Гаплогруппа D (мтДНК)

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Гаплогруппа D
Тип мтДНК
Время появления 60 тыс. лет назад
Место появления Азия
Предковая группа Гаплогруппа M

Гаплогруппа D — гаплогруппа митохондриальной ДНК человека.

И. А. Захаров-Гезехус с коллегами предложили дать гаплогруппе D имя Дарый (Daryy)[1].

Митохондриальная гаплогруппа D в Евразии

Происхождение

[править | править код]

Предполагается, что гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет тому назад. Она является потомком гаплогруппы M.

По оценке Н. В. Володько, митохондриальная гаплогруппа D4h3 возникла на Дальнем Востоке около 17 тыс. лет назад[2][3].

Филогенетическое дерево

[править | править код]
  • D
    • D4
      • D1
        • D1a
        • D1b
        • D1c
        • D1d
      • D4a
        • D4a1
          • D4a1a
          • D4a1b
          • D4a1c
        • D4a2
          • D4a2a
        • D4a3
          • D4a3a
        • D4a4
      • D4b
        • D4b1
          • D3
          • D4b1a
            • D4b1a1
            • D4b1a2
              • D4b1a2a
                • D4b1a2a1
                  • D4b1a2a1a
          • D4b1b
            • D4b1b1
            • D4b1b1a
            • D4b1b2
        • D4b2
          • D4b2a
            • D4b2a1
            • D4b2a2
              • D4b2a2a
              • D4b2a2b
          • D4b2b
            • D4b2b1
              • D4b2b1a
              • D4b2b1b
            • D4b2b2
            • D4b2b3
      • D4c
        • D4c1
          • D4c1a
            • D4c1a1
          • D4c1b
            • D4c1b1
        • D4c2
      • D4d
      • D4e
        • D4e1
          • D2
            • D2a
              • D2a1
                • D2a1a
                • D2a1b
            • D2b
          • D4e1a
            • D4e1a1
            • D4e1a2
      • D4e2
          • D4e2a
          • D4e2b
          • D4e2c
      • D4f
      • D4g
        • D4g1
          • D4g1a
          • D4g1b
          • D4g1c
        • D4g2
          • D4g2a
            • D4g2a1
      • D4h
        • D4h1
          • D4h1a
        • D4h3
      • D4i
        • D4i1
        • D4i2
      • D4j
      • D4k
      • D4l
        • D4l1
        • D4l2
          • D4l2a
      • D4m
        • D4m1
        • D4m2
      • D4n
        • D4n1
      • D4o
        • D4o1
        • D4o2
    • D5’6
      • D5
        • D5a’b
          • D5a
            • D5a1
              • D5a1a
            • D5a2
              • D5a2a
                • D5a2a1
                  • D5a2a1a
                  • D5a2a1b
          • D5b
            • D5b1
              • D5b1a
              • D5b1b
                • D5b1b1
            • D5b2
        • D5c
        • D5d
          • D5d1
      • D6

Распространение

[править | править код]

Встречается в Северо-Восточной Азии (в том числе в Сибири). Также является одной из 5 мтДНК-гаплогрупп, обнаруженных у коренных народов Америки[4], наряду с такими, как A, B, C и X2a. D1 это базальная ветвь D4, которая широко распространена и разнообразна в Северной и Южной Америке. Субклады D4b1, D4e1 и D4h встречаются как в Азии, так и в Северной и Южной Америке. D2, встречается с высокой частотой в некоторых арктических и субарктических популяциях (особенно у алеутов) и является подклассом D4e1, параллельным D4e1a и D4e1c, поэтому его правильно следует называть D4e1b. D3 был найден главным образом в некоторых сибирских популяциях и у эскимосов Канады и Гренландии и является ветвью D4b1c.

Также гаплогруппа D довольно часто встречается в Центральной Азии[5], где она является второй по частоте кладой мтДНК (после митохондриальной гаплогруппы H). С низкой частотой гаплогруппа D встречается на северо-востоке Европы и в Юго-Западной Азии.

У монголов Китая митохондриальная гаплогруппа D достигает 27,07 %, у китайцев-хань — 23,53 %, у монголоязычных дауров — 10,53 %. Митохондриальная гаплогруппа D выявлена у 3 из 10 изученных в Китае носителей тунгусского языка[6].

Палеогенетика

[править | править код]
  • D1 определена у девочки-подростка из пещеры Хойо Негро (полуостров Юкатан), жившей 13—12 тыс. лет назад[7][8]
  • D4h3a определена у мальчика Анзик-1 (en:Anzick-1), жившего 12,7 тыс. лет назад[9]
  • D1 определили у 10 600-летней мумии Пещеры Духов[англ.] (AHUR_2064), из штата Невада[10]
  • В Южном конусе Южной Америки в раннем голоцене была распространена митохондриальная гаплогруппа D1j, в среднем голоцене — митохондриальная гаплогруппа D1g[11]
  • D1j определили у образца LLP.S2.E1 (Laguna Chica, 10 223—9764 л. н.) из Аргентины[12]
  • D4h3 определена у индивида Шука Каа (Shuká Káa) из пещеры «На коленях» (en:On Your Knees Cave) на острове принца Уэльского на юго-востоке штата Аляска, жившего 9730±60 — 9880±50 лет назад[13][14]
  • D4h3a определили у образцов из бразильских Lapa do Santo возрастом ок. 9,5 тыс. л. н., Moraes возрастом ок. 5,8 тыс. л. н. и у образца из белизского Mayahak Cab Pek (ок. 9,3 тыс. л. н.)[15]
  • D5a2a1h1 FY-HT-2 (9380±90 л. н.) из китайской пещеры Фуянь (en:Fuyan Cave)[16][17][18]
  • D1 определили у образца ASO_B9_S14a (Arroyo Seco 2, 7832—7573 л. н.) из Аргентины[12]
  • D4 определена у образца DevilsGate1 (5726—5622 лет до н. э.) из пещеры Чёртовы Ворота в Приморье[19]
  • D4 определена у представителей культуры Бойсмана (~5000 лет до н. э.) в Приморье[20]
  • D* и D1 выявлены у древних южноамериканцев (D* и D1 в Huaca Pucllana, D1 в Pasamayo, Pueblo Viejo (Перу) и в Llullaillaco (Аргентина)[21][22]
  • D4b1a определили у представителей культуры Луншань (2275—1844 лет до н. э.)[23]
  • D4j определили у образца KPT005 (4142—3980 л. н., ранний бронзовый век) из могильника Khaptsagai у деревни Люры (Иркутская область)[24]
  • D2a1a определена у древних алеутов с Алеутских островов (от 2320—1900 до 500—140 л. н.)[25]
  • D2a1 обнаружена у представителя палеоэскимосской культуры Саккак, жившего в Гренландии ок. 4 тыс. лет назад[26]
  • D4b2b обнаружена у образцов JJD301.1 и JJD301.6 (3300 л. н.) из китайской пещеры Яндзиапо (Yangjiapo Cave)[16]
  • D5a1a2ab определена у образца FY-HT-1 (2510±140 л. н.) из китайской пещеры Фуянь (en:Fuyan Cave)[16]
  • Митохондриальная гаплогруппа D была обнаружена у мужчины-воина из погребения в Покровске (Якутия), жившего 2400—2200 лет назад[27]
  • У представителей среднего периода Яёй определили митохондриальные гаплогруппы D4b2b1 (образцы из Doigahama DH-S01 (2,306—2,238 тыс. л. н.) и DH-A) и D4b2a1 (образец HN-SJ002, Hanaura, Япония)[28].
  • У мужчины и женщины хунну из Duurlig Nars в Северо-Восточной Монголии, живших 2000 лет назад, определили митохондриальная гаплогруппа D4[29]
  • D1g5 определили у образца LCH.E4.4 (Laguna Chica, 1627—1565 л. н.) из Аргентины[12]
  • Урджарская принцесса из погребения сакского времени (III—IV век до н. э.) в Урджарском районе Восточно-Казахстанской области имела субкладу D4o[30][31]
  • Исследование ДНК скелета гуннского периода из Музея естественной истории (г. Будапешт), датированного средней третью V века, показало, что он имел субкладу D4j12[31]
  • D2a1 определили у образцов токаревской культуры (вторая половина 1 тыс. до н. э. — начало 1 тыс. н. э.) со стоянки Ольская на мысе Восточный (Ольский) (Магаданская область)[24]
  • D5c1a определили у образца имперского периода Кофун JpIw31 (1303—1377 л. н.)[32].
  • D4o2a определили у образца Yana _young (766 л. н.) с Янской стоянки (Якутия)[24]
  • D4b1 определили у мужчины из погребения 688 гунно-сарматского времени памятника Сопка-2 в Барабинской лесостепи[33]
  • D4j определена у образца Uyelgi21 из могильника IX века на озере Уелги (Челябинская область)[34]
  • D4o2a, D5b1 определили образцов с кладбища Чжэньзишань (Zhenzishan) в китайском Шанду (XIII век)[35]
  • D4b1a2a1a обнаружена у образцов с кладбища в Нувуке (Барроу) на Аляске с калиброванными датами между 981 и 1885 годами нашей эры[36]
  • D1 определена у образца I1742 (880 л. н.) из перуанского Tranca (Laramate, Highlands)[15]
  • D1a2 определили у бразильского образца Brazil-12 (от 888 ± 25 до 4851 ± 30 л. н.) из штата Пернамбуку[37]

Древо гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R O A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 R2'JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Примечания

[править | править код]
  1. Захаров И. А. Центральноазиатское происхождение предков первых американцев Архивная копия от 17 октября 2018 на Wayback Machine // Первые американцы. 2003. № 11. С. 139-144.
  2. Васильев С. А., Березкин Ю. Е., Козинцев А. Г., Пейрос И. И., Слободин С. Б., Табарев А. В. Заселение человеком Нового Света: Опыт комплексного исследования Архивная копия от 1 марта 2020 на Wayback Machine. СПб: Нестор-история, 2015.
  3. Volodko N. V., Starikovskaya E. B., Mazunin I. O. et al., 2008. Mitochondrial diversity in Arctic Siberians, with particular reference to the evolutionary history of Beringia and Pleistocenic peopling of the Americas // American Journal of Human Genetics. Vol. 82. № 5. P. 1084–1100.
  4. Natalia V. Volodko, Elena B. Starikovskaya, Ilya O. Mazunin et al., «Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas», The American Journal of Human Genetics 82, 1084—1100, May 2008. DOI 10.1016/j.ajhg.2008.03.019.
  5. D. Comas et al. Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages. European Journal of Human Genetics Архивная копия от 25 мая 2011 на Wayback Machine, 2004
  6. Guanglin He et al. Genomic insights into the differentiated population admixture structure and demographic history of North East Asians Архивная копия от 23 июля 2021 на Wayback Machine, July 20, 2021 (PDF Архивная копия от 23 июля 2021 на Wayback Machine)
  7. Late Pleistocene Human Skeleton and mtDNA Link Paleoamericans and Modern Native Americans. Дата обращения: 17 мая 2014. Архивировано 17 мая 2014 года.
  8. Мексиканская американка из Сибири. Дата обращения: 16 мая 2014. Архивировано из оригинала 19 мая 2014 года.
  9. Rasmussen M. et al. The genome of a Late Pleistocene human from a Clovis burial site in western Montana, Nature. 2014. V. 506. P. 225—229.
  10. J. Víctor Moreno-Mayar et al. Early human dispersals within the Americas Архивная копия от 25 ноября 2018 на Wayback Machine, 2018
  11. Roca-Rada Xavier et al. Ancient mitochondrial genomes from the Argentinian Pampas inform the peopling of the Southern Cone of South America // ISBA9 (PDF Архивная копия от 16 октября 2021 на Wayback Machine
  12. 1 2 3 Xavier Roca-Rada et al. Ancient mitochondrial genomes from the Argentinian Pampas inform the earlypeopling of the Southern Cone of South America, 14 May 2021 (Table 1. Calibrated dates and mitochondrial haplogroups of the 18 Early to Late Holocene individuals from the Argentinian Pampas)
  13. Supporting Information. Lindo et al. 10.1073/pnas.1620410114. Дата обращения: 8 апреля 2017. Архивировано 2 сентября 2017 года.
  14. Kemp Brian M. et al. (2007). Genetic Analysis of Early Holocene Skeletal Remains From Alaska and its Implications for the Settlement of the Americas (недоступная ссылка)
  15. 1 2 Cosimo Posth et al. Reconstructing the Deep Population History of Central and South America Архивная копия от 22 декабря 2021 на Wayback Machine, 2018
  16. 1 2 3 Xue-feng Sun. Ancient DNA and multimethod dating confirm the late arrival of anatomically modern humans in southern China Архивная копия от 7 марта 2021 на Wayback Machine, February 23, 2021
  17. María Martinón-Torres[исп.] et al. On the misidentification and unreliable context of the new “human teeth” from Fuyan Cave (China) Архивная копия от 30 мая 2021 на Wayback Machine, May 24, 2021
  18. Darren Curnoe et al. Reply to Martinón-Torres et al. and Higham and Douka: Refusal to acknowledge dating complexities of Fuyan Cave strengthens our case Архивная копия от 2 июня 2021 на Wayback Machine, June 1, 2021
  19. Veronika Siska et al. Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago Архивная копия от 27 июля 2018 на Wayback Machine, 2017
  20. Chuan-Chao Wang et al. The Genomic Formation of Human Populations in East Asia Архивная копия от 1 апреля 2020 на Wayback Machine, 2020
  21. Андрей Коньков. Расшифровка древней ДНК рассказала о происхождении южноамериканских индейцев Архивная копия от 26 декабря 2017 на Wayback Machine, 20.04.2016
  22. Bastien Llamas et al. Ancient mitochondrial DNA provides high-resolution time scale of the peopling of the Americas, 2016 // Supplementary Materials. Table S2. List of ancient samples, associated metadata, and sequencing results (separate Excel document Архивная копия от 8 января 2018 на Wayback Machine
  23. Chao Ning et al. Ancient genome analyses shed light on kinship organization and mating practice of Late Neolithic society in China, 2021
  24. 1 2 3 Martin Sikora et al. The population history of northeastern Siberia since the Pleistocene Архивная копия от 5 июля 2021 на Wayback Machine, 05 June 2019 (bioRxiv, 2018 Архивная копия от 24 октября 2018 на Wayback Machine)
  25. Pavel Flegontov et al. Paleo-Eskimo genetic legacy across North America Архивная копия от 23 января 2018 на Wayback Machine, 2017
  26. Rasmussen, M. et al., «Ancient human gonome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo». Nature 463: 757—762.
  27. Amory S, Crubézy E, Keyser C, Alekseev AN, Ludes B (October 2006). «Early influence of the steppe tribes in the peopling of Siberia». Human Biology 78 (5): 531-49.
  28. Fuzuki Mizuno et al. Population dynamics in the Japanese Archipelago since the Pleistocene revealed by the complete mitochondrial genome sequences // Scientific Reports, 2021
  29. A western Eurasian male is found in 2000-year-old elite Xiongnu cemetery in Northeast Mongolia. Дата обращения: 21 января 2015. Архивировано 27 декабря 2014 года.
  30. Первые результаты работы Лаборатории популяционной генетики. Дата обращения: 9 февраля 2020. Архивировано 17 января 2021 года.
  31. 1 2 Казахстанский ДНК-проект Архивная копия от 26 ноября 2016 на Wayback Machine
  32. Niall P. Cooke et al. Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations Архивная копия от 18 сентября 2021 на Wayback Machine // Science Advances • 17 Sep 2021 • Vol 7, Issue 38
  33. Пилипенко А. С. Уникальное захоронение воина гунно-сарматского времени в Западно-Сибирской лесостепи: результаты палеогенетического анализа Архивная копия от 30 декабря 2018 на Wayback Machine // Археология, этнография и антропология Евразии. Том 46 № 4 2018
  34. Veronika Csaky et al. Early Medieval Genetic Data from Ural Region Evaluated in the Light of Archaeological Evidence of Ancient Hungarians, 2020
  35. Jiawei Li et al. Ancient genomes reveal complex genetic history of an international metropolis at Kublai Khan's Upper Capital (Xanadu) Архивная копия от 22 июня 2022 на Wayback Machine, 14 June 2022
  36. Justin Tackney et al. Molecular analysis of an ancient Thule population at Nuvuk, Point Barrow, Alaska, 09 January 2019
  37. Andre Luiz Campelo dos Santos et al. Genomic evidence for ancient human migration routes along South America's Atlantic coast, 02 November 2022

Общие сведения

[править | править код]

Гаплогруппа D

[править | править код]