Интрон: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[непроверенная версия][непроверенная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Нет описания правки
Нет описания правки
Строка 7: Строка 7:
=== Классификция интронов ===
=== Классификция интронов ===
Существует четыре группы интронов:
Существует четыре группы интронов:
- Ядерные интроны
- Ядерные интроны
- Интроны группы I
- Интроны группы I
- Интроны группы II
- Интроны группы II
- Интроны группы III
- Интроны группы III


Иногда интроны группы III также относят к группе II, потому что они похожи по струкуре и функции.
Иногда интроны группы III также относят к группе II, потому что они похожи по струкуре и функции.


Ядерные или спалайсосомные интроны подвергаются [[сплайсинг|сплпйсингу]] при помощи [[сплайсосома|сплайсосомы]] и малых [[нуклеола|нуклеолярных]] РНК (snoRNA). В последовательности РНК, содержащей ядерные интроны, есть специальные сигнальные последовательности, которые узнаются сплайсосомой.
Ядерные или спалайсосомные интроны подвергаются [[сплайсинг|сплайсингу]] при помощи [[сплайсосома|сплайсосомы]] и малых [[нуклеола|нуклеолярных]] РНК (snoRNA). В последовательности РНК, содержащей ядерные интроны, есть специальные сигнальные последовательности, которые узнаются сплайсосомой.

Интроны I, II и III группы способны к автосплайсингу и встречаются реже, чем сплайсосомные интроны. Интроны II и III группы похожи друг на друга и обладают консервативной вторичной структурой. Они обладают свойствами, похожими на свойства сплайсосомы и, вероятно, являются её [[эволюция|эволюционными]] предшественниками. Интроны I группы, которые встречаюся у [[бактерии|бактерий]] и [[простейшие|простейших]] - единственный класс интронов, который требует присутствие несвязанного [[нуклеотид|гуанидинового нуклеотида]]. Их вторичная структура отличается от вторичной структуры интронов II и III группы.

=== Идентификация ===
Почти все [[эукариоты|эукариотические]] ядерные интроны начинаются с GU и оканчиваются AG (правило AG-GU).

===Ссылки===
* [[Walter Gilbert|'''Gilbert''', Walter]] (1978): Why genes in pieces. ''[[Nature (journal)|Nature]]'' '''271'''(5645): 501. <small>{{DOI|10.1038/271501a0}}</small>

* '''Roy''', Scott William & [[Walter Gilbert|'''Gilbert''', Walter]] (2006): The evolution of spliceosomal introns: patterns, puzzles and progress. ''[[Nature Reviews Genetics]]'' '''7''': 211-221. <small>{{DOI|10.1038/nrg1807}}</small> [http://www.faculty.biol.ttu.edu/densmore/MB06pdfs/Nat.rev.intron%20evol.pdf PDF fulltext]

* '''Gogarten''', J. Peter & '''Hilario''', Elena (2006): Inteins, introns, and homing endonucleases: recent revelations about the life cycle of parasitic genetic elements. ''[[BioMed Central|BMC Evolutionary Biology]]'' '''6''': 94<!-- BMC papers have article instead of page numbers --> <small>{{DOI|10.1186/1471-2148-6-94}}</small> [http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2148-6-94.pdf PDF fulltext]

* '''Yandell''', Mark; Mungall, Chris J.; Smith, Chris; Prochnik, Simon; Kaminker, Joshua; Hartzell, George; Lewis, Suzanna & Rubin, Gerald M. (2006): Large-Scale Trends in the Evolution of Gene Structures within 11 Animal Genomes. ''[[PLoS Computational Biology|PLoS Comput. Biol.]]'' '''2'''(3): 113-125. <small>{{DOI|10.1371/journal.pcbi.0020015}}</small> [http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-pdf&file=10.1371_journal.pcbi.0020015-L.pdf PDF fulltext] [http://compbiol.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10%2E1371%2Fjournal%2Epcbi%2E0020015#toclink6 Supporting Information]






Версия от 21:54, 8 апреля 2007

Интрон — участок ДНК, который является частью гена, но не содержит информации о последовательности аминокислот белка.

Файл:Gen CDK4.jpg

Последовательность нуклеотидов, соответствующая интрону, удаляется из транскрибированной с него РНК в процессе сплайсинга до того, как произойдет считывание белка (трансляция). Интроны характерны для всех типов эукариотической РНК, но также найдены в рибосомальной РНК (рРНК) и транспортной РНК (тРНК) прокариот. Число и длина интронов очень различны в разных видах и среди разных генов одного организма. Например, геном рыбы фугу (Takifugu rubripes) содержит мало интронов. С другой стороны, гены млекопитающих и цветочных растений часто содержат многочисленные интроны, которые могут быть длиннее экзонов.

Классификция интронов

Существует четыре группы интронов: - Ядерные интроны - Интроны группы I - Интроны группы II - Интроны группы III

Иногда интроны группы III также относят к группе II, потому что они похожи по струкуре и функции.

Ядерные или спалайсосомные интроны подвергаются сплайсингу при помощи сплайсосомы и малых нуклеолярных РНК (snoRNA). В последовательности РНК, содержащей ядерные интроны, есть специальные сигнальные последовательности, которые узнаются сплайсосомой.

Интроны I, II и III группы способны к автосплайсингу и встречаются реже, чем сплайсосомные интроны. Интроны II и III группы похожи друг на друга и обладают консервативной вторичной структурой. Они обладают свойствами, похожими на свойства сплайсосомы и, вероятно, являются её эволюционными предшественниками. Интроны I группы, которые встречаюся у бактерий и простейших - единственный класс интронов, который требует присутствие несвязанного гуанидинового нуклеотида. Их вторичная структура отличается от вторичной структуры интронов II и III группы.

Идентификация

Почти все эукариотические ядерные интроны начинаются с GU и оканчиваются AG (правило AG-GU).

Ссылки




См. также