Сенсорный родопсин II

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Димер комплекса сенсорного родопсина II и белка-трансдьюсера. Сенсорный родопсин изображен голубым. Вид в плоскости мембраны.

Се́нсорный родопси́н II (фо́бородопсин) — фотоактивный семиспиральный трансмембранный белок архей, служит им для отрицательного фототаксиса и относится к тому же семейству белков, что и бактериородопсин.

Структура[править | править вики-текст]

В состав сенсорного родопсина II археи Natronomonas pharaonis входят 239 аминокислотных остатков, организованных в семь трансмембранных спиралей, и ретиналь, ковалентно связанный с лизином 205 посредством Шиффова основания.[1][2] Последовательность сенсорного родопсина II схожа с последовательностью бактериородопсина на 27 % (до 80 % в области ретиналь-содержащего кармана). Посредством точечных мутаций можно заставить действовать сенсорный родопсин в роли бактериородопсина, и наоборот.

Функция[править | править вики-текст]

В мембране СРII образует комплекс с белком-трансдьюсером (передатчиком сигнала), и комплексы димеризуются. При поглощении фотона (максимум поглощения СРII приходится на 500 нм) сигнал с белка передается на трансдьюсер, и далее через киназы на жгутик. Таким образом бактерия может избегать вредный для неё около-УФ свет.

На данный момент известны структуры для основного состояния отдельного СРII в комплексе с трансдьюсером и промежуточных состояний для комплекса, при этом механизм функционирования белка также не выяснен до конца.[3][4]

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Grote M, Engelhard M, Hegemann P (2014) "Of ion pumps, sensors and channels - perspectives on microbial rhodopsins between science and history", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):533-45. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.08.006
  2. Spudich JL, Sineshchekov OA, Govorunova EG (2014) "Mechanism divergence in microbial rhodopsins", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):546-52. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.06.006
  3. Grote M, Engelhard M, Hegemann P (2014) "Of ion pumps, sensors and channels - perspectives on microbial rhodopsins between science and history", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):533-45. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.08.006
  4. Spudich JL, Sineshchekov OA, Govorunova EG (2014) "Mechanism divergence in microbial rhodopsins", Biochimica et Biophysica Acta 1837(5):546-52. doi: 10.1016/j.bbabio.2013.06.006