Пикорнавирусы

Пикорнавирусы
Научная классификация
Домен:  Вирусы Порядок:  Picornavirales Семейство:  Пикорнавирусы
Международное научное название
Picornaviridae
Роды
см. текст
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы
Систематика на Викивидах Изображения на Викискладе NCBI   12058 EOL   8043

Пикорнави́русы (лат. Picornaviridae, от pico — маленький и rna — РНК) — семейство, объединяющее маленькие икосаэдрические вирусы высших позвоночных, содержащих одноцепочечную геномную РНК положительной полярности (то есть той же полярности, что и мРНК). Размер капсида составляет около 27—30 нм, размер генома — около 7—8 тысяч оснований. Размножение пикорнавирусов происходит в цитоплазме зараженной клетки. К пикорнавирусам относятся возбудители таких заболеваний как полиомиелит, ринит, ящур, гепатит A и др.

Строение генома

Общая схема строения геномной РНК (A) и процессинга полипротеина пикорнавирусов (B)

Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который еще до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5' — концу вирусной РНК ковалентно прикреплен маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединенный с геномом). 3' — конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5' и 3' — концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — начало, Left — левый, Right — правый) — последовательности, необходимые для репликации генома.

Белки пикорнавирусов

Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков, обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 — кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 — кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:

• 2А — негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов — это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов — сериновая протеаза.
• 2B и 3A — небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
• 2С — этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
• 3B — это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
• 3С — цистеиновая протеаза, разрезающая полипротеин.
• 3D — РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
• L — лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовирусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардиовирусов и Teschovirus лишен энзиматической активности.

Классификация

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2016 г. в семейство включают 31 род:

Aphthovirus — Афтовирусы (4 вида) Aquamavirus (1 вид) Avihepatovirus (1 вид) Avisivirus (1 вид) Cardiovirus — Кардиовирусы (3 вида) Cosavirus (1 вид) Dicipivirus (1 вид) Enterovirus — Энтеровирусы (12 видов) Erbovirus (1 вид) Gallivirus (1 вид) Hepatovirus (1 вид) Hunnivirus (1 вид) Kobuvirus (3 вида) Kunsagivirus (1 вид) Limnipivirus (3 вида) Megrivirus (1 вид)

Mischivirus (1 вид) Mosavirus (1 вид) Oscivirus (1 вид) Parechovirus — Парэховирусы (2 вида) Pasivirus (1 вид) Passerivirus (1 вид) Potamipivirus (1 вид) Rosavirus (1 вид) Sakobuvirus (1 вид) Salivirus (1 вид) Sapelovirus (3 вида) Senecavirus (1 вид) Sicinivirus (1 вид) Teschovirus (1 вид) Tremovirus (1 вид)

Литература

• Semler, B. L., and E. Wimmer. 2002. Molecular Biology of Picornaviruses. American Society for Microbiology, Washington, D.C.