POLR2E

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Полипептид E РНК-полимеразы II (управляемой ДНК), 25kDa
Идентификаторы
Символ POLR2E ; RPABC1; RPB5; XAP4; hRPB25; hsRPB5
Внешние ID OMIM: 180664 MGI1913670 HomoloGene2018 GeneCards: POLR2E Gene
номер EC 2.7.7.6
Профиль экспрессии РНК
PBB GE POLR2E 217854 s at tn.png
PBB GE POLR2E 213887 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 5434 66420
Ensembl ENSG00000099817 ENSMUSG00000004667
UniProt P19388 Q80UW8
RefSeq (мРНК) NM_002695 NM_025554
RefSeq (белок) NP_002686 NP_079830
Локус (UCSC) Chr 19:
1.09 – 1.1 Mb
Chr 10:
80.04 – 80.04 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]

Субъединица RPABC1 ДНК-зависимой РНК-полимеразы I, II и III  — белок, кодируемый у человека геном POLR2E .[1]

Этот ген кодирует пятую по величине субъединицу РНК-полимеразы II, полимеразы, ответственной за синтез РНК у эукариот. Эта субъединица является общей для двух других ДНК-зависимых РНК-полимераз и её концкентрация в два раза выше чем концентрация других субъединиц полимеразы. Было показано взаимодействие между этой субъединицей и трансактивацией белка вируса гепатита. Предполагается, что взаимодействие между активатором транскрипции и полимеразой может происходить через эту субъединицу. Псевдоген этого гнена расположен на хромосоме 11[2].

Взаимодействия[править | править вики-текст]

POLR2E, как было выявлено, взаимодействует с:

TAF15, [3] POLR2C, [4] POLR2G, [4] POLR2H, [4] POLR2A, [4] POLR2B, [4] POLR2L[4] и GTF2F2[5].

Примечания[править | править вики-текст]

  1. Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, Roeckel N, Depetris D, Vigneron M, Kedinger C (Aug 1994). «Chromosomal localization of human RNA polymerase II subunit genes». Genomics 20 (3): 496–9. DOI:10.1006/geno.1994.1208. PMID 8034326.
  2. Entrez Gene: POLR2E polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide E, 25kDa.
  3. Bertolotti, A (Mar 1998). «EWS, but not EWS-FLI-1, is associated with both TFIID and RNA polymerase II: interactions between two members of the TET family, EWS and hTAFII68, and subunits of TFIID and RNA polymerase II complexes». Mol. Cell. Biol. 18 (3): 1489–97. ISSN 0270-7306. PMID 9488465.
  4. 1 2 3 4 5 6 Acker, J (Jul 1997). «Interactions between the human RNA polymerase II subunits». J. Biol. Chem. 272 (27): 16815–21. DOI:10.1074/jbc.272.27.16815. ISSN 0021-9258. PMID 9201987.
  5. Wei, W (Apr 2001). «Direct interaction between the subunit RAP30 of transcription factor IIF (TFIIF) and RNA polymerase subunit 5, which contributes to the association between TFIIF and RNA polymerase II». J. Biol. Chem. 276 (15): 12266–73. DOI:10.1074/jbc.M009634200. ISSN 0021-9258. PMID 11278533.

Литература[править | править вики-текст]

  • Jeang KT (1998). «Tat, Tat-associated kinase, and transcription.». J. Biomed. Sci. 5 (1): 24–7. DOI:10.1007/BF02253352. PMID 9570510.
  • Yankulov K, Bentley D (1998). «Transcriptional control: Tat cofactors and transcriptional elongation.». Curr. Biol. 8 (13): R447–9. DOI:10.1016/S0960-9822(98)70289-1. PMID 9651670.
  • Romano G, Kasten M, De Falco G, et al. (2000). «Regulatory functions of Cdk9 and of cyclin T1 in HIV tat transactivation pathway gene expression.». J. Cell. Biochem. 75 (3): 357–68. DOI:10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID 10536359.
  • Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). «Multiple modes of transcriptional regulation by the HIV-1 Tat transactivator.». IUBMB Life 51 (3): 175–81. DOI:10.1080/152165401753544241. PMID 11547919.
  • Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). «The regulation of HIV-1 transcription: molecular targets for chemotherapeutic intervention.». Med Res Rev 26 (5): 595–625. DOI:10.1002/med.20081. PMID 16838299.
  • Harrich D, McMillan N, Munoz L, et al. (2007). «Will diverse Tat interactions lead to novel antiretroviral drug targets?». Current drug targets 7 (12): 1595–606. DOI:10.2174/138945006779025338. PMID 17168834.
  • Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, et al. (1992). «HIV-1 Tat acts as a processivity factor in vitro in conjunction with cellular elongation factors.». Genes Dev. 6 (4): 655–66. DOI:10.1101/gad.6.4.655. PMID 1559613.
  • Pati UK, Weissman SM (1991). «Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II.». J. Biol. Chem. 266 (20): 13468. PMID 2071613.
  • Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). «Activation of transcription by HIV-1 Tat protein tethered to nascent RNA through another protein.». Nature 345 (6276): 640–2. DOI:10.1038/345640a0. PMID 2190099.
  • Pati UK, Weissman SM (1989). «Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II.». J. Biol. Chem. 264 (22): 13114–21. PMID 2753903.
  • Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). «Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92 (16): 7153–7. DOI:10.1073/pnas.92.16.7153. PMID 7638159.
  • Cheong JH, Yi M, Lin Y, Murakami S (1995). «Human RPB5, a subunit shared by eukaryotic nuclear RNA polymerases, binds human hepatitis B virus X protein and may play a role in X transactivation.». EMBO J. 14 (1): 143–50. PMID 7828586.
  • Herrmann CH, Rice AP (1995). «Lentivirus Tat proteins specifically associate with a cellular protein kinase, TAK, that hyperphosphorylates the carboxyl-terminal domain of the large subunit of RNA polymerase II: candidate for a Tat cofactor.». J. Virol. 69 (3): 1612–20. PMID 7853496.
  • Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). «Human immunodeficiency virus type-1 Tat is an integral component of the activated transcription-elongation complex.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (6): 2505–10. DOI:10.1073/pnas.93.6.2505. PMID 8637904.
  • Yang X, Herrmann CH, Rice AP (1996). «The human immunodeficiency virus Tat proteins specifically associate with TAK in vivo and require the carboxyl-terminal domain of RNA polymerase II for function.». J. Virol. 70 (7): 4576–84. PMID 8676484.
  • Agostini I, Navarro JM, Rey F, et al. (1996). «The human immunodeficiency virus type 1 Vpr transactivator: cooperation with promoter-bound activator domains and binding to TFIIB.». J. Mol. Biol. 261 (5): 599–606. DOI:10.1006/jmbi.1996.0485. PMID 8800208.
  • Zhou Q, Sharp PA (1996). «Tat-SF1: cofactor for stimulation of transcriptional elongation by HIV-1 Tat.». Science 274 (5287): 605–10. DOI:10.1126/science.274.5287.605. PMID 8849451.
  • Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, et al. (1996). «Trans-activation by human immunodeficiency virus Tat protein requires the C-terminal domain of RNA polymerase II.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (21): 11575–9. DOI:10.1073/pnas.93.21.11575. PMID 8876177.
  • Chun RF, Jeang KT (1996). «Requirements for RNA polymerase II carboxyl-terminal domain for activated transcription of human retroviruses human T-cell lymphotropic virus I and HIV-1.». J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–94. DOI:10.1074/jbc.271.44.27888. PMID 8910388.