DDX17

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Геликаза 17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) бокса
Идентификаторы
Символ DDX17 ; P72; RH70
Внешние ID OMIM: 608469 MGI1914290 HomoloGene101101 GeneCards: DDX17 Gene
номер EC 3.6.4.13
Профиль экспрессии РНК
PBB GE DDX17 208151 x at tn.png
PBB GE DDX17 208718 at tn.png
PBB GE DDX17 208719 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 10521 67040
Ensembl ENSG00000100201 ENSMUSG00000055065
UniProt Q92841 Q501J6
RefSeq (мРНК) NM_001098504 NM_001040187
RefSeq (белок) NP_001091974 NP_001035277
Локус (UCSC) Chr 22:
38.88 – 38.9 Mb
Chr 15:
79.53 – 79.55 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]

Предполагаемая АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX17 (р72)  — фермент, кодируемый у человека геном DDX17[1][2].

Функция[править | править вики-текст]

Белки DEAD бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), и предположительно являются РНК геликазами. Они участвуют во многих клеточных процессах, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, сборка рибосом и сплайсосомы. Основываясь на характере их распространения, предполагаю, что некоторые члены этого семейства участвует в эмбриогенезе, сперматогенезе а также клеточном росте и делении. Этот ген (DDX17) кодирует белок DEAD бокса, который АТФазой, активируемой с помощью различных видов РНК, но не двухцепочечной ДНК. Этот белок и тот, что кодирован геном DDX5 состоят друг с другом в более тесном родстве, чем с любым другим членом семейства DEAD бокса. Альтернативный сплайсинг этого гена даёт два варианта транскриптов, кодирующих различные изоформ белка, при этом, сообщается, что более длинный транскрипт способен инициировать трансляцию с CUG кодона, а не с AUG, как прочие белки[2].

Взаимодействия[править | править вики-текст]

DDX17, как было выявлено, взаимодействует с:

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Lamm G. M., Nicol S. M., Fuller-Pace F. V., Lamond A. I. p72: a human nuclear DEAD box protein highly related to p68. (англ.) // Nucleic acids research. — 1996. — Vol. 24, no. 19. — P. 3739—3747. — PMID 8871553. исправить
  2. 1 2 Entrez Gene: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 17.
  3. Ogilvie V. C., Wilson B. J., Nicol S. M., Morrice N. A., Saunders L. R., Barber G. N., Fuller-Pace F. V. The highly related DEAD box RNA helicases p68 and p72 exist as heterodimers in cells. (англ.) // Nucleic acids research. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 1470—1480. — PMID 12595555. исправить
  4. Wilson B. J., Giguère V. Identification of novel pathway partners of p68 and p72 RNA helicases through Oncomine meta-analysis. (англ.) // BMC genomics. — 2007. — Vol. 8. — P. 419. — DOI:10.1186/1471-2164-8-419. — PMID 18005418. исправить
  5. 1 2 3 4 5 Watanabe M., Yanagisawa J., Kitagawa H., Takeyama K., Ogawa S., Arao Y., Suzawa M., Kobayashi Y., Yano T., Yoshikawa H., Masuhiro Y., Kato S. A subfamily of RNA-binding DEAD-box proteins acts as an estrogen receptor alpha coactivator through the N-terminal activation domain (AF-1) with an RNA coactivator, SRA. (англ.) // The EMBO journal. — 2001. — Vol. 20, no. 6. — P. 1341—1352. — DOI:10.1093/emboj/20.6.1341. — PMID 11250900. исправить
  6. Wilson B. J., Bates G. J., Nicol S. M., Gregory D. J., Perkins N. D., Fuller-Pace F. V. The p68 and p72 DEAD box RNA helicases interact with HDAC1 and repress transcription in a promoter-specific manner. (англ.) // BMC molecular biology. — 2004. — Vol. 5. — P. 11. — DOI:10.1186/1471-2199-5-11. — PMID 15298701. исправить