Протеобактерии

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Протеобактерии
EscherichiaColi NIAID.jpg
Escherichia coli
Научная классификация
Международное научное название

Proteobacteria Stackebrandt et al., 1986

Подгруппы

α Proteobacteria Альфа-протеобактерии

β Proteobacteria Бета-протеобактерии

γ Proteobacteria Гамма-протеобактерии

δ Proteobacteria Дельта-протеобактерии

ε Proteobacteria Епсилон-протеобактерии

ζ Proteobacteria Зета-протеобактерии

Wikispecies-logo.svg
Систематика
на Викивидах
Commons-logo.svg
Изображения
на Викискладе
ITIS   956120
NCBI   1224
EOL   311

Протеобактерии (лат. Proteobacteria) — наиболее многочисленная группа бактерий — 1534 вида или примерно треть от всех известных видов бактерий[1].

Протеобактерии является весьма неоднородной группой, в эту группу включены как симбионты эукариот, так и большое число патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, фото- и хемотрофные виды бактерий, как автотрофы, так и гетеротрофы. Все протеобактерии грамотрицательны, внешняя мембрана построена из липополисахарида. Группа включает как облигатно, так и факультативно аэробные и анаэробные бактерии. Также отличны типы движения, в группу входят как бактерии, имеющие жгутики, так и неподвижные бактерии и бактерии, имеющие т. н. «скользящий» тип движения.

Морфологически группа также неоднородна: сюда входят и палочковидные бактерии, и кокки, и спиралевидные бактерии.

Карл Вёзе выделил эту группу в 1987 году и шутливо назвал её «пурпурные бактерии и их родственники»[2]. Группа была выделена на основании анализа нуклеотидных последовательностей 16S рРНК, названа в честь древнегреческого бога Протея, умевшего менять форму по собственному желанию (в названии протеобактерий отражено большое разнообразие биохимических, физиологических и морфологических свойств, присущих этой группе).

На основании правил номенклатуры бактерий, таксон протеобактерии является нелегитимным ввиду отсутствия определённого типового нижнего таксона[3].

Таксономия[править | править вики-текст]

Протеобактерии делятся на пять секций (называемых также классами), обозначенных буквами греческого алфавита- α-, β-, γ-, δ-, и ε- протеобактерии. Деление на классы также произведено на основании анализа 16S рРНК. Классы альфа, бета, дельта, и эпсилон протеобактерий являются монофилитическими.[4][5][6]. Род Acidithiobacillus — часть порядка Gammaproteobacteria был перенесён в класс Acidithiobacillia в 2013[7]. Согласно последним данным, он этот род парафилетичен по отношению к бета-ротеобактериям[8]. Относительно недавно был описан шестой класс — ζ-протеобактерии, представителем которого пока является единственный вид (выделенный в чистой культуре) — Mariprofundus ferrooxydans[9], железоокисляющий нейтрофильный хемолитоавтотроф, впервые обнаруженный около вулкана Лоихи в 1996 году.[10].

Альфа-протеобактерии[править | править вики-текст]

В класс Альфа-протеобактерии включено большое количество фототрофов, также он включает симбионтов эукариот (например Rhizobium и Agrobacterium), облигантных внутриклеточных паразитов (риккетсии, Wolbachia), уксуснокислые бактерии (Acetobacter, Gluconacetobacter), бактерии, способные к спиртовому брожению (Zymomonas mobilis), метилотрофов (Methylobacteriaceae). Предположительный предок митохондрий также происходит из этой группы.

Бета-протеобактерии[править | править вики-текст]

В этот класс входят аэробные и факультативно-анаэробные бактерии. Сюда входят и хемоорганогетеротрофы, и хемолитоавтотрофы (например нитрификаторы I стадии Nitrosomonadaceae, тионовые бактерии Thiobacillus ), фототрофные роды (Rhodocyclus и Rubrivivax). Также в эту группу включены возбудители особо опасных инфекций- Burkholderia mallei (возбудитель сапа) и Burkholderia pseudomallei (возбудитель мелиоидоза), также в эту группу входит Bordetella pertussis (возбудитель коклюша) и род Neisseria (в этот род входят возбудители менингита и гонореи).

Гамма-протеобактерии[править | править вики-текст]

В этот класс входят как фототрофные бактерии (например, Chromatium, — пурпурные серные аноксигенные бактерии), метанотрофы (например, Methylococcus capsulatus), так и бактерии, важные с клинической и научной точки зрения — семейства Enterobacteriaceae, Vibrionaceae, Pseudomonadaceae, Francisellaceae, Legionellaceae и Pasteurellaceae. В эту группу входят такие возбудители особо опасных инфекций — Yersinia pestis, Francisella tularensis, Haemophilus influenzae, Legionella pneumophila и Vibrio cholerae, а также такой важный с научной точки зрения модельный организм, как Escherichia coli.

Дельта-протеобактерии[править | править вики-текст]

Эта группа включает такие известные бактерии, как способные к скользящему движению и образующие многоклеточные плодовые тела миксобактерии, так и известные сульфат-редуцирующие бактерии (Desulfovibrio, Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfonema) и серобактерии (Desulfuromonas). Сюда также входят анаэробные железобактерии (Geobacter). Сюда также входят известные бактерии-хищники рода Bdellovibrio, облигатные внутриклеточные бактерии рода Lawsonia, хемолитотрофы рода hippea, способные использовать серу и водород в качестве источника энергии. В класс входят как аэробные, так и анаэробные бактерии, факультативные анаэробы не известны в этом классе. Большинство анаэробов способно использовать неорганические акцепторы электрона, осуществляя таким образом анаэробное дыхание. Представители класса играют важную роль в круговороте элементов в природе.

Эпсилон-протеобактерия[править | править вики-текст]

Сюда входит лишь один порядок Campylobacterales с двумя семействами Campylobacteraceae и Helicobacteraceae. Сюда входит важный с геохимической точки зрения род Sulfurospirillum[11], так и возбудитель язвы человека Helicobacter pylori. Также сюда входят симбионты пищеварительного тракта жвачных животных Wolinella.

Филогения протеобактерий

Acidobacteria




Deltaproteobacteria




Epsilonproteobacteria




Alphaproteobacteria




Zetaproteobacteria




Gammaproteobacteria



Hetaproteobacteria (syn. "Piproteobacteria")



Betaproteobacteria







См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. The Earth Life Web, The Proteobacteria
  2. (1987) «Bacterial evolution». Microbiological reviews 51 (2): 221–71. PMID 2439888.
  3. Nomenclatural type of orders: corrections necessary according to Rules 15 and 21a of the Bacteriological Code (1990 Revision), and designation of appropriate nomenclatural typ …
  4. Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria. — Springer, 2005. — ISBN 978-0-387-95040-2.
  5. (2006) «Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life». Science 311 (5765): 1283–7. DOI:10.1126/science.1123061. PMID 16513982.
  6. (2010) «Update of the All-Species Living Tree Project based on 16S and 23S rRNA sequence analyses». Systematic and applied microbiology 33 (6): 291–9. DOI:10.1016/j.syapm.2010.08.001. PMID 20817437..
  7. (2013) «Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria». International journal of systematic and evolutionary microbiology 63 (Pt 8): 2901–6. DOI:10.1099/ijs.0.049270-0. PMID 23334881.
  8. (2010) «Phylogeny of Gammaproteobacteria». Journal of Bacteriology 192 (9): 2305–14. DOI:10.1128/JB.01480-09. PMID 20207755.
  9. mariprofundus entry in LPSN [ (1997) «List of Bacterial Names with Standing in Nomenclature: a folder available on the Internet». Int J Syst Bacteriol 47 (2): 590–2. DOI:10.1099/00207713-47-2-590. ISSN 0020-7713. PMID 9103655.]
  10. Emerson D., Moyer C. L. Neutrophilic Fe-oxidizing bacteria are abundant at the Loihi Seamount hydrothermal vents and play a major role in Fe oxide deposition. (англ.) // Applied and environmental microbiology. — 2002. — Vol. 68. — № 6. — P. 3085–3093. — PMID 12039770. исправить
  11. The versatile [epsi]-proteobacteria: key players in sulphidic habitats : Abstract : Nature Reviews Microbiology

Ссылки[править | править вики-текст]