HAVCR1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HAVCR1
Доступные структуры
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
Символы HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, hepatitis A virus cellular receptor 1
Внешние IDs OMIM: 606518 HomoloGene: 134424 GeneCards: 26762
Профиль экспрессии РНК
PBB GE HAVCR1 207052 at fs.png
Больше информации
Ортологи
Виды Человек Мышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001099414
NM_001173393
NM_001308156
NM_012206

n/a

RefSeq (белок)

NP_001166864
NP_001295085
NP_036338

n/a

Локус (UCSC) Chr 5: 157.03 – 157.06 Mb n/a
Поиск PubMed [1] n/a
Викиданные
Просмотр/Править (Человек)

HAVCR1, или TIM-1 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 1, или англ. T-cell immunoglobulin and mucin domain 1 (TIM-1) ) — мембранный белок, продукт гена HAVCR1[1][2][3]. Член семейства белков TIM (T cell transmembrane, immunoglobulin, and mucin), которые играют критическую роль в регулировании активности иммунных клеток, в особенности в ответ на вирусную инфекцию. Семейство включает 8 генов (от TIM-1 до TIM-8), из которых у человека присутствуют 3: TIM-1, TIM-3 и TIM-4. Кроме этого, белок участвует в процессах аллергического ответа, астмы и толерантности к транспланту.

Функции[править | править код]

Белки семейства TIM являются гликопротеинами клеточной поверхности, в структуре которых присутствуют иммуноглобулино-подобный домен, муциновый домен определённой длины, один трансмембранный домен и короткий C-концевой цитоплазматический фрагмент.

TIM-1 экспрессирован преимущественно на клетках Th2 и действует как стимулирующая молекула в процессе активации T-лимфоцитов[4]. TIM-3 находится на клетках Th1 и Tc1 и функционирует как ингибиторный белок, который опосредует апоптоз этих клеток[5]. TIM-4 представлен на антигенпредставляющих клетках и модулирует фагоцитоз апоптозных клетеок за счёт взаимодействия с фосфатидилсерином клеточной мембраны апоптозных клеток[6].

Структура[править | править код]

Белок состоит из 364 аминокислот, молекулярная масса — 39,25 кДа. Это мембранный белок, содержит единственный трансмембранный участок. Содержит иммуноглобулиновый домен V-типа и домен с 12 аминокислотными повторами (V-P-T-T-T-T).

Примечания[править | править код]

  1. Feigelstock D., Thompson P., Mattoo P., Zhang Y., Kaplan G. G. The human homolog of HAVcr-1 codes for a hepatitis A virus cellular receptor (англ.) // Journal of Virology (англ.) : journal. — 1998. — August (vol. 72, no. 8). — P. 6621—6628. — PMID 9658108.
  2. McIntire J. J., Umetsu S. E., Akbari O., Potter M., Kuchroo V. K., Barsh G. S., Freeman G. J., Umetsu D. T., DeKruyff R. H. Identification of Tapr (an airway hyperreactivity regulatory locus) and the linked Tim gene family (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2001. — November (vol. 2, no. 12). — P. 1109—1116. — DOI:10.1038/ni739. — PMID 11725301.
  3. Entrez Gene: HAVCR1 hepatitis A virus cellular receptor 1.
  4. Umetsu S. E., Lee W. L., McIntire J. J., Downey L., Sanjanwala B., Akbari O., Berry G. J., Nagumo H., Freeman G. J., Umetsu D. T., DeKruyff R. H. TIM-1 induces T cell activation and inhibits the development of peripheral tolerance (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2005. — May (vol. 6, no. 5). — P. 447—454. — DOI:10.1038/ni1186. — PMID 15793575.
  5. Zhu C., Anderson A. C., Schubart A., Xiong H., Imitola J., Khoury S. J., Zheng X. X., Strom T. B., Kuchroo V. K. The Tim-3 ligand galectin-9 negatively regulates T helper type 1 immunity (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2005. — December (vol. 6, no. 12). — P. 1245—1252. — DOI:10.1038/ni1271. — PMID 16286920.
  6. Kobayashi N., Karisola P., Peña-Cruz V., Dorfman D. M., Jinushi M., Umetsu S. E., Butte M. J., Nagumo H., Chernova I., Zhu B., Sharpe A. H., Ito S., Dranoff G., Kaplan G. G., Casasnovas J. M., Umetsu D. T., Dekruyff R. H., Freeman G. J. TIM-1 and TIM-4 glycoproteins bind phosphatidylserine and mediate uptake of apoptotic cells (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press (англ.), 2007. — December (vol. 27, no. 6). — P. 927—940. — DOI:10.1016/j.immuni.2007.11.011. — PMID 18082433.

Литература[править | править код]

  • Kumanogoh A., Kikutani H. Immune semaphorins: a new area of semaphorin research (англ.) // Journal of Cell Science (англ.) : journal. — The Company of Biologists (англ.), 2004. — Vol. 116, no. Pt 17. — P. 3463—3470. — DOI:10.1242/jcs.00674. — PMID 12893810.
  • McIntire J. J., Umetsu D. T., DeKruyff R. H. TIM-1, a novel allergy and asthma susceptibility gene (англ.) // Springer Seminars in Immunopathology : journal. — 2004. — Vol. 25, no. 3—4. — P. 335—348. — DOI:10.1007/s00281-003-0141-3. — PMID 15007635.
  • Thompson P., Lu J., Kaplan G. G. The Cys-rich region of hepatitis A virus cellular receptor 1 is required for binding of hepatitis A virus and protective monoclonal antibody 190/4 (англ.) // Journal of Virology (англ.) : journal. — 1998. — Vol. 72, no. 5. — P. 3751—3761. — PMID 9557657.
  • Bailly V., Zhang Z., Meier W., Cate R., Sanicola M., Bonventre J. V. Shedding of kidney injury molecule-1, a putative adhesion protein involved in renal regeneration (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 42. — P. 39739—39748. — DOI:10.1074/jbc.M200562200. — PMID 12138159.
  • Noguchi E., Nakayama J., Kamioka M., Ichikawa K., Shibasaki M., Arinami T. Insertion/deletion coding polymorphisms in hHAVcr-1 are not associated with atopic asthma in the Japanese population (англ.) // Genes and Immunity (англ.) : journal. — 2003. — Vol. 4, no. 2. — P. 170—173. — DOI:10.1038/sj.gene.6363935. — PMID 12618867.
  • McIntire J. J., Umetsu S. E., Macaubas C., Hoyte E. G., Cinnioglu C., Cavalli-Sforza L. L., Barsh G. S., Hallmayer J. F., Underhill P. A., Risch N. J., Freeman G. J., DeKruyff R. H., Umetsu D. T. Immunology: hepatitis A virus link to atopic disease (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6958. — P. 576. — DOI:10.1038/425576a. — Bibcode2003Natur.425..576M. — PMID 14534576.
  • Chae S. C., Song J. H., Heo J. C., Lee Y. C., Kim J. W., Chung H. T. Molecular variations in the promoter and coding regions of human Tim-1 gene and their association in Koreans with asthma (англ.) // Human Immunology (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 64, no. 12. — P. 1177—1182. — DOI:10.1016/j.humimm.2003.09.011. — PMID 14630400.
  • Chae S. C., Song J. H., Lee Y. C., Kim J. W., Chung H. T. The association of the exon 4 variations of Tim-1 gene with allergic diseases in a Korean population (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 312, no. 2. — P. 346—350. — DOI:10.1016/j.bbrc.2003.10.125. — PMID 14637143.
  • Vilà M. R., Kaplan G. G., Feigelstock D., Nadal M., Morote J., Porta R., Bellmunt J., Meseguer A. Hepatitis A virus receptor blocks cell differentiation and is overexpressed in clear cell renal cell carcinoma (англ.) // Kidney International (англ.) : journal. — 2004. — Vol. 65, no. 5. — P. 1761—1773. — DOI:10.1111/j.1523-1755.2004.00601.x. — PMID 15086915.
  • Mesri M., Smithson G., Ghatpande A., Chapoval A., Shenoy S., Boldog F., Hackett C., Pena C. E., Burgess C., Bendele A., Shimkets R. A., Starling G. C. Inhibition of in vitro and in vivo T cell responses by recombinant human Tim-1 extracellular domain proteins (англ.) // International Immunology (англ.) : journal. — 2006. — Vol. 18, no. 3. — P. 473—484. — DOI:10.1093/intimm/dxh388. — PMID 16481347.
  • Lim J., Hao T., Shaw C., Patel A. J., Szabó G., Rual J. F., Fisk C. J., Li N., Smolyar A., Hill D. E., Barabási A. L., Vidal M., Zoghbi H. Y. A protein-protein interaction network for human inherited ataxias and disorders of Purkinje cell degeneration (англ.) // Cell : journal. — Cell Press (англ.), 2006. — Vol. 125, no. 4. — P. 801—814. — DOI:10.1016/j.cell.2006.03.032. — PMID 16713569.
  • Kotsis F., Nitschke R., Boehlke C., Bashkurov M., Walz G., Kuehn E. W. Ciliary calcium signaling is modulated by kidney injury molecule-1 (Kim1) (англ.) // Pflügers Archiv (англ.) : journal. — 2007. — Vol. 453, no. 6. — P. 819—829. — DOI:10.1007/s00424-006-0168-0. — PMID 17205356.