Малые интерферирующие РНК: различия между версиями

Перейти к навигации Перейти к поиску
=== Побочные эффекты ===
Сбой цели --- это еще одна трудность при использовании миРНК как инструмента для достидения нокдауна генов. Гены с неполной комплементарностью блокируются миРНК (т. е. фаутически миРНК действует как микроРНК), что приводит к трудностям в интерпретации результатов опытов и сожержит риск токсичности. Однако, этого можно избежать, организуя соответствующие контрольные опыты, и создавая алгоритмы конструирования миРНК, которые приводят к миРНК, не дающим сбоев цели.
Затем можно проанализировать экспрессию генов по всему геному, например, при помощи метода микромассивов ({{lang-en|microarray technology}}), чтобы проверить отсутствие сбоев цели и поизвести дальнейшую настройку алгиритмов. В работестатье сотрудников лаборатории доктора Хворовой за 2006 годагод рассматриваются фрагменты длиной 6 или 7 пар оснований, начинающиеся с позиции 2, в миРНК, соответствующей участку 3’UTR в генах, где происходит потеря цели<ref>{{cite journal |author=Birmingham A, Anderson E, Reynolds A, Ilsley-Tyree D, Leake D, Fedorov Y, Baskerville S, Maksimova E, Robinson K, Karpilow J, Marshall W, Khvorova A |title=3' UTR seed matches, but not overall identity, are associated with RNAi off-targets |journal=Nat Methods |volume=3 |issue=3 |pages=199–204 |year=2006 |doi= 10.1038/nmeth854 |pmid=16489337}}</ref>.
A 2006 paper from the laboratory of Dr. Khvorova implicates 6- or 7-basepair-long stretches from position 2 onward in the siRNA matching with 3’UTR regions in off-targeted genes.<ref>{{cite journal |author=Birmingham A, Anderson E, Reynolds A, Ilsley-Tyree D, Leake D, Fedorov Y, Baskerville S, Maksimova E, Robinson K, Karpilow J, Marshall W, Khvorova A |title=3' UTR seed matches, but not overall identity, are associated with RNAi off-targets |journal=Nat Methods |volume=3 |issue=3 |pages=199–204 |year=2006 |doi= 10.1038/nmeth854 |pmid=16489337}}</ref>
 
== Перспективы применения в терапии ==

Навигация