Prosigna: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[непроверенная версия][непроверенная версия]
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
Строка 13: Строка 13:


==История разработки==
==История разработки==
Название PAM50 дано молекулярному профилю в соответствии с биоинформатическим методом обработки Prediction Analysis for Microarrays (прогностический анализ для микрочипов, PAM), который используется для обработки данных и количеством генов, экспрессия которых оценивается в ходе анализа (50 мишеней)<ref name="pmid19204204">{{cite journal |author=Parker JS, Mullins M, Cheang MC, Leung S, Voduc D, Vickery T, Davies S, Fauron C, He X, Hu Z, Quackenbush JF, Stijleman IJ, Palazzo J, Marron JS, Nobel AB, Mardis E, Nielsen TO, Ellis MJ, Perou CM, Bernard PS'' |title=Supervised risk predictor of breast cancer based on intrinsic subtypes |journal=J Clin Oncol |volume=27 |issue=8 |pages=1160–7 |year=2009 |month=March |pmid=19204204 |doi=10.1200/JCO.2008.18.1370 |url=}}</ref>.

Первые версии диагностических тестов были представлены микрочипами <ref name="pmid20012355">{{cite journal |author=Korde LA, Lusa L, McShane L, Lebowitz PF, Lukes L, Camphausen K, Parker JS, Swain SM, Hunter K, Zujewski JA |title=Gene expression pathway analysis to predict response to neoadjuvant docetaxel and capecitabine for breast cancer |journal=Breast Cancer Res Treat |volume=119 |issue=3 |pages=685-99 |year=2010 |month=February |pmid=20012355 |doi=10.1007/s10549-009-0651-3 |url=}}</ref> и количественной ОТ-ПЦР в реальном времени <ref name="pmid20837693">{{cite journal |author=Nielsen TO, Parker JS, Leung S, Voduc D, Ebbert M, Vickery T, Davies SR, Snider J, Stijleman IJ, Reed J, Cheang MC, Mardis ER, Perou CM, Bernard PS, Ellis MJ |title=A comparison of PAM50 intrinsic subtyping with immunohistochemistry and clinical prognostic factors in tamoxifen-treated estrogen receptor-positive breast cancer |journal=Clin Cancer Res |volume=16 |issue=21 |pages=5222-32 |year=2010 |month=November |pmid=20837693 |doi=10.1158/1078-0432.CCR-10-1282 |url=}}</ref>.

Система Prosigna берёт за основу молекулярный профиль PAM50 и рассчитывает степени риска для пациента с учётом стадии опухоли. Весь процесс работы осуществляется в закрытой системе. Результатом исследования является отнесение опухоли к тому или иному подтипу и числовой индекс риска рецидива. Для оценки экспрессионного профиля используется методика молекулярных флуоресцентных штрих-кодов. Всё необходимое для исследования поставляет компания NanoString Technologies, обладающая патентом на данную разработку <ref>{{cite web|url=http://http://www.faqs.org/patents/app/20130337444 |title=United States Patent: 20130337444|date= 12-19-2013}}</ref>.

<!--
Порядок следования разделов см.
[[Википедия:Оформление статей#Структура статьи]]
-->



== См. также ==
== См. также ==

Версия от 11:34, 4 февраля 2014

Prosigna — это диагностический тест, предназначенный для оценки риска рецидива при гормон-зависимом раке молочной железы. В основе теста лежит оценка экспрессионного профиля 50 мРНК в опухолевых клеток. Данный профиль описан в литературе под названием PAM50 и может быть оценен различными молекулярно-биологическими методами (ОТ-ПЦР, ДНК-микрочипы). Диагностический тест Prosigna позволяет проводить оценку экспрессии мРНК методом молекулярных флуоресцентных штрих-кодов, и является стандартизированным и автоматизированным методом исследования. Разработка системы Prosigna на основе молекулярного профиля PAM50 принадлежит компании NanoString Technologies. NanoString Technologies производит реактивы, оборудование и программное обеспечение для проведения исследования с помощью данного теста.

Назначение

Диагностическая система Prosigna предназначена для оценки риска рецидива гормонально-зависимого рака молочной железы в следующих случаях:

  • Для оценки риска отдалённого рецидива в течение 10 лет у женщин в пост-менопаузе, при раке без вовлечения лимфатических узлов (стадия I - II), с целью принятия решения о назначении гормональной адъювантной терапии.
  • Для оценки риска отдалённого рецидива в течение 10 лет у женщин в пост-менопаузе, при вовлечении 1-3 лимфатических узлов или более 4 лифатических узлов (стадия II - IIIA) с целью принятия решения о назначении гормональной терапии (лечения такими препаратами как Тамоксифен).

Низкие показатели риска позволяют отказаться от назначения химиотерапии, то есть повысить качество жизни пациентки. Особенно значимо проведение данного теста при вовлечении 1-3 лимфатических узлов, поскольку раньше во всех подобных случаях принято было назначить химиотерапию, однако исследования значения профиля PAM50 показали, что в ряде случаев этого можно избежать [1]. Процедура автоматизированного анализа результатов включает не только собранные в ходе исследования данные об экспрессионном профиле, но и сведения о размере, опухоли и вовлечении лимфатических узлов. Результатом анализа является отнесение пациента к группе "низкого", "промежуточного" или "высокого" риска. [2], а также отнесение опухоли к одному из подтипов: люминальный рак A, люминальный рак B, HER2-положительный рак или трижды-негативный рак. [1]

История разработки

Название PAM50 дано молекулярному профилю в соответствии с биоинформатическим методом обработки Prediction Analysis for Microarrays (прогностический анализ для микрочипов, PAM), который используется для обработки данных и количеством генов, экспрессия которых оценивается в ходе анализа (50 мишеней)[3]. Первые версии диагностических тестов были представлены микрочипами [4] и количественной ОТ-ПЦР в реальном времени [5]. Система Prosigna берёт за основу молекулярный профиль PAM50 и рассчитывает степени риска для пациента с учётом стадии опухоли. Весь процесс работы осуществляется в закрытой системе. Результатом исследования является отнесение опухоли к тому или иному подтипу и числовой индекс риска рецидива. Для оценки экспрессионного профиля используется методика молекулярных флуоресцентных штрих-кодов. Всё необходимое для исследования поставляет компания NanoString Technologies, обладающая патентом на данную разработку [6].

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 Gnant M, Filipits M, Greil R, Stoeger H, Rudas M, Bago-Horvath Z, Mlineritsch B, Kwasny W, Knauer M, Singer C, Jakesz R, Dubsky P, Fitzal F, Bartsch R, Steger G, Balic M, Ressler S, Cowens JW, Storhoff J, Ferree S, Schaper C, Liu S, Fesl C, Nielsen TO; Austrian Breast and Colorectal Cancer Study Group. (2014). "Predicting distant recurrence in receptor-positive breast cancer patients with limited clinicopathological risk: using the PAM50 Risk of Recurrence score in 1478 postmenopausal patients of the ABCSG-8 trial treated with adjuvant endocrine therapy alone". Ann Oncol. 25 (2): 339–45. doi:10.1093/annonc/mdt494. PMID 24347518. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  2. ↑ Dowsett M, Sestak I, Lopez-Knowles E, Sidhu K, Dunbier AK, Cowens JW, Ferree S, Storhoff J, Schaper C, Cuzick J. (2013). "Comparison of PAM50 risk of recurrence score with oncotype DX and IHC4 for predicting risk of distant recurrence after endocrine therapy". J Clin Oncol. 31 (22): 2783—90. doi:10.1200/JCO.2012.46.1558. PMID 23816962. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  3. ↑ Parker JS, Mullins M, Cheang MC, Leung S, Voduc D, Vickery T, Davies S, Fauron C, He X, Hu Z, Quackenbush JF, Stijleman IJ, Palazzo J, Marron JS, Nobel AB, Mardis E, Nielsen TO, Ellis MJ, Perou CM, Bernard PS (2009). "Supervised risk predictor of breast cancer based on intrinsic subtypes". J Clin Oncol. 27 (8): 1160—7. doi:10.1200/JCO.2008.18.1370. PMID 19204204. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  4. ↑ Korde LA, Lusa L, McShane L, Lebowitz PF, Lukes L, Camphausen K, Parker JS, Swain SM, Hunter K, Zujewski JA (2010). "Gene expression pathway analysis to predict response to neoadjuvant docetaxel and capecitabine for breast cancer". Breast Cancer Res Treat. 119 (3): 685–99. doi:10.1007/s10549-009-0651-3. PMID 20012355. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  5. ↑ Nielsen TO, Parker JS, Leung S, Voduc D, Ebbert M, Vickery T, Davies SR, Snider J, Stijleman IJ, Reed J, Cheang MC, Mardis ER, Perou CM, Bernard PS, Ellis MJ (2010). "A comparison of PAM50 intrinsic subtyping with immunohistochemistry and clinical prognostic factors in tamoxifen-treated estrogen receptor-positive breast cancer". Clin Cancer Res. 16 (21): 5222–32. doi:10.1158/1078-0432.CCR-10-1282. PMID 20837693. {{cite journal}}: Неизвестный параметр |month= игнорируется (справка)Википедия:Обслуживание CS1 (множественные имена: authors list) (ссылка)
  6. ↑ United States Patent: 20130337444 (12-19-2013).

Литература

Ссылки

  • [[1]] - Официальный сайт  (англ.)
  • [[2]] - Краткое описание процесса работы на русском языке
Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Prosigna&oldid=61201950