Участник:Alexey Karetnikov

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Алексей Каретников

Биолог (вирусология, молекулярная биология).

I believe in improving this world with my own hands and my own brain.

"Take the time and effort to correct misinformation" by Phil Williamson: http://www.nature.com/polopoly_fs/1.21106!/menu/main/topColumns/topLeftColumn/pdf/540171a.pdf

П:
Участник проекта
«Биология»
П:
Участник проекта
«Микробиология и иммунология»
П:
Участник проекта
«Нейронауки»
П:
Участник проекта
«Химия»
П:
Участник проекта
«Канада»
П:
Участник проекта
«ЛГБТ»
Радужный флаг
Этот участник интересуется ЛГБТ
Этот участник — гей
Языки участников
ru-N Русскийродной язык этого участника.
en-5 This user has professional knowledge of English.
Уровни владения языками
Герб Торонто
Участник из Торонто
Этот участник — сторонник идей
либерализма


Контакт: E-mail: alexey.karetnikov@gmail.com

Об основных научных интересах - см. ниже.

Профессиональные хобби:

1) История науки

2) Маргинальные взгляды в естественных науках, причины и механизмы их формирования

1996-2001 - кафедра клеточной физиологии и иммунологии; кафедра вирусологии; Лаборатория генетической инженерии вирусов растений, Биофак МГУ (группа доктора Сергея Морозова и доктора Андрея Соловьёва)

2001-2007 - Laboratory of Plant Physiology and Molecular Biology, Department of Biology, University of Turku (Finland) (research group of Dr. Kirsi Lehto)

2007-2009 - Laboratory of Host-Virus Interactions in the Assembly of HIV-1, Department of Virology, Haartman Institute, University of Helsinki, Finland (research group of Dr. Maarit Suomalainen)

2009-2010 - Laboratory of HIV-1 translation, Department of Biochemistry, Universite de Montreal, Quebec, Canada (research group of Dr. Lea Brakier-Gingras)

2010-2013 - Laboratory of translational control and mRNA stability (Laboratory of Dr. Nahum Sonenberg), Department of Biochemistry and Goodman Cancer Research Centre, McGill University, Montreal, Quebec, Canada

Место работы на данный момент:

Laboratory of HIV-1 gene expression (Laboratory of Dr. Alan Cochrane), Department of Molecular Genetics, University of Toronto, Canada

MSc (2001) - Биофак МГУ

PhD (2007) - University of Turku (Finland)

Область интересов:

Mолекулярная биология, вирусология:

  • Молекулярные механизмы трансляции вирусных и клеточных мРНК
  • Молекулярные механизмы трансляции и сплайсинга мРНК ВИЧ-1
  • Молекулярная механика инициации трансляции эукариот, структура и функции факторов инициации и регуляторных элементов РНК
  • Роль микроРНК в регуляции трансляции и стабильности мРНК
  • Роль IRES и нетранслируемых областей РНК в трансляции
  • Молекулярные механизмы программируемого сдвига рамки считывания рибосомы
  • Трансляционный контроль во время вирусной инфекции
  • Mеханизмы сборки ВИЧ-1

Свободно владею английским.

Основные публикации:

1. Karetnikov, A. (2015). Commentary on “Questioning the HIV-AIDS hypothesis: 30 years of dissent”. Frontiers in Public Health 3:193. doi: 10.3389/fpubh.2015.00193 (Educational critical commentary article on HIV/AIDS denialism)

2. Svitkin, Y.V., Yanagiya, A., Karetnikov, A., Alain, T., Fabian, M.R., Khoutorsky, A., Perreault, S., Topisirovic, I. & Sonenberg, N. (2013). Control of translation and miRNA-dependent repression by a novel poly(A) binding protein, hnRNP-Q. PLoS Biology 11(5):e1001564.

3. Fabian, M.R., Frank, F., Rouya, C., Siddiqui, N., Lai, W.S., Karetnikov, A., Blackshear, P.J., Nagar, B. & Sonenberg, N. (2013) Structural basis for the recruitment of the CCR4-NOT deadenylase complex by tristetraprolin. Nature Structural and Molecular Biology 20, 735-739.

4. Karetnikov, A. & Suomalainen, M. (2010). Tethered virions are intermediates in the assembly and release of HIV-1 particles. Virology 407, 289-295.

5. Karetnikov, A. & Lehto, K. (2008). Translation mechanisms involving long-distance base pairing interactions between the 5´ and 3´ non-translated regions are conserved for both genomic RNAs of Blackcurrant reversion nepovirus. Virology 371, 292-308.

6. Karetnikov, A. (2007). Role of the Blackcurrant reversion nepovirus RNA non-translated regions in translational regulation. PhD thesis. Annales Universitatis Turkuensis, ser. AII, vol. 209, University of Turku, Finland.

7. Karetnikov, A. & Lehto, K. (2007). The RNA2 5´ leader of Blackcurrant reversion virus mediates efficient in vivo translation through an internal ribosomal entry site mechanism. Journal of General Virology 88, 286-297.

8. Karetnikov, A., Keränen, M. & Lehto, K. (2006). Role of the RNA2 3´ non-translated region of Blackcurrant reversion nepovirus in translational regulation. Virology 354, 178-191.

9. Lehto, K. & Karetnikov, A. (2005). Relicts and models of the RNA world. International Journal of Astrobiology 4, 33-41.

10. Karetnikov, A., Keränen, M. & Lehto, K. (2004). 3´ Terminal sequences of Blackcurrant reversion virus (BRV) RNA2 are highly conserved in different virus isolates, and affect its translational efficiency. Acta Horticulturae (ISHS) 656, 109-114.

Презентации на международных конференциях (Invited lectures):

1. Karetnikov, A. & Suomalainen, M. (2008). Role of Vpu and host factors in HIV-1 particle release. Oral and poster presentations at the Retrovirus Assembly Meeting, 4-8.10.2008, Prague, Czech Republic.

2. Karetnikov, A. & Lehto, K. (2004). Translational regulatory elements in the RNAs of Blackcurrant reversion virus. Poster presentation at the 7th Nordic Photosynthesis Congress, 5-7.11.2004, Turku, Finland.

3. Lehto, K. & Karetnikov, A. (2004). Relicts and models of the RNA world. Oral presentation at the Nordic Congress on Astrobiology, Turku, Finland.

4. Karetnikov, A. & Lehto, K. (2004). Role of the 5' and 3' non-translated regions in the translational regulation of Blackcurrant reversion virus RNA. Poster presentation at the Translational Control Meeting, 7-12.9.2004, Cold Spring Harbor, U.S.A.

5. Karetnikov, A., Keranen, M. & Lehto, K. (2004). 3' Terminal sequences of Blackcurrant reversion irus (BRV) RNA2 are highly conserved in different virus isolates, and affect its translational efficiency. Oral presentation at the 19th International Symposium on virus and virus-like diseases of temperate fruit crops and the 10th International Symposium on small fruit virus diseases, 21-25.7.2003, Valencia, Spain.

Рецензирование статей для научных журналов (Peer reviews):

Journal of Biological Chemistry, Journal of Virology, Nucleic Acids Research, Science

Членство в научных организациях и ассоциациях:

Groupe de Recherche sur les medicaments de l'Universite de Montreal (GRUM)