Argonaute

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск

Argonaute — белки, которые являются каталитическими компонентами RISC (RNA-induced silencing complex) белкового комплекса, обеспечивающего сайленсинг генов по механизму РНК-интерференции (RNAi).

Белки Argonaute связывают малые интерферирующие РНК (siRNA) и имеют эндонуклеазную активность по отношению к мРНК, комплементарных связанному фрагменту siRNA.[1]

Молекулярные механизмы связывания РНК белками Argonaute установлены при помощи рентгеноструктурной кристаллографии РНК-связывающего домена. Фосфорилированный 5' конец цепи РНК попадает в консервативный основный карман и образует контакты через двухвалентные катионы (например, Mg++) и путем ароматического стэкинга между 5' нуклеотидом в siRNA и консервативным остатком тирозина. Этот сайт, по-видимому, образует «сайт нуклеации» для связывания siRNA с её мишенью мРНК.[2]

У эукариот, белки Argonaute идентифицированы в высоких концентрациях в районах цитоплазмы клеток, известных как цитоплазматические тельца, в которых разрушаются мРНК.[3]

Белки Argonaute также участвуют в образовании и регуляции активности микроРНК.

1) Ago2 разрезает пре-микроРНК и образует дополнительный предшественник (ac-pre-miRNA);[4] 2) Ago2 также входит в RISC и опосредует связывание микроРНК с 3'НТР, соответствующей мРНК и ингибирует трансляцию (в некоторых случаях - вызывает деаденилирование и деградацию мРНК). Ago2 взаимодействует с TRBP и Dicer (который процессирует пре-миРНК в миРНК) и образует вместе с ними тройной комплекс, который также связывает миРНК, на базе которого происходит дальнейшая сборка RISC путём присоединения других белков.[5]

Семейство белков Argonaute представлено среди эукариот, некоторых архей и даже бактерий, например, Aquifex aeolicus. На основании сравнения геномов, семейство Argonaute, по-видимому, произошло от ферментов инициации трансляции.[6]

Ссылки[править | править исходный текст]

  1. Rand TA, Petersen S, Du F, Wang X. (2005). Argonaute2 cleaves the anti-guide strand of siRNA during RISC activation. Cell 123(4):621-9.
  2. Ma J, Yuan Y, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel D (2005). «Structural basis for 5'-end-specific recognition of guide RNA by the A. fulgidus Piwi protein». Nature 434 (7033): 666–70. DOI:10.1038/nature03514. PMID 15800629.
  3. Sen GL, Blau HM. (2005). Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies. Nat Cell Biol 7(6):633-6.
  4. Diederichs S., Haber D. A. Dual Role for Argonautes in MicroRNA Processing and Posttranscriptional Regulation of MicroRNA Expression (December 2007) Cell, Volume 131, Issue 6, 14 1097-1108 PMID: 18083100
  5. Chendrimada TP, Gregory RI, Kumaraswamy E, Norman J, Cooch N, Nishikura K, Shiekhattar R. (Aug 2005) TRBP recruits the Dicer complex to Ago2 for microRNA processing and gene silencing. Nature, 4;436(7051):740-4.PMID: 15973356
  6. Anantharaman V, Koonin E, Aravind L (2002). «Comparative genomics and evolution of proteins involved in RNA metabolism». Nucleic Acids Res 30 (7): 1427–64. DOI:10.1093/nar/30.7.1427. PMID 11917006.