TOPORS

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Данная страница не проверялась участниками с соответствующими правами.
Перейти к навигации Перейти к поиску
Связанная с топоизомеразой I, богатая аргинином/серином, убиквитин-лигаза белка Е3
Идентификаторы
Символ TOPORS ; LUN; P53BP3; RP31; TP53BPL
Внешние ID OMIM: 609507 MGI: 2146189 HomoloGene: 4237 GeneCards: Ген TOPORS
Генная онтология
Функция • DNA binding

• antigen binding
• ubiquitin-protein transferase activity
• protein binding
• zinc ion binding
• SUMO ligase activity

• DNA topoisomerase binding
Компонент клетки • ubiquitin ligase complex

• spindle pole
• gamma-tubulin complex
• nucleus
• centriole
• cytoplasmic dynein complex
• PML body
• nuclear speck
• midbody
• photoreceptor connecting cilium

• ciliary basal body
Биологический процесс • transcription, DNA-templated

• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein monoubiquitination
• cellular response to DNA damage stimulus
• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
• retina layer formation
• protein sumoylation
• protein localization to nucleus
• photoreceptor cell outer segment organization
• regulation of cell proliferation
• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator
• negative regulation of apoptotic process
• proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• retinal rod cell development
• retinal cone cell development
• positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity
• maintenance of protein location in nucleus

• protein K48-linked ubiquitination
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 10210 106021
Ensembl ENSG00000197579 ENSMUSG00000036822
UniProt Q9NS56 Q80Z37
RefSeq (мРНК) NM_001195622 NM_134097
RefSeq (белок) NP_001182551 NP_598858
Локус (UCSC) Chr 9:
32.54 – 32.55 Mb		 Chr 4:
40.26 – 40.27 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Убиквитин-лигаза белка Е3 Topors является ферментом, который у человека кодируется геном TOPORS .[1][2][3][4] Этот ген кодирует ядерный белок, богатый серином и аргинином и содержит домен цинкового пальца RING-типа. Он сильно выражен в семенниках и функционирует в качестве убиквитин-лигазы белка E3. Мутации в этом гене связаны с пигментным ретинитом типа 31. Альтернативные варианты сплайсинга, кодирующих различные изоформы, были характерны и для этого локуса.

Примечания

[править | править код]
  1. ↑ Haluska P Jr, Saleem A., Rasheed Z., Ahmed F., Su E.W., Liu L.F., Rubin E.H. Interaction between human topoisomerase I and a novel RING finger/arginine-serine protein (англ.) // Nucleic Acids Res : journal. — 1999. — July (vol. 27, no. 12). — P. 2538—2544. — doi:10.1093/nar/27.12.2538. — PMID 10352183. — PMC 148458.
  2. ↑ Rasheed Z.A., Saleem A., Ravee Y., Pandolfi P.P., Rubin E.H. The topoisomerase I-binding RING protein, topors, is associated with promyelocytic leukemia nuclear bodies (англ.) // Exp Cell Res[англ.] : journal. — 2002. — June (vol. 277, no. 2). — P. 152—160. — doi:10.1006/excr.2002.5550. — PMID 12083797.
  3. ↑ Chakarova C.F., Papaioannou M.G., Khanna H., Lopez I., Waseem N., Shah A., Theis T., Friedman J., Maubaret C., Bujakowska K., Veraitch B., Abd El-Aziz M.M., Prescott de Q., Parapuram S.K., Bickmore W.A., Munro P.M., Gal A., Hamel C.P., Marigo V., Ponting C.P., Wissinger B., Zrenner E., Matter K., Swaroop A., Koenekoop R.K., Bhattacharya S.S. Mutations in TOPORS cause autosomal dominant retinitis pigmentosa with perivascular retinal pigment epithelium atrophy (англ.) // Am J Hum Genet[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 81, no. 5). — P. 1098—1103. — doi:10.1086/521953. — PMID 17924349. — PMC 2265653.
  4. ↑ Entrez Gene: TOPORS topoisomerase I binding, arginine/serine-rich.

Литература

[править | править код]
  • Zhou R., Wen H., Ao S.Z. Identification of a novel gene encoding a p53-associated protein. (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1999. — Vol. 235, no. 1—2. — P. 93—101. — doi:10.1016/S0378-1119(99)00203-6. — PMID 10415337.
  • Souto-Carneiro M.M., Krenn V., Hermann R., et al. IgVH genes from different anatomical regions, with different histopathological patterns, of a rheumatoid arthritis patient suggest cyclic re-entry of mature synovial B-cells in the hypermutation process (англ.) // Arthritis Res. : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 4. — P. 303—314. — doi:10.1186/ar105. — PMID 11056671. — PMC 17813.
  • Chu D., Kakazu N., Gorrin-Rivas M.J., et al. Cloning and characterization of LUN, a novel ring finger protein that is highly expressed in lung and specifically binds to a palindromic sequence (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 17. — P. 14004—14013. — doi:10.1074/jbc.M010262200. — PMID 11278651.
  • Weger S., Hammer E., Heilbronn R. Topors, a p53 and topoisomerase I binding protein, interacts with the adeno-associated virus (AAV-2) Rep78/68 proteins and enhances AAV-2 gene expression (англ.) // Journal of General Virology[англ.] : journal. — Microbiology Society[англ.], 2002. — Vol. 83, no. Pt 3. — P. 511—516. — PMID 11842245.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Imabayashi H., Mori T., Gojo S., et al. Redifferentiation of dedifferentiated chondrocytes and chondrogenesis of human bone marrow stromal cells via chondrosphere formation with expression profiling by large-scale cDNA analysis (англ.) // Exp. Cell Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 288, no. 1. — P. 35—50. — doi:10.1016/S0014-4827(03)00130-7. — PMID 12878157.
  • Weger S., Hammer E., Engstler M. The DNA topoisomerase I binding protein topors as a novel cellular target for SUMO-1 modification: characterization of domains necessary for subcellular localization and sumolation (англ.) // Exp. Cell Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 290, no. 1. — P. 13—27. — doi:10.1016/S0014-4827(03)00292-1. — PMID 14516784.
  • Saleem A., Dutta J., Malegaonkar D., et al. The topoisomerase I- and p53-binding protein topors is differentially expressed in normal and malignant human tissues and may function as a tumor suppressor (англ.) // Oncogene : journal. — 2004. — Vol. 23, no. 31. — P. 5293—5300. — doi:10.1038/sj.onc.1207700. — PMID 15107820.
  • Humphray S.J., Oliver K., Hunt A.R., et al. DNA sequence and analysis of human chromosome 9 (англ.) // Nature. — 2004. — Vol. 429, no. 6990. — P. 369—374. — doi:10.1038/nature02465. — PMID 15164053. — PMC 2734081.
  • Colland F., Jacq X., Trouplin V., et al. Functional proteomics mapping of a human signaling pathway (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 7. — P. 1324—1332. — doi:10.1101/gr.2334104. — PMID 15231748. — PMC 442148.
  • Rajendra R., Malegaonkar D., Pungaliya P., et al. Topors functions as an E3 ubiquitin ligase with specific E2 enzymes and ubiquitinates p53 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 35. — P. 36440—36444. — doi:10.1074/jbc.C400300200. — PMID 15247280.
  • Beausoleil S.A., Jedrychowski M., Schwartz D., et al. Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2004. — Vol. 101, no. 33. — P. 12130—12135. — doi:10.1073/pnas.0404720101. — PMID 15302935. — PMC 514446.
  • Oyanagi H., Takenaka K., Ishikawa S., et al. Expression of LUN gene that encodes a novel RING finger protein is correlated with development and progression of non-small cell lung cancer (англ.) // Lung Cancer : journal. — 2005. — Vol. 46, no. 1. — P. 21—8. — doi:10.1016/j.lungcan.2004.03.009. — PMID 15364129.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Flatten K., Dai N.T., Vroman B.T., et al. The role of checkpoint kinase 1 in sensitivity to topoisomerase I poisons (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 14. — P. 14349—14355. — doi:10.1074/jbc.M411890200. — PMID 15699047.
  • Lin L., Ozaki T., Takada Y., et al. topors, a p53 and topoisomerase I-binding RING finger protein, is a coactivator of p53 in growth suppression induced by DNA damage (англ.) // Oncogene : journal. — 2005. — Vol. 24, no. 21. — P. 3385—3396. — doi:10.1038/sj.onc.1208554. — PMID 15735665.
  • Weger S., Hammer E., Heilbronn R. Topors acts as a SUMO-1 E3 ligase for p53 in vitro and in vivo (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 579, no. 22. — P. 5007—5012. — doi:10.1016/j.febslet.2005.07.088. — PMID 16122737.
  • Papaioannou M., Chakarova C.F., Prescott D.C., et al. A new locus (RP31) for autosomal dominant retinitis pigmentosa maps to chromosome 9p (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 2006. — Vol. 118, no. 3—4. — P. 501—503. — doi:10.1007/s00439-005-0063-3. — PMID 16189705.
Источник — https://ru.wikipedia.org/wiki/TOPORS