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного E-бокса полностью не изучены: это, как полагают, необходимо, но не достаточно; E-боксы должны быть случайным образом разнесены друг от друга в генетической последовательности для того, чтобы происходила циркадная транскрипция. Последние исследования E-боксов была направлены на то, чтобы найти больше связываемых белков, а также открыть больше механизмов для ингибирования связывания.

Недавнее исследование Университета Упсалы в Швеции связывает комплекс AST2-Rack1 с ингибицией связывания комплекса BMAL1-CLOCK с Е-боксом.[40] Исследователи изучили роль Astakine-2 в индуцированном мелатонином циркадном регулировании у ракообразных и обнаружили, что AST2 необходим для ингибирования связывания комплекса BMAL1-CLOCK с E-боксом. Кроме того, они обнаружили, что секреция мелатонина отвечает за регулирование экспрессии AST2 и предположили, что ингибирование связывания E-бокса влияет на CLOCK у любого животного с молекулами AST2.

Исследователи из Медицинской школы университета Нанкин обнаружили, что амплитуда FBXL3 (F-бокс/богатых лейцином повторов белка) экспрессируется через E-бокс.[41] Они изучали мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петлю обратной связи в циркадных ритмах, влияя на циркадный период.

Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 исследователями Гарвардской медицинской школы обнаружило, что нуклеотиды по обе стороны от E-бокса влияют на то, какие транскрипционные факторы могут связываться с самим E-боксом.[42] Эти нуклеотиды определяют 3-D пространственное расположение нити в ДНК и ограничивают размер связывания факторов транскрипции. Исследование также показало различия в связывании матриц между естественными условиями и в пробирке (in vivo и in vitro).

Примечания[править | править код]

  1. Massari, M. E.; Murre, C. Helix-loop-helix proteins: regulators of transcription in eucaryotic organisms (англ.) // Molecular and Cellular Biology (англ.) : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 2. — P. 429—440. — DOI:10.1128/mcb.20.2.429-440.2000. — PMID 10611221.
  2. Chaudhary, J; Skinner, M K. Basic helix-loop-helix proteins can act at the E-box within the serum response element of the c-fos promoter to influence hormone-induced promoter activation in Sertoli cells (англ.) // Mol Endocrinol (англ.) : journal. — 1999. — May (vol. 13, no. 5). — P. 774—786. — DOI:10.1210/mend.13.5.0271. — PMID 10319327.
  3. Ephrussi, A; Church, GM; Tonegawa, S; Gilbert, W. B lineage-specific interactions of an immunoglobulin enhancer with cellular factors in vivo (англ.) // Science : journal. — 1985. — Vol. 227, no. 4683. — P. 134—140. — DOI:10.1126/science.3917574. — PMID 3917574.
  4. Church, GM; Ephrussi, A; Gilbert, W; Tonegawa, S. Cell-type-specific contacts to immunoglobulin enhancers in nuclei (англ.) // Nature : journal. — 1985. — Vol. 313, no. 6005. — P. 798—801. — DOI:10.1038/313798a0. — Bibcode1985Natur.313..798C. — PMID 3919308.
  5. Murre, C; Mc Caw, P S; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L Y; Cabrera, C V; Buskin, J N; Hauschka, S D; Lassar, A B ; and others; Weintraub, Harold; Baltimore, David et al. Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 1989. — August (vol. 58, no. 3). — P. 537—544. — DOI:10.1016/0092-8674(89)90434-0. — PMID 2503252.
  6. Henthorn, P; Kiledjian, M; Kadesch, T. Two distinct transcription factors that bind the immunoglobulin enhancer microE5/kappa 2 motif (англ.) // Science : journal. — 1990. — Vol. 247, no. 4941. — P. 467—470. — DOI:10.1126/science.2105528. — Bibcode1990Sci...247..467H. — PMID 2105528.
  7. Hu S-J, Olson E N; Kingston, R E. HEB (англ.) // Mol Cell Biol (англ.) : journal. — 1992. — Vol. 12, no. 3. — P. 1031—1042. — PMID 1312219.
  8. Chen, B; Lim, R W. Physical and functional interactions between the transcriptional inhibitors Id3 and ITF-2b. Evidence toward a novel mechanism regulating muscle-specific gene expression (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1997. — January (vol. 272, no. 4). — P. 2459—2463. — DOI:10.1074/jbc.272.4.2459. — PMID 8999959.
  9. 1 2 3 Mädge B.: E-Box. In: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. DOI:10.1007/SpringerReference_173452
  10. Ellenberger, T; Fass, D; Arnaud, M; Harrison, S C. Crystal structure of transcription factor E47: E-box recognition by a basic region helix-loop-helix dimer (англ.) // Genes Dev : journal. — 1994. — April (vol. 8, no. 8). — P. 970—980. — DOI:10.1101/gad.8.8.970. — PMID 7926781.
  11. Muñoz; Michelle Brewer; Ruben Baler. Modulation of BMAL/CLOCK/E-Box complex activity by a CT-rich cis-acting element (англ.) // Molecular and Cellular Endocrinology (англ.) : journal. — 2006. — Vol. 252, no. 1—2. — P. 74—81. — DOI:10.1016/j.mce.2006.03.007. — PMID 16650525.
  12. Bose; Boockfor F. R. Episodes of prolactin gene expression in GH3 cells are dependent on selective promoter binding of multiple circadian elements (англ.) // Endocrinology : journal. — 2010. — Vol. 151, no. 5. — P. 2287—2296. — DOI:10.1210/en.2009-1252. — PMID 20215567.
  13. Yoo, S.H.; Ko, C.H.; Lowrey, P.L.; Buhr, E.D.; Song, E.J.; Chang, S.; Yoo, O.J.; Yamazaki, S.; Lee, C. ; and others et al. A noncanonical E-box enhancer drives mouse Period2 circadian oscillations in vivo (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2005. — Vol. 102, no. 7. — P. 2608—2613. — DOI:10.1073/pnas.0409763102. — PMID 15699353.
  14. Zhang, X.; Patel, S. P.; McCarthy, J. J.; Rabchevsky, A. G.; Goldhamer, D. J.; Esser, K. A. A non-canonical E-box within the MyoD core enhancer is necessary for circadian expression in skeletal muscle (англ.) // Nucleic Acids Res. (англ.) : journal. — 2012. — Vol. 40, no. 8. — P. 3419—3430. — DOI:10.1093/nar/gkr1297. — PMID 22210883.
  15. Enrique, Salero; Cecilio, Giménez; Francisco, Zafra. {{{заглавие}}} (англ.) // Biochem J. (англ.) : journal. — 2003. — March (vol. 370, no. 3). — P. 979—986.
  16. Hao, H; Allen, D L; Hardin, P E. A circadian enhancer mediates PER-dependent mRNA cycling in Drosophila melanogaster (англ.) // Mol Cell Biol (англ.) : journal. — 1997. — July (vol. 17, no. 7). — P. 3687—3693. — PMID 9199302.
  17. Panda, S; Antoch MP; Miller BH; Su AI; Schook AB; Straume M; Schultz PG; Kay SA; Takahashi JS; Hogenesch J. B. Coordinated transcription of key pathways in the mouse by the circadian clock (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 2002. — May (vol. 109, no. 3). — P. 307—320. — DOI:10.1016/S0092-8674(02)00722-5. — PMID 12015981.
  18. Herzog, Erik. Neurons and networks in daily rhythms (англ.) // Nature Reviews Neuroscience : journal. — 2007. — October (vol. 8, no. 10). — P. 790—802. — DOI:10.1038/nrn2215. — PMID 17882255.
  19. Yan, Jun; Haifang Wang; Yuting Liu; Chunxuan Shao. Analysis of Gene Regulatory Networks in the Mammalian Circadian Rhythm (англ.) // PLOS Computational Biology : journal. — 2008. — October (vol. 4, no. 10). — P. e1000193. — DOI:10.1371/journal.pcbi.1000193. — Bibcode2008PLSCB...4E0193Y. — PMID 18846204.
  20. Ueshima, T; Kawamoto T; Honda KK; Noshiro M; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Kato Y. Identification of a new clock-related element EL-box involved in circadian regulation by BMAL1/CLOCK and HES1. (англ.) // Gene (англ.) : journal. — Elsevier, 2012. — December (vol. 510, no. 2). — P. 118—125. — DOI:10.1016/j.gene.2012.08.022. — PMID 22960268.
  21. Nakahata, Y; Yoshida M; Takano A; Soma H; Yamamoto T; Yasuda A; Nakatsu T; Takumi T. A direct repeat of E-box-like elements is required for cell-autonomous circadian rhythm of clock genes (англ.) // BMC Mol Biol : journal. — 2008. — January (vol. 9, no. 1). — P. 1. — DOI:10.1186/1471-2199-9-1. — PMID 18177499.
  22. Honma, S; Kawamoto, T; Takagi, Y; Fujimoto, K; Sato, F; Noshiro, M; Kato, Y; Honma, K. Dec1 and Dec2 are regulators of the mammalian molecular clock (англ.) // Nature : journal. — 2002. — Vol. 419, no. 6909. — P. 841—844. — DOI:10.1038/nature01123. — Bibcode2002Natur.419..841H. — PMID 12397359.
  23. Ripperger, J A.; Schibler, U. Rhythmic CLOCK-BMAL1 binding to multiple E-box motifs drives circadian Dbp transcription and chromatin transitions (англ.) // Nat. Genet : journal. — 2006. — March (vol. 38, no. 3). — P. 369—374. — DOI:10.1038/ng1738. — PMID 16474407.
  24. Prendergast, G C; Ziff, E B. Methylation-sensitive sequence-specific DNA binding by the c-Myc basic region (англ.) // Science : journal. — 1991. — January (vol. 251, no. 4990). — P. 186—189. — DOI:10.1126/science.1987636. — Bibcode1991Sci...251..186P. — PMID 1987636.
  25. Desbarats, L; Gaubatz, S; Eilers, M. Discrimination between different E-box-binding proteins at an endogenous target gene of c-myc (англ.) // Genes Dev : journal. — 1996. — February (vol. 10, no. 4). — P. 447—460. — DOI:10.1101/gad.10.4.447. — PMID 8600028.
  26. Xiao, Q; Claassen, G; Shi, J; Adachi, S; Seivy, J; Hann, S R. Transactivation-defective c-MycS retains the ability to regulate proliferation and apoptosis (англ.) // Genes Dev : journal. — 1998. — December (vol. 12, no. 24). — P. 3803—3808. — DOI:10.1101/gad.12.24.3803. — PMID 9869633.
  27. Shklover, J; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Yafe, A; Bengal, E; Fry, M. MyoD uses overlapping but distinct elements to bind E-box and tetraplex structures of regulatory sequences of muscle-specific genes (англ.) // Nucleic Acids Res (англ.) : journal. — 2007. — Vol. 35, no. 21. — P. 7087—7095. — DOI:10.1093/nar/gkm746. — PMID 17942416.
  28. Bergstrom, D. A.; Penn, B. H.; Strand, A.; Perry, R. L.; Rudnicki, M. A.; Tapscott, S. J. Promoter-specific regulation of MyoD binding and signal transduction cooperate to pattern gene expression (англ.) // Mol. Cell (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 9, no. 3. — P. 587—600. — DOI:10.1016/s1097-2765(02)00481-1. — PMID 11931766.
  29. Tang, H; Goldman, D. Activity-dependent gene regulation in skeletal muscle is mediated by a histone deacetylase (HDAC)-Dach2-myogenin signal transduction cascade (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2006. — Vol. 103, no. 45. — P. 16977—16982. — DOI:10.1073/pnas.0601565103. — Bibcode2006PNAS..10316977T. — PMID 17075071.
  30. Ramamoorthy, S; Donohue, M; Buck, M. Decreased Jun-D and myogenin expression in muscle wasting of human cachexia (англ.) // American Physiological Society (англ.) : journal. — 2009. — Vol. 297, no. 2. — P. E392—401. — DOI:10.1152/ajpendo.90529.2008. — PMID 19470832.
  31. Jane, D.T.; Morvay, L.C.; Koblinski, J.; Yan, S.; Saad, F.A.; Sloane, B.F. ; and others et al. Evidence that E-box promoter elements and MyoD transcription factors play a role in the induction of cathepsin B gene expression during human myoblast differentiation (англ.) // Biol. Chem. (англ.) : journal. — 2002. — Vol. 383, no. 12. — P. 1833—1844. — DOI:10.1515/BC.2002.207. — PMID 12553720.
  32. Neufeld; B.; ; Hoffmeyer, A.; Jordan, B. W. M.; Chen, P.; Dinev, D.; Ludwig, S.; Rapp, U. R. et al. Serine/Threonine Kinases 3pK and MAPK-activated Protein Kinase 2 Interact with the Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factor E47 and Repress Its Transcriptional Activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 27. — P. 20239—20242. — DOI:10.1074/jbc.C901040199. — PMID 10781029.
  33. Johnson; Wang X.; Hardy S.; Taparowsky, E. J.; Konieczny, S. F. Casein kinase II increases the transcriptional activities of MRF4 and MyoD independently of their direct phosphorylation (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 4. — P. 1604—1613. — PMID 8657135.
  34. Sloan; Shen C. P.; McCarrick-Walmsley R.; Kadesch T. Phosphorylation of E47 as a potential determinant of B-cell-specific activity (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 12. — P. 6900—6908. — PMID 8943345.
  35. Shen; Kadesch T. B-cell-specific DNA binding by an E47 homodimer (англ.) // Mol. Cell. Biol. (англ.) : journal. — 1995. — Vol. 15, no. 8. — P. 4518—4524. — PMID 7623842.
  36. Bain; ; Izon, D. J.; Amsen, D; Kruisbeek, A. M.; Weintraub, B. C.; Krop, I; Schlissel, M. S.; Feeney, A. J.; Van Roon, M. et al. E2A proteins are required for proper B cell development and initiation of immunoglobulin gene rearrangements (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 1994. — Vol. 79, no. 5. — P. 885—892. — DOI:10.1016/0092-8674(94)90077-9. — PMID 8001125.
  37. Lassar; Davis R. L.; Wright W. E.; Kadesch T.; Murre C.; Voronova A.; Baltimore D.; Weintraub H. Functional activity of myogenic HLH proteins requires hetero-oligomerization with E12/E47-like proteins in vivo (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 1991. — Vol. 66, no. 2. — P. 305—315.. — DOI:10.1016/0092-8674(91)90620-e. — PMID 1649701.
  38. Murre; McCaw P. S., Vaessin H., Caudy M., Jan L. Y., Jan Y. N., Cabrera C. V., Buskin J. N., Hauschka S. D., Lassar A. B., ; Vaessin, H; Caudy, M; Jan, L. Y.; Jan, Y. N.; Cabrera, C. V.; Buskin, J. N.; Hauschka, S. D.; Lassar, A. B. et al. Interactions between heterologous helix-loop-helix proteins generate complexes that bind specifically to a common DNA sequence (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 1989. — Vol. 58, no. 3. — P. 537—544. — DOI:10.1016/0092-8674(89)90434-0. — PMID 2503252.
  39. Muñoz, E; Brewer, M; Baler, R. Circadian Transcription: THINKING OUTSIDE THE E-BOX (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2002. — September (vol. 277, no. 39). — P. 36009—36017. — DOI:10.1074/jbc.m203909200. — PMID 12130638.
  40. Watthanasurorot, A; Saelee, N; Phongdara, A; Roytrakul, S; Jiranavichpaisal, P; Söderhäll, K; Söderhäll, I. Astakine 2—the Dark Knight Linking Melatonin to Circadian Regulation in Crustaceans (англ.) // PLOS Genetics (англ.) : journal. — 2013. — March (vol. 3, no. 3). — P. e1003361. — DOI:10.1371/journal.pgen.1003361.
  41. Shi, G; Xing, L; Liu, Z; Qu, Z; Wu, X; Dong, Z; Wang, X; Gao, X; Huang, M ; and others; Yang, L.; Liu, Y.; Ptacek, L. J.; Xu, Y. et al. Dual roles of FBXL3 in the mammalian circadian feedback loops are important for period determination and robustness of the clock (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2013. — Vol. 110, no. 12. — P. 4750—4755. — DOI:10.1073/pnas.1302560110. — Bibcode2013PNAS..110.4750S. — PMID 23471982.
  42. Gordân, R; Shen, N; Dror, I; Zhou, T; Horton, J; Rohs, R; Bulyk, ML. Genomic Regions Flanking E-Box Binding Sites Influence DNA Binding Specificity of bHLH Transcription Factors through DNA Shape (англ.) // Cell Rep (англ.) : journal. — 2013. — April (vol. 3, no. 4). — P. 1093—1104. — DOI:10.1016/j.celrep.2013.03.014. — PMID 23562153.