↑ Количество игр и голов за профессиональный клуб считается только для различных лиг национальных чемпионатов, обновлено по состоянию на 14 мая 2021 года.
↑ Количество игр и голов за национальную сборную в официальных матчах, обновлено по состоянию на 10 июля 2021 года.
Себастьян — воспитанник футбольной академии клуба «Атлетико Насьональ», за основной состав дебютировал в 2011 году и выиграл с «Атлетико» чемпионат Колумбии. Перес стал самым молодым игроком выигрывавшим этот трофей. На следующий сезон Перес стал обладателем Кубка Колумбии и Суперкубка.
Летом 2013 года, после молодёжного чемпионата мира, Перес был приглашён на просмотр в лондонский «Арсенал»[3]. Он произвёл неплохое впечатление своей игрой в товарищеском матче с «Манчестер Сити»[4], однако не смог получить разрешение на работу в Великобритании, и вернулся в «Атлетико Насьональ»[5].
В 2011 году Перес был включён в состав сборной Колумбии до 20 лет на домашний чемпионат мира, где сыграл около 30 минут, выйдя на замену во втором тайме матча 1/16 финала со сборной Коста-Рики. В январе 2013 тренер молодёжной сборной Колумбии Карлос Растрепо включил Переса в заявку команды для участия в молодёжном чемпионате Южной Америки в Аргентине. По итогам турнира колумбийцы заняли первое место и получили возможность принять участие в молодёжном чемпионате мира 2013, где Перес вышел с первых минут во всех четырёх матчах сборной.