CHD7

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Хромодомен хеликазы ДНК-связывающего белка 7
PDB rendering based on 2ckc.PDB rendering based on 2ckc.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ CHD7 ; CRG; HH5; IS3; KAL5
Внешние ID OMIM: 608892 MGI2444748 HomoloGene19067 GeneCards: Ген CHD7
номер EC 3.6.4.12
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 55636 320790
Ensembl ENSG00000171316 ENSMUSG00000041235
UniProt Q9P2D1 A2AJK6
RefSeq (мРНК) NM_017780 NM_001033395
RefSeq (белок) NP_060250 NP_001264078
Локус (UCSC) Chr 8:
61.59 – 61.78 Mb
Chr 4:
8.69 – 8.87 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

CHD7 (от англ. Chromodomain-Helicase-DNA-binding protein 7) известный также как АТФ-зависимая хеликаза CHD7 — фермент, который у человека кодируется геном CHD7[1][2].

CHD7 является АТФ-зависимым ремодельером хроматина, гомолог белков дрозофилы, относимых к белкам группы Trithorax Kismet[3]. Мутации в CHD7 связаны с синдромом CHARGE[англ.][4].

Модельные организмы

[править | править код]

Модельные организмы были использованы при исследовании функций CHD7. Условная линия нокаутных мышей под названием Chd7tm2a(EUCOMM)Wtsi[12][13] была создана в рамках международной программы консорциума Нокаутная мышь — проект интенсивного мутагенеза для создания и распространения животных моделей различных заболеваний, с целью заинтересовать учёных[14][15][16].

Сосочек Бергмейстера, гистологический срез.

Мужские и женские особи прошли стандартное фенотипическое обследование, чтобы определить фенотип мутации[10][17]. Было проведено двадцать четыре испытания, проведенные на мутантных мышах и в пяти случаях были замечены значительные нарушения[10]. Гомозиготных мутантов не выявлено в эмбрионах во время беременности, то есть в гомозиготном состоянии мутация оказалась летальной. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных взрослых мышах. Мужские гетерозиготы характеризуются ненормальной высотой таза в модифицированном тесте SHIRPA и имеют высокий сосочек Бергмейстера в обоих глазах. Когда был изучен мозг гетерозиготных животных, обнаружилось отсутствие мозолистого тела[10].

Примечания

[править | править код]
  1. Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K.I., Hirosawa M., Ohara O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 2000. — February (vol. 7, no. 1). — P. 65—73. — doi:10.1093/dnares/7.1.65. — PMID 10718198.
  2. Entrez Gene: chromodomain helicase DNA binding protein 7. Архивировано 6 марта 2010 года.
  3. Bajpai R., Chen D.A., Rada-Iglesias A., Zhang J., Xiong Y., Helms J., Chang C.P., Zhao Y., Swigut T., Wysocka J. CHD7 cooperates with PBAF to control multipotent neural crest formation (англ.) // Nature : journal. — 2010. — February (vol. 463, no. 7283). — P. 958—962. — doi:10.1038/nature08733. — PMID 20130577. — PMC 2890258.
  4. Vissers L.E., van Ravenswaaij C.M., Admiraal R., Hurst J.A., de Vries B.B., Janssen I.M., van der Vliet W.A., Huys E.H., de Jong P.J., Hamel B.C., Schoenmakers E.F., Brunner H.G., Veltman J.A., van Kessel A.G. Mutations in a new member of the chromodomain gene family cause CHARGE syndrome (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — September (vol. 36, no. 9). — P. 955—957. — doi:10.1038/ng1407. — PMID 15300250.
  5. Neurological assessment data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  6. Radiography data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано 17 октября 2012 года.
  7. Eye morphology data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано 17 октября 2012 года.
  8. Salmonella infection data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано 17 октября 2012 года.
  9. Citrobacter infection data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано 17 октября 2012 года.
  10. 1 2 3 4 Gerdin A.K. The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice (англ.) // Acta Ophthalmologica[англ.] : journal. — Wiley-Liss, 2010. — Vol. 88. — P. 925—927. — doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
  11. Mouse Resources Portal Архивная копия от 24 декабря 2011 на Wayback Machine, Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. International Knockout Mouse Consortium. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано из оригинала 3 апреля 2012 года.
  13. Mouse Genome Informatics. Дата обращения: 2 апреля 2015. Архивировано 3 апреля 2015 года.
  14. Skarnes W. C., Rosen B., West A. P., Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica A. O., Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong P. J., Stewart A. F., Bradley A. A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function. (англ.) // Nature. — 2011. — Vol. 474, no. 7351. — P. 337—342. — doi:10.1038/nature10163. — PMID 21677750. [исправить]
  15. Dolgin E. Mouse library set to be knockout (англ.) // Nature. — 2011. — Vol. 474, no. 7351. — P. 262—263. — doi:10.1038/474262a. — PMID 21677718.
  16. Collins F.S., Rossant J., Wurst W. A Mouse for All Reasons (англ.) // Cell. — Cell Press, 2007. — Vol. 128, no. 1. — P. 9—13. — doi:10.1016/j.cell.2006.12.018. — PMID 17218247.
  17. van der Weyden L., White J.K., Adams D.J., Logan D.W. The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism. (англ.) // BioMed Central[англ.] : journal. — 2011. — Vol. 12, no. 6. — P. 224. — doi:10.1186/gb-2011-12-6-224. — PMID 21722353. — PMC 3218837.

Литература

[править | править код]