Шаблон:Семейство белков/doc
Это шаблон для семейств белков/доменов as defined in biological databases such as Pfam.
Использование
[править код]To use this template, copy the following text and paste it at the top of your article. Fill in as many fields as possible, but don't worry if some information is missing.
{{Семейство белков | Symbol = | Name = | image = | width = | caption = | Pfam = | Pfam_clan = | InterPro = | SMART = | PROSITE = | MEROPS = | SCOP = | TCDB = | OPM family = | OPM protein = | CAZy = | CDD = }}
Пример
[править код]Заполнение данной таблици генерирует следующий шаблон: см. справа
Ligand-binding domain (LBD) | |
---|---|
| |
Идентификаторы | |
Символ | Hormone_recep |
Pfam | PF00104 |
InterPro | IPR000536 |
SMART | SM00430 |
SCOP | 1lbd |
SUPERFAMILY | 1lbd |
CDD | cd06157 |
Доступные структуры белков | |
Pfam | структуры |
PDB | RCSB PDB; PDBe; PDBj |
PDBsum | 3D-модель |
{{Infobox protein family | Symbol = Hormone_recep | Name = Ligand-binding domain (LBD) | image = RORC_3L0L.png | width = | caption = [[RAR-related orphan receptor gamma|RORγ]] | Pfam = PF00104 | InterPro = IPR000536 | SMART = SM00430 | PROSITE = | SCOP = 1lbd | TCDB = | OPM family = | OPM protein = | CDD = cd06157 }}
Параметры шаблона
[править код]This is template for a protein family/domain as defined in biological databases such as Pfam.
Параметр | Описание | Тип | Статус | |
---|---|---|---|---|
Symbol | Symbol | без описания | Однострочный | необязательный |
Name | Name | имя | Однострочный | необязательный |
Image | image | имя файла | Имя страницы | необязательный |
Width | width | Ширина картинки | Строковый (без форматирования) | необязательный |
Caption | caption | подпись под картинкой | Строковый (без форматирования) | необязательный |
Pfam family identifier | Pfam | Автоматические ссылки на записи Pfam | Однострочный | необязательный |
Pfam clan identifier | Pfam_clan | Автоматические ссылки на клановые записи Pfam;клан -группа родственных белковых семей. | Однострочный | необязательный |
Interpro identifier | Interpro | Автоматические ссылки на статью в Interpro | Однострочный | необязательный |
SMART accession number | SMART | Автоматические ссылки на информацию о домене в Simple Modular Architecture Research Tool | Однострочный | необязательный |
PROSITE record identifier | PROSITE | Автоматические ссылки на поиск PROSITE | Однострочный | необязательный |
MEROPS record identifier | MEROPS | Автоматические ссылки на записи MEROPS (MEROPS описание пептидаз и их ингибиторов) | Однострочный | необязательный |
SCOP (PDB accession number) | SCOP | Given a PDB accession number, auto-links to a SCOP (Structural Classification of Proteins) family level page. Also generates an auto-link to a SCOP SUPERFAMILY record. | Однострочный | необязательный |
TCDB identifier | TCDB | Автоматические ссылки на поиск идентификаторов в Transporter Classification Database | Однострочный | необязательный |
OPM superfamily identifier | OPM family | Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes | Однострочный | необязательный |
OPM protein identifier | OPM protein | значение идентификатора PDB; Автоматические ссылки на описание белка в Orientations of Proteins in Membranes | Однострочный | необязательный |
CAZy family identifier | CAZy | Ссылка на описание семейства в Carbohydrate-Active enZYmes. | Однострочный | необязательный |
CDD uid | CDD | Ссылка на Conserved Domain Database | Однострочный | необязательный |