UBTF: различия между версиями
| [отпатрулированная версия] | [отпатрулированная версия] |
Minina (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
Minina (обсуждение | вклад) Нет описания правки |
||
| Строка 49: | Строка 49: | ||
== Функции == |
== Функции == |
||
Долгое время считалось, что единственная функция UBTF — участие образование преинициаторного комплекса на промоторах рДНК. Согласно одной из моделей, UBTF связывает вышестоящие и коровые промоторные элементы, в результате чего образуется петля ДНК. Благодаря этом UBTF может взаимодействовать с транскрипционным фактором TIF-1B. Образующийся комплекс привлекает РНК-полимеразу I. Впрочем, в настоящее время настоящий механизм образования преинициаторного комплекса и роль UBTF в инициации транскрипции рДНК менее ясны: показано, что в условиях ''in vitro'' UBTF не является совершенно необходимым для инициации транскрипции<ref name="f">{{cite pmid|19717978}}</ref>. |
Долгое время считалось, что единственная функция UBTF — участие образование преинициаторного комплекса на промоторах рДНК. Согласно одной из моделей, UBTF связывает вышестоящие и коровые промоторные элементы, в результате чего образуется петля ДНК, на которой собирается похожий на нуклеосому белковый комплекс. Благодаря этом UBTF может взаимодействовать с транскрипционным фактором TIF-1B. Образующийся комплекс привлекает РНК-полимеразу I. Впрочем, в настоящее время настоящий механизм образования преинициаторного комплекса и роль UBTF в инициации транскрипции рДНК менее ясны: показано, что в условиях ''in vitro'' UBTF не является совершенно необходимым для инициации транскрипции<ref name="f">{{cite pmid|19717978}}</ref>. |
||
Имеется ряд свидетельств участия UBTF в перестройках хроматина. Показано, что UBTF необходим для поддержания структуры эухроматина в области активных ядрышковых организаторов. Возможно, что это связано с конкурентным вытеснением UBTF линкерного гистона H1, который участвует в гетерохроматинизации. Таким образом, UBTF препятствует образованию гетерохроматина в области рДНК и способствует поддержанию активной конформации хроматина<ref name="f" />. |
Имеется ряд свидетельств участия UBTF в перестройках хроматина. Показано, что UBTF необходим для поддержания структуры эухроматина в области активных ядрышковых организаторов. Возможно, что это связано с конкурентным вытеснением UBTF линкерного гистона H1, который участвует в гетерохроматинизации. Таким образом, UBTF препятствует образованию гетерохроматина в области рДНК и способствует поддержанию активной конформации хроматина<ref name="f" />. |
||
Показано, что у мышей метилирование динуклеотида CpG в позиции -133 относительно коровой части промотора рДНК ядрышковым комплексом ремоделирования NoRC обеспечивает транскрипционный сайленсинг генов рРНК и уменьшает связывание UBTF с промоторами рДНК. В конечных стадиях дифференцировки промиелоцитов мыши сайленсинг рДНК увеличивается, при этом связывание UBTF с повторами рДНК также уменьшается. Поскольку экспрессия UBTF постепенно сокращается на конечных стадиях дифференцировки многих клеточных линий, возможно, что регуляция UBTF служит ключевым механизмом сайленсинга рДНК в ходе развития<ref name="f" />. |
Показано, что у мышей метилирование динуклеотида CpG в позиции -133 относительно коровой части промотора рДНК ядрышковым комплексом ремоделирования NoRC обеспечивает транскрипционный сайленсинг генов рРНК и уменьшает связывание UBTF с промоторами рДНК. В конечных стадиях дифференцировки промиелоцитов мыши сайленсинг рДНК увеличивается, при этом связывание UBTF с повторами рДНК также уменьшается. Поскольку экспрессия UBTF постепенно сокращается на конечных стадиях дифференцировки многих клеточных линий, возможно, что регуляция UBTF служит ключевым механизмом сайленсинга рДНК в ходе развития<ref name="f" />. Действительно, при помощи делеции UBTF было показано, что UBTF необходим для развития зародыша до стадии морулы<ref name="npb">{{cite pmid|25121932}}</ref>. |
||
Интересно, что утрата UBTF индуцировала образование в ооцитах и ранних эмбрионах крупных внутриядерных структур, похожих на тельца-предшественники ядрышек (NPB)<ref name="npb" />. |
|||
В 2015 году было показано, что UBTF участвует в поддержании стабильности генома, регулируя гены, активно транскрибируемые РНК-полимеразой II<ref>{{cite pmid|25452314}}</ref>. |
|||
== Клиническое значение == |
|||
Вирус простого герпеса первого типа вызывает перемещение UBTF из ядрышка клетки-хозяина в компартменты репликации вируса. Однако было показано, что UBTF не способствует репликации вируса, а, напротив, подавляет её<ref>{{cite pmid|25965800}}</ref>. |
|||
Показано, что у пациентов в гепатоцеллюлярной карциномой наблюдаются повышенный уровень экспрессии UBTF, оказывающий онкогенный эффект. Оказалось, что белок HBx вируса гепатита B активирует злокачественное перерождение клеток через c-Myc-зависимое усиление экспрессии UBTF<ref>{{cite pmid|25890091}}</ref>. |
|||
Показана связь между утратой волос у человека и уровнем экспрессии UBTF<ref>{{cite pmid|26866305}}</ref>. |
|||
== Примечания == |
== Примечания == |
||
{{примечания}} |
{{примечания|2}} |
||
[[Категория:Белки человека]] |
[[Категория:Белки человека]] |
||
Версия от 07:04, 30 апреля 2016
UBTF (англ. upstream binding transcription factor, RNA polymerase I, другие названия UBF; UBF1; UBF2; UBF-1; NOR-90) — ядрышковый транскрипционный фактор, регулирующий транскрипцию генов рРНК РНК-полимеразой I. Он также участвует в процессинге пре-рРНК. У человека кодируется геном UBTF, расположенным на 17-ой хромосоме[1].
Ген и изоформы
Ген UBTF у человека находится на 17-ой хромосоме в локусе 17q21.31 и содержит 25 экзонов. Известен ряд изоформ белка UBTF, которые образуются из-за альтернативного сплайсинга первичных транскриптов гена UBTF. Псевдогены этого гена располагаются на коротких плечах хромосом 3, 11 и Х, а также длинном плече хромосомы 11[1].
Внутриклеточная локализация
UBTF — ядрышковый белок. Он обнаруживается в двух ядрышковых компонентах — плотном фибриллярном компоненте и фибриллярных центрах. На клетках HeLa было показано, что ядрышковая локализация UBTF связана с интенсивностью транскрипции генов рРНК (рДНК). В ядрышках, имеющих единственный крупный фибриллярный центр (такие ядрышки характеризуются низким уровнем транскрипции рДНК), UBTF располагается преимущественно там. Однако в ядрышках, характеризующихся интенсивной транскрипцией рДНК и и имеющих множество мелких фибриллярных центров, UBTF локализуется в основном на границе фибриллярных центров и плотного фибриллярного компонента[2].
Функции
Долгое время считалось, что единственная функция UBTF — участие образование преинициаторного комплекса на промоторах рДНК. Согласно одной из моделей, UBTF связывает вышестоящие и коровые промоторные элементы, в результате чего образуется петля ДНК, на которой собирается похожий на нуклеосому белковый комплекс. Благодаря этом UBTF может взаимодействовать с транскрипционным фактором TIF-1B. Образующийся комплекс привлекает РНК-полимеразу I. Впрочем, в настоящее время настоящий механизм образования преинициаторного комплекса и роль UBTF в инициации транскрипции рДНК менее ясны: показано, что в условиях in vitro UBTF не является совершенно необходимым для инициации транскрипции[3].
Имеется ряд свидетельств участия UBTF в перестройках хроматина. Показано, что UBTF необходим для поддержания структуры эухроматина в области активных ядрышковых организаторов. Возможно, что это связано с конкурентным вытеснением UBTF линкерного гистона H1, который участвует в гетерохроматинизации. Таким образом, UBTF препятствует образованию гетерохроматина в области рДНК и способствует поддержанию активной конформации хроматина[3].
Показано, что у мышей метилирование динуклеотида CpG в позиции -133 относительно коровой части промотора рДНК ядрышковым комплексом ремоделирования NoRC обеспечивает транскрипционный сайленсинг генов рРНК и уменьшает связывание UBTF с промоторами рДНК. В конечных стадиях дифференцировки промиелоцитов мыши сайленсинг рДНК увеличивается, при этом связывание UBTF с повторами рДНК также уменьшается. Поскольку экспрессия UBTF постепенно сокращается на конечных стадиях дифференцировки многих клеточных линий, возможно, что регуляция UBTF служит ключевым механизмом сайленсинга рДНК в ходе развития[3]. Действительно, при помощи делеции UBTF было показано, что UBTF необходим для развития зародыша до стадии морулы[4].
Интересно, что утрата UBTF индуцировала образование в ооцитах и ранних эмбрионах крупных внутриядерных структур, похожих на тельца-предшественники ядрышек (NPB)[4].
В 2015 году было показано, что UBTF участвует в поддержании стабильности генома, регулируя гены, активно транскрибируемые РНК-полимеразой II[5].
Клиническое значение
Вирус простого герпеса первого типа вызывает перемещение UBTF из ядрышка клетки-хозяина в компартменты репликации вируса. Однако было показано, что UBTF не способствует репликации вируса, а, напротив, подавляет её[6].
Показано, что у пациентов в гепатоцеллюлярной карциномой наблюдаются повышенный уровень экспрессии UBTF, оказывающий онкогенный эффект. Оказалось, что белок HBx вируса гепатита B активирует злокачественное перерождение клеток через c-Myc-зависимое усиление экспрессии UBTF[7].
Показана связь между утратой волос у человека и уровнем экспрессии UBTF[8].
Примечания
- ↑ 1 2 UBTF upstream binding transcription factor, RNA polymerase I [ Homo sapiens (human) ].
- ↑ He J., Wu X., Tao W. Nucleolar localization of upstream binding factor in HeLa cells depends on rRNA synthesis activities. (англ.) // Folia biologica. — 2008. — Vol. 54, no. 6. — P. 202—206. — PMID 19393134.
- ↑ 1 2 3 Sanij E., Hannan R. D. The role of UBF in regulating the structure and dynamics of transcriptionally active rDNA chromatin. (англ.) // Epigenetics. — 2009. — Vol. 4, no. 6. — P. 374—382. — PMID 19717978.
- ↑ 1 2 Hamdane N., Stefanovsky V. Y., Tremblay M. G., Németh A., Paquet E., Lessard F., Sanij E., Hannan R., Moss T. Conditional inactivation of Upstream Binding Factor reveals its epigenetic functions and the existence of a somatic nucleolar precursor body. (англ.) // PLoS genetics. — 2014. — Vol. 10, no. 8. — P. e1004505. — doi:10.1371/journal.pgen.1004505. — PMID 25121932.
- ↑ Sanij E., Diesch J., Lesmana A., Poortinga G., Hein N., Lidgerwood G., Cameron D. P., Ellul J., Goodall G. J., Wong L. H., Dhillon A. S., Hamdane N., Rothblum L. I., Pearson R. B., Haviv I., Moss T., Hannan R. D. A novel role for the Pol I transcription factor UBTF in maintaining genome stability through the regulation of highly transcribed Pol II genes. (англ.) // Genome research. — 2015. — Vol. 25, no. 2. — P. 201—212. — doi:10.1101/gr.176115.114. — PMID 25452314.
- ↑ Ouellet Lavall G., Pearson A. Upstream binding factor inhibits herpes simplex virus replication. (англ.) // Virology. — 2015. — Vol. 483. — P. 108—116. — doi:10.1016/j.virol.2015.04.003. — PMID 25965800.
- ↑ Rajput P., Shukla S. K., Kumar V. The HBx oncoprotein of hepatitis B virus potentiates cell transformation by inducing c-Myc-dependent expression of the RNA polymerase I transcription factor UBF. (англ.) // Virology journal. — 2015. — Vol. 12. — P. 62. — doi:10.1186/s12985-015-0293-5. — PMID 25890091.
- ↑ Tasdemir S., Eroz R., Dogan H., Erdem H. B., Sahin I., Kara M., Engin R. I., Turkez H. Association Between Human Hair Loss and the Expression Levels of Nucleolin, Nucleophosmin, and UBTF Genes. (англ.) // Genetic testing and molecular biomarkers. — 2016. — Vol. 20, no. 4. — P. 197—202. — doi:10.1089/gtmb.2015.0246. — PMID 26866305.