Клуб был основан 15 июля 2010 года[1]. Название клуба «Саксан» с гагаузского языка переводится как «Сорока». В первый же год существования команда завоевала первое место в Дивизионе «Б» (Юг), обеспечив тем самым себе право выступать в Дивизионе «А». В сезоне 2013/14 «Саксан» досрочно, за четыре тура до конца чемпионата, занял первое место в Дивизионе «А», это позволило клубу выступать в высшей лиге страны — Национальном дивизионе[3]. Дебютный сезон в высшей лиге Молдавии команда закончила на 5-м месте[4]. 29 мая стало известно, что главным тренером назначен Влад Гоян, контракт с которым подписан на один год[5]. Из-за расформирования клуба «Тирасполь» команда приняла участие в первом квалификационном раунде Лиги Европы 2015/16. Оба матча против кипрского «Аполлона» молдавский клуб проиграл со счётом 0:2[6].
В чемпионате Молдавии сезона 2015/16 годов «Саксан» занял последнее 10-е место, но провёл и следующий сезон в высшем дивизионе, по итогам которого занял предпоследнее 10-е место и добровольно перешёл в лигу ниже (Дивизион «А»). В сезоне-2017 команда заняла предпоследнее 12-е место уже в Дивизионе «А». После сезона-2018 (6-е место в Дивизионе «А») клуб был исключён из лиги.
3 января2013 года гагаузский исполнитель Виталий Манжул представил окончательную версию гимна, который он написал специально для футбольного клуба «Саксан»[8].
Информация должна быть проверяема, иначе она может быть поставлена под сомнение и удалена. Вы можете отредактировать эту статью, добавив ссылки на авторитетные источники. Эта отметка установлена 19 мая 2014 года.
Пожалуйста, после исправления проблемы исключите её из списка параметров. После устранения всех недостатков этот шаблон может быть удалён любым участником.