Эмильен Жаклен с юного возраста занимался велоспортом и биатлоном. В 15 лет он перенёс мононуклеоз, после лечения результаты в велоспорте стали значительно хуже, чем на лыжне и Эмильен сделал выбор в пользу биатлона[2].
В начале сезона 2015/2016 дебютировал на Кубке IBU в шведском Идре. На чемпионате мира среди юниоров 2016 года не смог завоевать медали, но во всех гонках попадал в топ-10. На чемпионате Европы среди юниоров в Поклюке взял серебро в гонке преследования.
В сезоне 2016/2017 выступал на Кубке IBU, где за сезон дважды поднимался на пьедестал: с серебром в гонке преследования в Валь-Мартелло и с бронзой в сингл-миксте в Риднау. Принимал участие в чемпионате Европы 2017 года в Душники-Здруй, где не смог заработать медалей, лучшим личным результатом было 10-е место в индивидуальной гонке.
В начале сезона 2017/2018 Жаклен выступил на этапе Кубка IBU в Шушене, где выиграл золото в спринте. В ноябре дебютировал на Кубке мира в Эстерсунде. На втором этапе в австрийском Хохфильцене спортсмен в составе французской эстафетной команды завоевал бронзовую медаль, которая стала для него первой на Кубке мира. Оставшись в Австрии, выступает на этапе Кубка IBU в Обертиллиахе, где берёт бронзу в спринте и серебро в сингл-миксте. После этого возвращается на Кубок мира, выступая на немецких этапах в Рупольдинге и Оберхофе, где не показывает высоких результатов. Этап Кубка IBU в немецком Арбере приносит Эмильену серебро в спринте. На чемпионате Европы 2018 берёт серебро в сингл-миксте вместе с Жюли Симон. Выступил на Олимпийских играх в Пхёнчхане, где в индивидуальной гонке был лишь 77-й, а в составе эстафеты — пятым.
Сезон 2018/2019 полностью проводит на Кубке мира. За сезон дважды поднимается на подиум в эстафетах: с бронзой в Рупольдинге и с серебром в Канморе. В личных гонках не был выше 9-й позиции.
Этап Кубка мира в Оберхофе, 2020 год
Сезон 2019/2020. 4 декабря 2019 года на этапе в Эстерсунде занял 4-е место в индивидуальной гонке, впервые попав в цветочную церемонию на Кубке мира. При этом Жаклен уступил только трём соотечественникам — Мартену Фуркаду, Симону Детьё и Кантену Фийону-Майе. На втором этапе в австрийском Хохфильцене Эмильен поднялся на свой первый пьедестал в карьере, взяв бронзу в гонке преследования. На следующем этапе в Анси становится вторым в масс-старте. В Оберхофе берёт серебро в спринте.
На чемпионате мира 2020 в Антхольце выступает успешно, выигрывая 4 медали. В спринте попадает в цветочную церемонию, заняв 6-е место. После этого выигрывает гонку преследования, обогнав на 0,4 секунды Йоханнеса Бё. Берёт бронзу в сингл-миксте с Анаис Бескон и золото в классической эстафете. Завершает чемпионат бронзой в масс-старте.
В трёх последних гонках сезона Жаклен берёт медали: серебро масс-старта в Нове-Место и две бронзы в спринте и преследовании в Контиолахти. Всего за сезон поднимался 15 раз на подиум (8 в личных гонках, 7 в эстафетах). По итогам сезона взял Малый хрустальный глобус Кубка мира, победив в зачёте гонок преследования[5].
В сезоне 2020/2021 Эмильен берет два серебра в гонках преследования на этапах в Хохфильцене, выигрывает золотые награды в эстафетах в Оберхофе и Антхольце. На чемпионате мира 2021 года в Поклюке выиграл бронзу в спринте, а в гонке преследования не допустил ни одного промаха и завоевал золото в этой дисциплине на втором чемпионате мира подряд. В последней гонке чемпионата — масс-старте допустил 5 промахов на втором рубеже, следующие рубежи Эмильен был точен, но на последнем круге перестал бороться, сбавив ход, а потом и вовсе остановился и обнял Фабьена Клода, в итоге Жаклен достиг финиша последним через 7 минут после победителя гонки[6].
В сезоне 2021/2022 на этапе в французском Анси Жаклен выиграл золото в масс-старте[7]. Это золото стало для Эмильена первым на этапе Кубка мира, до этого он был первым только на чемпионатах мира. По итогам гонки Жаклен стал лидером общего зачёта и обладателем жёлтой майки[8].
На Олимпийских играх 2022 года в Пекине Эмильен в первый день соревнований в составе смешанной эстафетной команды Франции завоевал олимпийскую серебряную медаль, после этого взял ещё одно серебро уже в классической эстафете.
После Олимпиады Жаклен ещё дважды поднимался на подиум с бронзовыми наградами: в эстафете в Контиолахти и последней гонке сезона — масс-старте в Осло. По итогам сезона занимал 5-ю позицию в общем зачёте Кубка мира.
Чемпионат мира 2023 в Оберхофе
На первом этапе сезона 2022/2023 в Контиолахтие Жаклен выиграл бронзовые награды в эстафете и гонке преследования. В Хохфильцене взял серебро в спринте и после бронзу в преследовании. На этапе в Поклюке в спринте занял 64 место, допустив 5 промахов на рубеже. После плохо проведенной гонки был отправлен на тренировочный сбор в Италию для восстановления сил и пропустил часть гонок[9]. Вернувшись на Кубок мира, занял 5-е место в масс-старте в Рупольдинге. На чемпионате мира в Оберхофе выигрывает бронзу в смешанной эстафете и золото в классической эстафете. В личных гонках Эмильен не показывает хороших результатов: став 36-м в спринте, пропускает гонку преследования, в индивидуальной показывает 37 результат, а в масс-старте финиширует 20-м. После чемпионата Жаклен объявил, что досрочно завершает сезон[10][11].
Сезон 2023/2024 начинает победой в составе смешанной эстафеты и серебром в классической эстафете в Эстерсунде. На чемпионате мира 2023 в Нове-Место выигрывает бронзу в эстафете и попадает в цветочную церемонию с 5-м местом в индивидуальной гонке. В конце февраля Эмильен вместе с Жюстин Брезаз-Буше приняли участие в шоу-гонке Skidskyttekampen в Стокгольме и заняли третье место[12]. На американском этапе в Солджер Холлоу Жаклену удается взять личные награды: серебро в спринте и бронза в преследовании. В Канморе после четвёртых мест в спринте и гонке преследования берёт бронзу масс-старта.
На первом этапе сезона 2024/2025 в Контиолахти выигрывает серебро в смешанной эстафете и два золота: в классической эстафете и спринте. На этапе в Хохфильцене зарабатывает серебро в преследовании и золото в эстафете. Этап в французском Анси приносит бронзу в гонке преследования. В Оберхофе берёт бронзу в спринте. На этапах в Рупольдинге и Антхольце берёт золото в эстафете. На этот момент французы выиграли все 4 эстафеты сезона на Кубке мира, Жаклен бежал на последнем этапе[13]. На чемпионате мира в Ленцерхайде Эмильен выигрывает своё пятое золото чемпионатов мира в смешанной эстафете. Личные гонки на чемпионате Эмильен проводит неудачно и его не включают в состав эстафеты. В начале марта Жаклен принял участие в шведской шоу-гонке Skidskyttekampen в Стокгольме, где выступил в сингл-миксте с Жюстин Брезаз-Буше и занял 5-е место в финале. На этапе Кубка мира в Нове-Место выиграл спринт.
Инд — индивидуальная гонка (КорИнд — короткая индивидуальная гонка) Пр — гонка преследования Спр — спринт МС — масс-старт Эст — эстафета См — смешанная эстафета Осм — одиночная смешанная эстафета DNS — спортсмен был заявлен, но не стартовал DNF — спортсмен стартовал, но не финишировал DSQ — спортсмен финишировал, но дисквалифицирован LAP — спортсмен по ходу гонки (для гонок преследования и масс-стартов) отстал от лидера более чем на круг и был снят с трассы — — спортсмен не участвовал в этой гонке отм — отмена гонки/этапа
x 5 + 
x 11 + 
x 14)
Медиафайлы на Викискладе
.svg){kind=small}
Пхёнчхан
Пекин
Эстерсунд
Антхольц-Антерсельва
Поклюка
Оберхоф
Нове-Место-на-Мораве
Ленцерхайде
Душники-Здруй
Преск-Айл
Раубичи
Чейле-Градистей
Отепя
.svg){kind=small}
