Пространство имён страницы (page_namespace ) | 0 |
Название страницы (без пространства имён) (page_title ) | 'CRISPR' |
Полное название страницы (page_prefixedtitle ) | 'CRISPR' |
Вики-текст старой страницы до правки (old_wikitext ) | '[[Файл:Crispr.png|thumb|500px|right|Диаграмма, иллюстрирующая возможный механизм CRISPR.]]
'''Короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами''' ({{lang-en|CRISPR — Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats}}) — это прямые повторы, обнаруженные в ДНК многих [[бактерии|бактерий]] и [[археи|архей]]. Повторы имеют длину от 24 до 48 пар нуклеотидов. Повторы имеют бивалентную симметрию ({{lang-en|dyad symmetry}}), но, как правило, не являются истинными [[палиндром]]ами. Повторы отделены промежутками примерно одинаковой длины. Последовательности [[нуклеотид]]ов некоторых промежутков соответствуют последовательностям [[геном]]ов [[бактериофаг]]ов. В связи с этим было предположено и затем показано, что последовательности, разделяющие повторы, происходят из последовательностей геномов бактериофагов, и, соответственно, обеспечивают защиту клеток от инфекций.
В результате исследований механизма действия CRISPR было сделано предположение о том, что данная система прокариот является аналогом системы [[РНК-интерференция|РНК-интерференции]], представленной в клетках эукариот и обеспечивает бактериям и археям защиту от бактерифагов.
== Литература ==
# {{cite journal | author=Pourcel C, Salvignol G, Vergnaud G | title=CRISPR elements in ''Yersinia pestis'' acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies | journal=Microbiology | year=2005 | pages=653 | volume=151 | pmid=15758212 | doi=10.1099/mic.0.27437-0}}
# {{cite journal | author=Haft DH, Selengut J, Mongodin EF, Nelson KE | title=A guild of 45 CRISPR-associated (Cas) protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes | journal=PLoS Comput Biol. | year=2005 | pages=e60 | volume=1 | issue=6 | pmid=16292354 | doi=10.1371/journal.pcbi.0010060}}
# {{cite journal | author=Makarova KS, Grishin NV, Shabalina SA, Wolf YI, Koonin EV | title=A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action | journal=Biol Direct. | year=2006 | pages=7 | volume=1 | pmid=16545108 | doi=10.1186/1745-6150-1-7}}
# {{cite journal | author=Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P. | title=CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes | journal=Science | year=2007 | pages=1709 | volume=315 | issue=5819 | pmid=17379808 | doi=10.1126/science.1138140}}
# {{cite journal | author=Sorek R, Kunin V, Hugenholtz P | title=CRISPR - a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea | journal=Nat Rev Microbiol | year=2007 | pmid=18157154 | doi=10.1038/nrmicro1793 | volume=6 | pages=181}}
# {{cite journal | author=Andersson AF, Banfield JF | title=Virus population dynamics and acquired virus resistance in natural microbial communities | journal=Science | year=2008 | pmid=18497291 | doi=10.1126/science.1157358 | volume=320 | pages=1047}}
# {{cite journal | author=Brouns SJJ, Jore MM, Lundgren M, Westra ER, Slijkhuis RJH, Snijders APL, Dickman MJ, Makarova KS, Koonin EV, Van der Oost J | title=Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes | journal=Science | year=2008 | pmid=18703739 | doi=10.1126/science.1159689 | volume=321 | pages=960}}
== Внешние ссылки ==
* http://crispr.u-psud.fr/Server/CRISPRfinder.php
* http://crispr.u-psud.fr/crispr/
* http://crispr.u-psud.fr/CRISPRcompar/
{{mol_bio-stub}}
[[en:CRISPR]]
[[fr:Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats]]
[[Категория:ДНК]]
[[Категория:Молекулярно-генетические процессы]]' |
Вики-текст новой страницы после правки (new_wikitext ) | ''''Короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами''' ({{lang-en|CRISPR — Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats}}) — это прямые повторы, обнаруженные в ДНК многих [[бактерии|бактерий]] и [[археи|архей]]. Повторы имеют длину от 24 до 48 пар нуклеотидов. Повторы имеют бивалентную симметрию ({{lang-en|dyad symmetry}}), но, как правило, не являются истинными [[палиндром]]ами. Повторы отделены промежутками примерно одинаковой длины. Последовательности [[нуклеотид]]ов некоторых промежутков соответствуют последовательностям [[геном]]ов [[бактериофаг]]ов. В связи с этим было предположено и затем показано, что последовательности, разделяющие повторы, происходят из последовательностей геномов бактериофагов, и, соответственно, обеспечивают защиту клеток от инфекций.
[[Файл:Crispr.png|thumb|500px|right|Диаграмма, иллюстрирующая возможный механизм CRISPR.]]
В результате исследований механизма действия CRISPR было сделано предположение о том, что данная система прокариот является аналогом системы [[РНК-интерференция|РНК-интерференции]], представленной в клетках эукариот и обеспечивает бактериям и археям защиту от бактерифагов.
== Литература ==
# {{cite journal | author=Pourcel C, Salvignol G, Vergnaud G | title=CRISPR elements in ''Yersinia pestis'' acquire new repeats by preferential uptake of bacteriophage DNA, and provide additional tools for evolutionary studies | journal=Microbiology | year=2005 | pages=653 | volume=151 | pmid=15758212 | doi=10.1099/mic.0.27437-0}}
# {{cite journal | author=Haft DH, Selengut J, Mongodin EF, Nelson KE | title=A guild of 45 CRISPR-associated (Cas) protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes | journal=PLoS Comput Biol. | year=2005 | pages=e60 | volume=1 | issue=6 | pmid=16292354 | doi=10.1371/journal.pcbi.0010060}}
# {{cite journal | author=Makarova KS, Grishin NV, Shabalina SA, Wolf YI, Koonin EV | title=A putative RNA-interference-based immune system in prokaryotes: computational analysis of the predicted enzymatic machinery, functional analogies with eukaryotic RNAi, and hypothetical mechanisms of action | journal=Biol Direct. | year=2006 | pages=7 | volume=1 | pmid=16545108 | doi=10.1186/1745-6150-1-7}}
# {{cite journal | author=Barrangou R, Fremaux C, Deveau H, Richards M, Boyaval P, Moineau S, Romero DA, Horvath P. | title=CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes | journal=Science | year=2007 | pages=1709 | volume=315 | issue=5819 | pmid=17379808 | doi=10.1126/science.1138140}}
# {{cite journal | author=Sorek R, Kunin V, Hugenholtz P | title=CRISPR - a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea | journal=Nat Rev Microbiol | year=2007 | pmid=18157154 | doi=10.1038/nrmicro1793 | volume=6 | pages=181}}
# {{cite journal | author=Andersson AF, Banfield JF | title=Virus population dynamics and acquired virus resistance in natural microbial communities | journal=Science | year=2008 | pmid=18497291 | doi=10.1126/science.1157358 | volume=320 | pages=1047}}
# {{cite journal | author=Brouns SJJ, Jore MM, Lundgren M, Westra ER, Slijkhuis RJH, Snijders APL, Dickman MJ, Makarova KS, Koonin EV, Van der Oost J | title=Small CRISPR RNAs Guide Antiviral Defense in Prokaryotes | journal=Science | year=2008 | pmid=18703739 | doi=10.1126/science.1159689 | volume=321 | pages=960}}
== Внешние ссылки ==
* http://crispr.u-psud.fr/Server/CRISPRfinder.php
* http://crispr.u-psud.fr/crispr/
* http://crispr.u-psud.fr/CRISPRcompar/
{{mol_bio-stub}}
[[en:CRISPR]]
[[fr:Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats]]
[[Категория:ДНК]]
[[Категория:Молекулярно-генетические процессы]]
[[Медиа:Example.ogg]]' |