Сайт рестрикции
Сайт рестрикции (участок узнавания) — короткая последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК, которая распознаётся ферментом эндонуклеазой рестрикции-модификации (рестриктазой). Рестриктаза связывается с молекулой ДНК в точке расположения сайта рестрикции и перерезает цепочку нуклеотидов внутри сайта или в непосредственной близости от него.
Ферменты рестрикции выработаны бактериями в процессе эволюции с целью разрушения чужеродной ДНК, способной проникнуть внутрь клетки и вызвать её трансформацию. Размер сайта рестрикции различных рестриктаз составляет, как правило, 4-6 нуклеотидов. Количество оснований в сайте накладывает прямой отпечаток на его частоту в геноме. (можно подсчитать исходя из предположения о равенстве частоты встреч азотистых оснований) Сайты обычно палиндромичны, то есть читаются одинаково с обеих сторон, или содержат инвертированные повторы. Сайты рестрикции в ДНК самой бактерии замаскированы посредством метилирования остатков А и С[1]. Это осуществляет ДНК-метилтрансфераза - модифицирующая часть комплекса рестрикции-модификации.
Например, фермент рестрикции EcoRI[англ.] распознаёт последовательность GAATTC с инвертированным повтором и перерезает цепочку между нуклеотидами G и A, оставляя на концах перекрывающиеся участки AATT[1].
Всего у бактерий различных видов найдено несколько сотен ферментов рестрикции. Ниже на рисунках приведены сайты рестрикции и линии разреза цепочки нуклеотидов для нескольких известных рестриктаз[1].
Сайты рестрикции важны для упрощения внедрения целевых генов в различные конструкции, такие как плазмиды. Характерной чертой использующихся в генетической инженерии плазмид является наличие полилинкера - короткого сегмента с множественными (около 20) различными сайтами рестрикции.
См. также
[править | править код]Ссылки
[править | править код]- Томилова Ю. Э., Дегтярев С. Х. Эндонуклеазы рестрикции и их применение.
- Рестриктазы типа II: узнавание сайтов рестрикции.
Примечания
[править | править код]- ↑ 1 2 3 Албертс Б., Брей Д., Льюис Дж., Рэфф М, Роберте К., Уотсон Дж. Молекулярная биология клетки: В 3-х т. — М.: Мир, 1994. — Т. 1. — 517 с. — ISBN 5-03-001985-5.. Архивировано 20 ноября 2010 года.