Rosetta@home

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Rosetta@home
Rosetta@home - логотип.gif
Тип Предсказание структуры белка, Добровольные вычисления и BOINC Project[d]
Разработчик Baker laboratory, Вашингтонский университет, Rosetta Commons
Операционная система Кроссплатформенное программное обеспечение
Первый выпуск 6 октября 2005
Аппаратная платформа BOINC
Последняя версия Rosetta Mini: 3.71[1] (20 января 2016)
Состояние Активное
Лицензия Free for academic and non-profit use, proprietary license available for commercial use[2]
Сайт boinc.bakerlab.org/roset…
Commons-logo.svg Rosetta@home на Викискладе
Rosetta@home
Платформа BOINC
Объём загружаемого ПО 48 МБ
Объём загружаемых данных задания 2,5 МБ
Объём отправляемых данных задания 6—150 КБ
Объём места на диске 130 МБ
Используемый объём памяти 255 МБ
Графический интерфейс есть
Среднее время расчёта задания 0,5—10 часов (возможно управление временем)
Deadline 10 дней
Возможность использования GPU нет
Commons-logo.svg Rosetta@home на Викискладе


Rosetta@Home — проект добровольных вычислений, направленный на решение одной из самых больших проблем в молекулярной биологии — вычисление третичной структуры белков из их аминокислотных последовательностей. Благодаря недавно завершённому проекту «Геном человека» известны аминокислотные последовательности всех белков в человеческом организме. Исследования по данному проекту также помогут в проектировании новых, несуществующих белков. Хотя большая часть проекта ориентируется на фундаментальные исследования в области улучшения точности и надежности методов протеомики, Rosetta@home также способствует прикладным исследованиям для борьбы с такими болезнями как рак, малярия, болезнь Альцгеймера, сибирская язва и другими генетическими и вирусными заболеваниями[3]. Foldit — это видеоигра от Rosetta@Home, которая стремится достичь целей проекта с краудсорсинговым подходом.

Результаты вычислений Rosetta@Home не доступны напрямую. Так же, нельзя использовать результаты вычислений собственного компьютера.[4] Однако они используются для большого количества научных публикаций.[5]

По сути Rosetta — это компьютерная программа, основными задачами которой являются:

  • поиск структуры с наименьшей энергией для заданной аминокислотной последовательности для предсказания структуры белка;
  • решение обратной задачи — поиск аминокислотной последовательности с наименьшей энергией для заданной белковой структуры;
  • расчёт взаимодействия комплекса белок-белок.

В данном проекте используется обратная связь по прогнозированию и полученным результатам, чтобы улучшать потенциальные функции и алгоритмы поиска.

Количество участников[править | править код]

Исходя из официальной статистики участников проекта Rosetta@Home[6] на октябрь 2011 года количество активных участников составляло 38 тысяч человек[7]. В июле 2017 года в проекте участвовало примерно 300 000 активных пользователей[8].

Примечания[править | править код]

  1. Приложения
  2. Portfolio Highlight: Rosetta++ Software Suite (англ.). UW TechTransfer – Digital Ventures. Проверено 7 сентября 2008. Архивировано 16 февраля 2012 года.
  3. Rosetta@Home — Исследования, связанные с болезнями Архивировано 23 сентября 2008 года.
  4. Правила использования Rosetta Архивировано 19 апреля 2014 года.
  5. публикации Baker Lab Архивировано 24 ноября 2011 года.
  6. Детальная статистика Rosetta@Home
  7. BOINCstats | Rosetta@Home - Credit overview (недоступная ссылка — история) (7 октября 2011). Проверено 27 сентября 2017. Архивировано 7 октября 2011 года.
  8. Rosetta@Home - Detailed stats | BOINCstats/BAM! (недоступная ссылка — история) (11 июля 2017). Проверено 27 сентября 2017. Архивировано 11 июля 2017 года.

См. также[править | править код]

Ссылки[править | править код]