Planctomycetes

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Planctomycetes
Научная классификация
Международное научное название

Planctomycetes Garrity and Holt 2001

Синонимы
  • Planctobacteria Cavalier-Smith 2002
Wikispecies-logo.svg
Систематика
на Викивидах
Commons-logo.svg
Поиск изображений
на Викискладе
NCBI   203682
EOL   7716

Planctomycetes  (лат.) — тип бактерий, представители которого обитают в пресных и солёных водах[1][2], являются важными членами почвенных сообществ микроорганизмов[3], детектируются в торфяных сфагновых болотах[4], обитают также в анаэробных источниках, богатых соединениями серы[5]. Имеют уникальное для бактерий строение цитоплазмы и клеточной стенки, размножаются почкованием и имеют стебелёк, предназначенный для заякоривания на субстрате. Изучение представителей отдела представляет интерес для изучения эволюции и экологии микроорганизмов[6].

Строение[править | править вики-текст]

Уникальной особенностью представителей типа Planctomycetes является отсутствие пептидогликана в клеточной стенке, вместо которого присутствует гликопротеин, содержащий много остатков глутаминовой кислоты. В мембране обнаружены гопаноиды — вещества, подобные стероидам, укрепляющие плазматическую мембрану и прежде обнаруженные лишь у аэробных микроорганизмов[7]. Второй уникальной особенностью типа является наличие компартментов в цитоплазме, ограниченных мембраной[8] и ограничение нуклеоида двойной мебраной — особенность, характерная для эукариот и нехарактерная для прокариот[9]. Компартмент, содержащий рибосомы и белки называется пиреоплазма или рибоплазма, безрибосомный компартмент называется парифоплазма[10].

Геном[править | править вики-текст]

Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей 16S рРНК показывает, что тип имеет высокий уровень гомологии с тремя другими типами — Verrucomicrobia, Chlamydiae и Lentisphaerae, образуя надтип[11]. Изучение геномов представителей типа Planctomycetes позволяет пролить свет на происхождение метаногенеза и метилотрофии[12]. Уникальной особенностью геномов представителей типа Planctomycetes является отсутствие оперонной структуры генов некоторых важных метаболических путей[10], что также не характерно для прокариот. Сравнение нуклеотидных последовательностей некоторых генов показывает больший уровень гомологии с таковыми у эукариот — например ген Gemmata obscuriglobus проявляет большой уровень гомологии с геном, кодирующим белок интегрин-альфа-V, играющим большую роль в трансмембранной сигнальной трансдукции у эукариот[13].

Жизненный цикл[править | править вики-текст]

Имеется чередование между неподвижными сидячими формами и формами, подвижными за счёт наличия жгутиков. Сидячие клетки при почковании образуют подвижные клетки с жгутиками, которые затем прикрепляются к субстрату и сами становятся сидячими, продуцируя при помощи почкования новые подвижные клетки.

Систематика[править | править вики-текст]

На май 2015 года систематика типа Planctomycetes следующая[14]:

Ещё ряд родов-кандидатов имеет неопределённое положение в типе:

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. The ISME Journal — Fosmids of novel marine Planctomycetes from the Namibian and Oregon coast upwelling systems and their cross-comparison with planctomycete genomes
  2. Monitoring a widespread bacterial group: in situ detection of planctomycetes with 16S rRNA-targeted probes — Neef et al. 144 (12): 3257 — Microbiology
  3. Diversity of Planctomycetes in Soil in Relation to Soil History and Environmental Heterogeneity — Buckley et al. 72 (7): 4522 — Applied and Environmental Microbiology
  4. Detection of representatives of the Planctomycetes in Sphagnum peat bogs by molecular and cultivation approaches
  5. Phylogenetic and Metabolic Diversity of Planctomycetes from Anaerobic, Sulfide- and Sulfur-Rich Zodletone Spring, Oklahoma — Elshahed et al. 73 (15): 4707 — Applied and Enviro …
  6. http://www.wfcc.info/NEWSLETTER/newsletter38/a1.pdf
  7. ScienceDirect — Organic Geochemistry: The occurrence of hopanoids in planctomycetes: implications for the sedimentary biomarker record
  8. Cell compartmentalisation in planctomycetes: novel types of structural organisation for the bacterial cell
  9. INTRACELLULAR COMPARTMENTATION IN PLANCTOMYCETES — Annual Review of Microbiology, 59(1):299 — Abstract
  10. 1 2 Complete genome sequence of the marine planctomycete Pirellula sp. strain 1 — PNAS
  11. The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae an… [Curr Opin Biotechnol. 2006] — PubMed result
  12. The Enigmatic Planctomycetes May Hold a Key to the Origins of Methanogenesis and Methylotrophy — Chistoserdova et al. 21 (7): 1234 — Molecular Biology and Evolution
  13. Cheryl Jenkins, Vishram Kedar, and John A. Fuerst (2002). Gene discovery within the planctomycete division of the domain Bacteria. Genome Biology 3 (6): research0031.1-0031.11.
  14. LPSN: Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria)

Ссылки[править | править вики-текст]

Научные ссылки[править | править вики-текст]


Научные базы данных[править | править вики-текст]