Коронавирус человека OC43

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Коронавирус человека OC43
TEM of coronavirus OC43.jpg
Научная классификация
Группа:
Реалм:
Царство:
Класс:
Порядок:
Подпорядок:
Cornidovirineae
Семейство:
Подсемейство:
Подрод:
Без ранга:
Коронавирус человека OC43
Международное научное название
Human coronavirus OC43
Синонимы
  • HCoV-OC43
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы

Коронавирус человека OC43[2] (англ. Human coronavirus OC43) — вирус из семейства коронавирусов, представитель вида Betacoronavirus 1, заразный для людей и крупного рогатого скота[3][4]. Оболочечный (+) одноцепочечный РНК-вирус, который проникает в клетку, связываясь с рецептором N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовой кислоты[5]. Имеет, как и другие коронавирусы из подрода Embecovirus, короткий белок-шип, так называемую гемагглютинин-эстеразу (HE)[6][3].

OC43 — один из семи известных коронавирусов, заражающих людей, ответственный за примерно 10-15 % случаев ОРВИ[7][8]. Исследователи предполагают, что все четыре коронавируса, вызывающие простуду, перешли к заражению человека в течение последних нескольких веков и при этом, вероятно, вызвали пандемии в момент перехода[9].

Вирусология[править | править код]

Идентифицированы четыре генотипа HCoV-OC43 (от A до D) с генотипом D, скорее всего возникшим в результате генетической рекомбинации. Полное секвенирование генома двух штаммов генотипов C и D и бутскан-анализ показывают признаки рекомбинации между генотипами B и C при образовании генотипа D. Из 29 идентифицированных штаммов ни один не принадлежит к более древнему генотипу A. Метод молекулярных часов с использованием шипа и нуклеокапсида относит ближайшего общего предка всех генотипов к 1950-м годам, генотип B к 1990-м годам и генотип C к концу 1990-х — началу 2000-х годов. Рекомбинантные штаммы генотипа D были обнаружены уже в 2004 году[7].

Сравнение HCoV-OC43 с ближайшим к нему штаммом вида Betacoronavirus 1, Bovine coronavirus, показало, что у них был ближайший общий предок в конце XIX века, при этом несколько методов датируют разделение примерно 1890 годом, что заставило исследователей предположить, что попадание первого штамма в человеческое население вызвало пандемию гриппа 1889—1890 годов[10][9]. HCoV-OC43, вероятно, зародился у грызунов[11].

Патогенез[править | править код]

Наряду с HCoV-229E, видом из рода Alphacoronavirus, HCoV-OC43 входит в число известных вирусов, вызывающих простуду. Оба вируса могут вызывать тяжелые инфекции нижних дыхательных путей, включая пневмонию у младенцев, пожилых людей и лиц с ослабленным иммунитетом, например, тех, кто проходит химиотерапию, и людей с ВИЧ/СПИДом[12][13][14].

Эпидемиология[править | править код]

Коронавирусы распространены по всему миру, вызывая до 20-30 % случаев простуды[9] (вирус, чаще всего вызывающий простуду — это риновирус, обнаруживаемый в 30-50 % случаев). Инфекции имеют сезонный характер, причем большинство случаев приходится на зимние месяцы[15][16][17].

Обыденность вируса в течение длительного времени не привлекала к нему внимания исследователей: подобно 229Е, он был «вирусом-сиротой», не имевшим в отличие от SARS и MERS даже «затейливого» названия. Однако, предположения о его связи с пандемией «русского гриппа» 1889—1890 годов — основанное на вышеописанном исследовании генома и сходству симптомов поражения нервной системы — возможно, свидетельствует о существенном и сравнительно быстром ослаблении патогенности коронавируса. Если Ковид-19 пойдёт по той же траектории, со временем он превратится в ещё один вирус простуды[9].

Примечания[править | править код]

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Попов Н. Н., Колотова Т. Ю. Молекулярная эволюция особо опасных эмерджентных вирусных инфекций // Аннали Мечниковського інституту. — 2016. — № 1. — С. 38—47 [38].
  3. 1 2 Taxonomy browser (Betacoronavirus 1). www.ncbi.nlm.nih.gov. Дата обращения: 29 февраля 2020.
  4. Lim, Yvonne Xinyi (2016-07-25). “Human Coronaviruses: A Review of Virus–Host Interactions”. Diseases. 4 (3): 26. DOI:10.3390/diseases4030026. PMID 28933406. See Table 1.
  5. Li, Fang (2016-09-29). “Structure, Function, and Evolution of Coronavirus Spike Proteins”. Annual Review of Virology. 3 (1): 237—261. DOI:10.1146/annurev-virology-110615-042301. PMID 27578435. BCoV S1-NTD does not recognize galactose as galectins do. Instead, it recognizes 5-N-acetyl-9-O-acetylneuraminic acid (Neu5,9Ac2) (30, 43). The same sugar receptor is also recognized by human coronavirus OC43 (43, 99). OC43 and BCoV are closely related genetically, and OC43 might have resulted from zoonotic spillover of BCoV (100, 101).
  6. Woo, Patrick C. Y. (2010-08-24). “Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis”. Viruses. 2 (8): 1804—1820. DOI:10.3390/v2081803. PMID 21994708. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
  7. 1 2 Lau, Susanna K. P. (2011). “Molecular Epidemiology of Human Coronavirus OC43 Reveals Evolution of Different Genotypes over Time and Recent Emergence of a Novel Genotype due to Natural Recombination”. Journal of Virology. 85 (21): 11325—11337. DOI:10.1128/JVI.05512-11. PMID 21849456.
  8. Gaunt, E.R. (2010). “Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method”. J Clin Microbiol. 48 (8): 2940—2947. DOI:10.1128/JCM.00636-10. PMID 20554810.
  9. 1 2 3 4 King A. An uncommon cold // New Sci. 2020;246(3280):32-35. doi:10.1016/S0262-4079(20)30862-9
  10. Vijgen, Leen (2005). “Complete Genomic Sequence of Human Coronavirus OC43: Molecular Clock Analysis Suggests a Relatively Recent Zoonotic Coronavirus Transmission Event”. Journal of Virology. 79 (3): 1595—1604. DOI:10.1128/JVI.79.3.1595-1604.2005. PMID 15650185.
  11. Fung, To Sing (2019). “Human Coronavirus: Host-Pathogen Interaction”. Annual Review of Microbiology. 73: 529—557. DOI:10.1146/annurev-micro-020518-115759. PMID 31226023.
  12. Wevers, Brigitte A. (2009). “Recently Discovered Human Coronaviruses”. Clinics in Laboratory Medicine. 29 (4): 715—724. DOI:10.1016/j.cll.2009.07.007. PMID 19892230.
  13. Manual of Clinical Microbiology. — American Society for Microbiology, 2007. — ISBN 978-1-55581-371-0.
  14. Pyrc, K. (2007). “Antiviral Strategies Against Human Coronaviruses”. Infectious Disorders Drug Targets. 7 (1): 59—66. DOI:10.2174/187152607780090757. PMID 17346212.
  15. Van Der Hoek, L (2007). “Human coronaviruses: What do they cause?”. Antiviral Therapy. 12 (4 Pt B): 651—658. PMID 17944272.
  16. Wat, Dennis (2004). “The common cold: A review of the literature”. European Journal of Internal Medicine. 15 (2): 79—88. DOI:10.1016/j.ejim.2004.01.006. PMID 15172021.
  17. Kissler, Stephen M. (April 14, 2020). “Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period”. Science: eabb5793. DOI:10.1126/science.abb5793. PMID 32291278.