Проект:Таксономия/Параметры для вирусов (Код ICTV и Группа по Балтимору)

Здесь находятся завершившиеся обсуждения. Просьба не вносить изменений.

Извините мою неграмотность, но я действительно ни чего не знаю про классификации вирусов Код ICTV и Группа по Балтимору. Возникают следующие вопросы:

1. Существуют сетевые ресурсы содержащие исчерпывающую информацию об этих классификациях, или эти сведения содержатся только в очень толстых и дорогих печатных изданиях? --Chan 12:12, 4 декабря 2010 (UTC)
   • http://www.ictvonline.org/index.asp?bhcp=1 Virology Division of the International Union of Microbiological Societies (IUMS) charged the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) with the task of developing, refining, and maintaining a universal virus taxonomy --Sirozha.ru 12:34, 4 декабря 2010 (UTC)
2. Как я мог мельком заметить, достаточно только одного числового идентификатора для однозначного определения вируса по этим классификациям? --Chan 12:12, 4 декабря 2010 (UTC)

Проще говоря: каков формат параметра и как лучше сослаться на АИ? --Chan 12:12, 4 декабря 2010 (UTC)

• Есть статья Классификация вирусов по Балтимору и даже {{Балтимор}}, к сожалению, пока не все статьи по семействам есть в ВП. Про ICTV тоже есть статья, но она пока недопереведена. Сегодня сделал шаблон, который как раз работает с числовым идентификатором, как в ncbi, например. Шаблон:ICTVdB --Sirozha.ru 12:28, 4 декабря 2010 (UTC)
  • В шаблоне биокарточка была сделана ссылка на статью по классификации Балтимора. Можно сделать ссылку на статью по ICTV --Sirozha.ru 12:32, 4 декабря 2010 (UTC)
• Единственный ньюанс, на который вам стоит обратить внимание - классификация Балтимора НЕ_ТАКСОНОМИЧЕСКАЯ. То есть это разделение семейств вирусов по группам, на основе генома (одноцепочечные, двуцепочечные, ±РНК, ДНК, с обратной транскрипцией). Поэтому классификацию Балтимора надо отделить от таксономического положения вируса, как правильно заметил участник Mithril --Sirozha.ru 12:36, 4 декабря 2010 (UTC)
• ICTVBd требует одного параметра состоящего из некоторого числа цифр, разделённых некоторым числом точек (в зависимости от ранга). http://www.ictvdb.org/ICTVdB/$1.htm Серебряный 12:45, 4 декабря 2010 (UTC)
• Групп по Балтимору всего семь и отнесение вирусов к ним не бывает дискуссионным. Так что, вероятно, можно сделать этот параметр внутренней ссылкой на соответствующий раздел статьи или собственную статью, буде возникнет. В смысле, АИ указывать в других статьях. Серебряный 12:45, 4 декабря 2010 (UTC)
• Огромное спасибо за разъяснения. Теперь становится понятно.
• Относительно ICTV, я так понял, его целесообразно включить в подвал шаблона подобно NCBI. Поправьте меня если я ошибаюсь.
• Для Балтимора лучше сделать отдельный раздел как для ареала или охранного статуса. Словарь параметра состоит всего из семи значений. Просто числа от 1 до 7 подойдут? Или требуется что то более специфичное? (я не могу углядеть). В раздел Классификация по Балтимору в зависимости от значения параметра выводим строку из левого столбца шаблона {{Балтимор}}. Правильно? --Chan 13:28, 4 декабря 2010 (UTC)
  • ICTV — да, только вот длинноватый там код.. Название группы по Балтимору лучше бы расшифровывать. Придётся подумать о коротких, но корректных формулировках. Серебряный 13:48, 4 декабря 2010 (UTC)
    • Хорошо, завтра попробую приписать ICTV в Таксон. Если формулировки для Балтимора сжиматься не захотят можно использовать всплывающие подсказки. --Chan 14:24, 4 декабря 2010 (UTC)
  • SergeyJ предложил сохранить имена параметров, чтобы было меньше лишней работы. Правда, есть проблема с единообразием.. ncbi-то в нижнем регистре. Можно сделать параметр case insensitive? Серебряный 14:20, 4 декабря 2010 (UTC)
    • Посмотрел обсуждение SergeyJ, всё возможно. Пусть названия параметров сохраняются. Словарь для Baltimore group: «I», «II», «III», «IV», «V», «VI», «VII». Это из Биокарточки/шаблона Вирус. --Chan 14:35, 4 декабря 2010 (UTC)
      • В тексте статьи можно применить и I, II, III, и 1, 2, 3, в принципе, все равно. Но выводить шаблон лучше с цифрами «I», «II», «III», «IV», «V», «VI», «VII». Либо сочетать римскую цифру с обозначением генома, как в taxobox, dsDNA, (+)ssRNA и так далее --Sirozha.ru 15:38, 4 декабря 2010 (UTC)

Реализация ICTV

Вирус Западного Нила
Вирус Западного Нила
Научная классификация
Группа: Вирусы Реалм: Riboviria Царство: Orthornavirae Тип: Kitrinoviricota Класс: Flasuviricetes Порядок: Amarillovirales Семейство: Flaviviridae Род: Flavivirus Подрод: Japanese encephalitis virus group Вид: Вирус лихорадки Западного Нила
Международное научное название
West Nile virus
Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе NCBI   11082

{{Таксон
 | name              = Вирус Западного Нила
 | regnum            = Вирусы
| image file = NIAID-west-Nile.jpg
| image descr = Вирус Западного Нила
 | image title       = 
 | ref               = 
 | comment           = 
 | rang              = 
| latin        = West Nile virus
 | author            = 
 | syn               = 
 | typus             = 
 | children name     = 
 | children          = 
 | range map         = 
 | range map caption = 
 | range map width   = 
 | range legend      = 
 | wikispecies       = West Nile virus
 | commons           = West Nile virus
 | itis              = 
| ncbi = 11082
 | eol               = 
| ICTV = 00.026.0.01.051
| ictv = 
| Baltimore group = IV
}}

Строки смещённые влево взяты из шаблона Биокарточка. Параметр ICTV можно записывать и большими и маленькими буквами. В документацию дам маленькие. Длина строки в значении параметра не критична. Можно переходить к Балтимору. --Chan 02:46, 5 декабря 2010 (UTC)

Обновил несколько статей на Таксон. Не вижу смысла держать в шаблоне два варианта параметра (большими и маленькими буквами). При том количестве статей, которое надо изменить, это не серьёзно. Оставляю только ictv, по признаку единообразия с другими подобными параметрами. --Chan 06:22, 5 декабря 2010 (UTC)

Реализация Балтимора

Сделал параметр Baltimore group, значения от 1 до 7 хот арабскими хоть латинскими цифрами. За оформление не судите строго, формулировки можно будет переделать. Всё замкнул на статью Классификация вирусов по Балтимору, где можно будет расписать все тонкости классификации не ограничивая себя жесткими рамками шаблона. --Chan 05:01, 5 декабря 2010 (UTC)

• Единственное, что я бы не стал викифицировать римские цифры и двоеточие, а вики-ссылку дать только на название группы --Sirozha.ru 05:59, 5 декабря 2010 (UTC)

  Поправил. --Chan 06:16, 5 декабря 2010 (UTC)

• Учитывая, что Балтимор — фамилия, так что викифицировать лучше фразу «группа по Балтимору». Серебряный 08:47, 5 декабря 2010 (UTC)
  • Сделал. --Chan 09:10, 5 декабря 2010 (UTC)
• Слово «внесистемная» туда затесалось по наследству? Непонятное мне слово. Серебряный 08:47, 5 декабря 2010 (UTC)
  • Предлагайте, изменить не сложно. --Chan 09:10, 5 декабря 2010 (UTC)
    • Я бы его просто вымарал. «Группа по Балтимору». Серебряный
      • ОК. Уже. --Chan 09:17, 5 декабря 2010 (UTC)
• Я бы ожидал увидеть этот блок карточки выше блока children. Наверное, на самом верху, хотя не уверен. Серебряный 08:47, 5 декабря 2010 (UTC)
  • Сделать это можно, но я тоже не уверен. Давайте пока оставим так, до того как сформируются аргументы за или против. --Chan 09:10, 5 декабря 2010 (UTC)
• С нечувствительностью к регистру имени параметра не срослось? При полной замене шаблонов это не важно, впрочем.. Серебряный 08:47, 5 декабря 2010 (UTC)
  • Вы про ICTV? Первоначально, я сделал оба варианта (см. выше), но потом после того как обновил все статьи, решил что одного параметра (маленькими буквами ictv) будет достаточно. --Chan 09:10, 5 декабря 2010 (UTC)

Итог

Всё необходимое сделано. Дополнительные стилевые правки, при необходимости, можно будет осуществить в рабочем порядке.