Rosetta@home

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Rosetta@home
Rosetta@home - логотип.gif
Тип

Добровольные вычисления

Разработчик

Baker laboratory, Вашингтонский университет, Rosetta Commons

Операционная система

Кроссплатформенное программное обеспечение

Первый выпуск

6 октября 2005

Аппаратная платформа

BOINC

Последняя версия

Rosetta Mini: 3.71[1] (20 января 2016)

Состояние

Активное

Лицензия

Free for academic and non-profit use, proprietary license available for commercial use[2]

Сайт

boinc.bakerlab.org/rosetta

Commons-logo.svg Rosetta@home на Викискладе
Rosetta@home
Платформа

BOINC

Объём загружаемого ПО

48 МБ

Объём загружаемых данных задания

2,5 МБ

Объём отправляемых данных задания

6—150 КБ

Объём места на диске

130 МБ

Используемый объём памяти

255 МБ

Графический интерфейс

есть

Среднее время расчёта задания

0,5—10 часов (возможно управление временем)

Deadline

10 дней

Возможность использования GPU

нет

[[commons:Category:Commons-logo.svg Rosetta@home на Викискладе|Rosetta@home ]] на Викискладе


Rosetta@Home — проект добровольных вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершённому проекту «Геном человека» известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, несуществующих белков. Хотя большая часть проекта ориентируется на фундаментальные исследования в области улучшения точности и надежности методов протеомики, Rosetta@home также способствует прикладным исследованиям для борьбы с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями[3]. Foldit — это видеоигра от Rosetta@Home, которая стремится достичь целей проекта с краудсорсинг подходом.

Результаты вычислений Rosetta@Home не доступны напрямую. Так же, нельзя использовать результаты вычислений собственного компьютера.[4] Однако они используются для большого количества научных публикаций.[5]

По сути Rosetta — это компьютерная программа, основными задачами которой являются:

  • поиск структуры с наименьшей энергией для заданной аминокислотной последовательности для предсказания структуры белка;
  • решение обратной задачи — поиск аминокислотной последовательности с наименьшей энергией для заданной белковой структуры;
  • расчёт взаимодействия комплекса белок-белок.

В данном проекте используется обратная связь по прогнозированию и полученным результатам, чтобы улучшать потенциальные функции и алгоритмы поиска.

Количество участников[править | править код]

Исходя из официальной статистики участников проекта Rosetta@Home[6] на октябрь 2011 года количество активных участников составляло 38 тысяч человек[7]. В июле 2017 года в проекте участвовало примерно 300 000 активных пользователей[8].

Примечания[править | править код]

  1. Приложения
  2. Portfolio Highlight: Rosetta++ Software Suite (англ.). UW TechTransfer – Digital Ventures. Проверено 7 сентября 2008. Архивировано 16 февраля 2012 года.
  3. Rosetta@Home — Исследования, связанные с болезнями Архивировано 23 сентября 2008 года.
  4. Правила использования Rosetta
  5. публикации Baker Lab
  6. Детальная статистика Rosetta@Home
  7. BOINCstats | Rosetta@Home - Credit overview (7 октября 2011). Проверено 27 сентября 2017.
  8. Rosetta@Home - Detailed stats | BOINCstats/BAM! (11 июля 2017). Проверено 27 сентября 2017.

См. также[править | править код]

Ссылки[править | править код]