Шикиматкиназа

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Шикиматкиназа
Шикиматкиназа из "Erwinia chrysanthemi".
Шикиматкиназа из "Erwinia chrysanthemi".
Идентификаторы
Символ SKI
Pfam PF01202
Pfam clan CL0023
PROSITE PDOC00868
SCOP 2shk
SUPERFAMILY 2shk
OPM superfamily 124
OPM protein 1e6c
Доступные структуры белков
Pfam структуры
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum 3D-модель
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе
Шикиматкиназа
Мультипликационное изображение шикиматкиназы из Mycobacterium tuberculosis. α-гели показаны красным цветом, центральный β-лист - желтым, а петли - зеленым.
Мультипликационное изображение шикиматкиназы из Mycobacterium tuberculosis. α-гели показаны красным цветом, центральный β-лист - желтым, а петли - зеленым.
Идентификаторы
Шифр КФ 2.7.1.71
Номер CAS 9031-51-0
Базы ферментов
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
MetaCyc metabolic pathway
KEGG KEGG entry
PRIAM profile
PDB structures RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Gene Ontology AmiGO • EGO
Поиск
PMC статьи
PubMed статьи
NCBI NCBI proteins
CAS 9031-51-0
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Шикиматкиназа (Шифр КФ 2.7.1.71) представляет собой фермент, катализирующий АТФ-зависимое фосфорилирование шикимата с образованием шикимат-3-фосфата[1]. Эта реакция является пятым этапом пути шикимата[2], который используется растениями и бактериями для синтеза общего предшественника ароматических аминокислот и вторичных метаболитов. Систематическое название этого класса ферментов — АТФ: шикимат-3-фосфотрансфераза. Другие широко используемые названия включают шикиматкиназу (фосфорилирование) и шикиматкиназу II.

Общее описание

[править | править код]

Путь шикимата состоит из семи ферментативных реакций, посредством которых фосфоенолпируват и эритрозо-4-фосфат превращаются в хоризмат, общий предшественник ароматических аминокислот фенилаланина, тирозина и триптофана. Ароматические аминокислоты используются в синтезе белков и в растениях, грибах и бактериях дают начало ряду других специализированных метаболитов, таких как фенилпропаноиды и алкалоиды. Хорисмат и несколько других промежуточных продуктов этого пути служат предшественниками ряда других метаболитов, таких как фолаты, хинаты и хиноны. Четыре фермента, которые предшествуют шикиматкиназы в этом пути, — это DAHP-синтаза, 3-дегидрохинатсинтаза, 3-дегидрохинатдегидратаза и шикиматдегидрогеназа, а два следующих за ним — это EPSP-синтаза и хоризматсинтаза. У грибов и простейших он является частью комплекса AROM, в котором совместно локализованы пять центральных стадий пути шикимате[3]. Путь не обнаружен у людей и других животных, которые должны получать ароматические аминокислоты из пищи.

Активность

[править | править код]

Реакция, катализируемая шикиматкиназой, показана ниже:

reaction catalyzed by shikimate kinase
реакция, катализируемая шикиматкиназой

Эта реакция включает перенос фосфатной группы от АТФ к 3-гидроксильной группе шикимата. Таким образом, шикиматкиназа имеет два субстрата, шикимат и АТФ, и два продукта, шикимат-3-фосфат и АДФ[4].

Белки человека, содержащие этот домен, включают: MAPK7 и THNSL1.

Использованная литература

[править | править код]
  1. "Shikimate kinase isoenzymes in Salmonella typhimurium". The Journal of Biological Chemistry. 243 (3): 676—7. February 1968. PMID 4866525.
  2. "The Shikimate Pathway". Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology. 50: 473—503. June 1999. doi:10.1146/annurev.arplant.50.1.473. PMID 15012217.
  3. "Architecture and functional dynamics of the pentafunctional AROM complex". Nature Chemical Biology. 16 (9): 973—978. July 2020. doi:10.1038/s41589-020-0587-9. PMID 32632294.
  4. "Mechanism of phosphoryl transfer catalyzed by shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis". Journal of Molecular Biology. 364 (3): 411—23. December 2006. doi:10.1016/j.jmb.2006.09.001. PMID 17020768.