Fez-подобные белки

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Fez-подобные белки
Идентификаторы
ПсевдонимыFEZF1, FEZ, ZNF312B, HH22, FEZ family zinc finger 1
Внешние IDOMIM: 613301 MGI: 1920441 HomoloGene: 19252 GeneCards: FEZF1
Расположение гена (человек)
7-я хромосома человека
Хр.7-я хромосома человека[1]
7-я хромосома человека
Расположение в геноме FEZF1
Расположение в геноме FEZF1
Локус7q31.32Начало122,301,303 bp[1]
Конец122,310,691 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
6-я хромосома мыши
Хр.6-я хромосома мыши[2]
6-я хромосома мыши
Расположение в геноме FEZF1
Расположение в геноме FEZF1
Локус6|6 A3.1Начало23,245,043 bp[2]
Конец23,248,361 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001024613
NM_001160264

NM_028462

RefSeq (белок)

NP_001019784
NP_001153736

NP_082738

Локус (UCSC)Chr 7: 122.3 – 122.31 MbChr 6: 23.25 – 23.25 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)
Fez-подобные белки
Идентификаторы
ПсевдонимыFEZF2, FEZ, FEZL, TOF, ZFP312, ZNF312, FKSG36, FEZ family zinc finger 2
Внешние IDOMIM: 607414 MGI: 1859823 HomoloGene: 9957 GeneCards: FEZF2
Расположение гена (человек)
3-я хромосома человека
Хр.3-я хромосома человека[5]
3-я хромосома человека
Расположение в геноме FEZF2
Расположение в геноме FEZF2
Локус3p14.2Начало62,369,681 bp[5]
Конец62,374,324 bp[5]
Расположение гена (Мышь)
14-я хромосома мыши
Хр.14-я хромосома мыши[6]
14-я хромосома мыши
Расположение в геноме FEZF2
Расположение в геноме FEZF2
Локус14|14 A1Начало10,121,574 bp[6]
Конец10,127,669 bp[6]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_018008

NM_080433

RefSeq (белок)

NP_060478

NP_536681

Локус (UCSC)Chr 3: 62.37 – 62.37 MbChr 14: 10.12 – 10.13 Mb
Поиск по PubMedИскать[7]Искать[8]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)
FEZ-подобные белки
Идентификаторы
Символ FEZ
Pfam PF07763
InterPro IPR011680
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель

Fez-подобные белки — семейство белков эукариотических организмов, которое, как полагают, вовлечено в процессы роста аксонов нейронов и образования пучков нервных волокон[9]. N-конец аминокислотной последовательности этих белков менее эволюционно консервативен, чем C-конец, и обладает высокой кислотностью[9].

Гомологичный ген у червя Caenorhabditis elegans, называемый UNC-76, играет структурную и организующую, а также сигнальную роль в управлении процессами роста и удлинения аксонов нейронов и в их прикреплении (адгезии) к терминальным нейронам места назначения, и в управлении процессом формирования пучков нервных волокон из отдельных аксонов (то есть процессом фасцикуляции аксонов). Особенно эффективно воздействует ген UNC-76 на рост и развитие аксона и на его прикрепление к нейронам места назначения при наличии на пути роста аксона других нервных клеток[10]. Такая же роль постулирована и для других белков семейства FEZ[9]. К белкам семейства Fez относятся, в частности, белки — репрессоры FEZ1 и Fez2, а также белки — факторы транскрипции ДНК — цинковые пальцы FEZF1 и FEZF2[9].

Для ряда гомологичных белков семейства Fez показана способность взаимодействовать с N-концевым вариабельным доменом V1 протеинкиназы C типа дзета. Это приводит к перемещению молекулы белка семейства Fez, вступившей в такое взаимодействие, в цитоплазму нервной клетки, по крайней мере у млекопитающих[10].

C-концевой домен белков семейства Fez, вероятно, участвует в образовании связей с регуляторным доменом протеинкиназы C типа дзета[10].

Ряд членов семейства Fez-подобных белков, в частности белки FEZ1 и Fez2, согласно математической модели, должны иметь вторичную структуру, называемую катушечной катушкой[10][11]. Предполагается, что такая вторичная структура должна позволять этим белкам взаимодействовать с сигнальными белками семейства RhoA[10]. Согласно имеющимся математическим моделям, вторичные структуры белков FEZ1 и Fez2 не содержат других характерных структурных мотивов. В то же время белки FEZF1 и FEZF2 имеют характерную для факторов транскрипции вторичную структуру, в которой имеются цинковые пальцы и участок для связывания ДНК[11].

Некоторые члены семейства Fez-подобных белков, такие, как FEZ1, экспрессируются почти исключительно в головном мозге. В то же время некоторые другие члены семейства Fez-подобных белков, такие, как Fez2, экспрессируются также и в других тканях. Функции этих белков, в частности белка Fez2, во внемозговых тканях пока окончательно не выяснена, но, как предполагается, сходны с их функциями в головном мозге, например, управление ростом, развитием и дифференцировкой клеток[11].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128610 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029697 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000153266 - Ensembl, May 2017
  6. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021743 - Ensembl, May 2017
  7. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  8. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  9. 1 2 3 4 Bloom L., Horvitz H.R. The Caenorhabditis elegans gene unc-76 and its human homologs define a new gene family involved in axonal outgrowth and fasciculation (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — April (vol. 94, no. 7). — P. 3414—3419. — doi:10.1073/pnas.94.7.3414. — PMID 9096408. — PMC 20384.
  10. 1 2 3 4 5 Kuroda S., Nakagawa N., Tokunaga C., Tatematsu K., Tanizawa K. Mammalian homologue of the Caenorhabditis elegans UNC-76 protein involved in axonal outgrowth is a protein kinase C zeta-interacting protein (англ.) // J. Cell Biol.[англ.] : journal. — 1999. — February (vol. 144, no. 3). — P. 403—411. — doi:10.1083/jcb.144.3.403. — PMID 9971736. — PMC 2132904.
  11. 1 2 3 Fujita T., Ikuta J., Hamada J., Okajima T., Tatematsu K., Tanizawa K., Kuroda S. Identification of a tissue-non-specific homologue of axonal fasciculation and elongation protein zeta-1 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2004. — January (vol. 313, no. 3). — P. 738—744. — doi:10.1016/j.bbrc.2003.12.006. — PMID 14697253.

Эта статья использует текст из общественное достояние Pfam и InterPro IPR011680