Укладка Россмана

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Пример укладки Россмана, домен белка декарбоксилазы бактерии Staphylococcus epidermidis[англ.] (PDB ID 1G5Q) со связанным кофактором ФМН

Укладка Россманна — структурный мотив[англ.] в третичной структуре белка, который связывает нуклеотиды (в частности, кофактор НАД).[1] Структура, состоящая из двух идентичных частей, содержит шесть почти параллельных β-листов, соединённых между собой двумя парами α-спиралей, следующих в порядке β-α-β-α-β. Поскольку каждая укладка Россманна может связать один нуклеотид, связывающий домен для динуклеотидов, таких как НАД, состоит из двух параллельных укладок Россманна. Одиночная укладка Россманна может связать мононуклеотид, например, кофактор ФМН.

Мотив назван по имени Майкла Россмана, который первым обнаружил и описал эту структуру как часто встречающуюся в нуклеотид-связывающих белках, таких, как дегидрогеназы[2].

В 1989 году Исраэль Ханукоглу[англ.] из Института Вейцмана обнаружил, что нуклеотидная последовательность для НАДФ-связывающих структур в некоторых белках отличается от мотивов, связывающих НАД[3]. Это открытие было использовано для реинжиниринга кофакторной избирательности ферментов[4].

Примечания[править | править код]

  1. Hanukoglu I. Proteopedia: Rossmann fold: A beta-alpha-beta fold at dinucleotide binding sites (англ.) // Biochem Mol Biol Educ : journal. — 2015. — Vol. 43, no. 3. — P. 206—209. — doi:10.1002/bmb.20849. — PMID 25704928.
  2. Rao S., Rossmann M. Comparison of super-secondary structures in proteins (англ.) // J Mol Biol[англ.] : journal. — 1973. — Vol. 76, no. 2. — P. 241—256. — doi:10.1016/0022-2836(73)90388-4. — PMID 4737475.
  3. Hanukoglu I., Gutfinger T. cDNA sequence of adrenodoxin reductase. Identification of NADP-binding sites in oxidoreductases. (англ.) // European journal of biochemistry / FEBS. — 1989. — Vol. 180, no. 2. — P. 479—484. — PMID 2924777. [исправить]
  4. Scrutton N.S., Berry A., Perham R.N. Redesign of the coenzyme specificity of a dehydrogenase by protein engineering. (англ.) // Nature : journal. — 1990. — January (vol. 343, no. 6253). — P. 38—43. — doi:10.1038/343038a0. — PMID 2296288.