НевГен

НевГен или NevGen — один из мировых проектов предсказания гаплогрупп, разработанный под руководством сербского ДНК-проекта и общества сербских генеалогов «Порекло». Авторы — Ацо Невский (псевдоним) и Милош Цеткович-Гентула. Программа создана в мае 2014 года как настольное приложение для нужд сербских генеалогов, с конца 2015 года существует и онлайн-версия программы. НевГен использует фитнес-компьютер, а также байесовско-аллельно-частотный подход (англ. Bayesian-Allele-Frequency Approach) для предсказания того, какой гаплогруппе соответствует гаплотип Y-STR. Помимо этого, он использует взаимозависимость значений различных маркеров STR при вычислении вероятностей ветвления. Постоянный прогресс и многочисленные научные работы, в которых он применялся, делают его одним из наиболее известных в мире предсказателем гаплогруппы Y-ДНК.

Применение в науке

Используется в следующих научных работах (список может быть расширен):

• Dogan S, Babic N, Gurkan C, Goksu A, Marjanovic D, Hadziavdic V (2016). "Y-chromosomal haplogroup distribution in the Tuzla Canton of Bosnia and Herzegovina: A concordance study using four different in silico assignment algorithms based on Y-STR data". Homo. 67 (6): 471–483. doi:10.1016/j.jchb.2016.10.003.

• Szargut M, Ossowski A, Kuś M, Zielińska G, Rębacz-Maron E (2016). "Haplogroup prediction by different Y-STR-based tools in samples from United Republic of Tanzania". doi:10.13140/RG.2.2.25831.04003. {{cite journal}}: Cite journal требует |journal= (справка)

• Mustafin KK, Alborova IE, Semenov AS, Vishnevsky VP (2018). "Haplogroup Analysis for a Medieval Russian Burial оf 16th–17th Centures in Radonezh (Moscow Area)". Studia Slavica et Balcanica Petropolitana. 24 (2): 169–180. doi:10.21638/spbu19.2018.209.

• Diepenbroek M, Cytacka S, Szargut M, Arciszewska J, Zielińska G, Ossowski A (2018). "Analysis of male specific region of the human Y chromosome sheds light on historical events in Nazi occupied eastern Poland". International journal of legal medicine: 395–409. doi:10.1007/s00414-018-1943-0.

• Poriswanish N, Neumann R, Wetton JH, Wagstaff J, Larmuseau MH, Jobling MA, May, CA (2018). "Recombination hotspots in an extended human pseudoautosomal domain predicted from double-strand break maps and characterized by sperm-based crossover analysis". PLoS genetics. 14 (10). doi:10.1371/journal.pgen.1007680.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

• Kačar T, Stamenković G, Blagojević J, Krtinić J, Mijović D, Marjanović D (2019). "Y chromosome genetic data defined by 23 short tandem repeats in a Serbian population on the Balkan Peninsula". Annals of human biology. 46 (1): 77–83. doi:10.1080/03014460.2019.1584242.

• Al-Snan NR, Messaoudi SA, Khubrani YM, Wetton JH, Jobling MA, Bakhiet M (2019). "Genetic variation at 27 y-strs in four regions of bahrain". bioRxiv. doi:10.1101/787341.

• Kiesler KM, Andreaggi KS, Ring JD, Taylor CR, Marshall CK, Vallone PM (2019). "Sequencing of full mitochondrial genomes for NIST population samples". Forensic Science International: Genetics Supplement Series: 452–453.

• López-Ramírez YL, Aguilar-Velázquez JA, López-Armenta M, Ruiz-Hernández M, Rangel-Villalobos H (2019). "Paternal lineages and forensic parameters based on 23 Y-STRs (Powerplex® Y23) in Mestizo males from Mexico City". International journal of legal medicine: 199–202. doi:10.1007/s00414-019-02183-1.

• Szargut M, Diepenbroek M, Zielińska G, Cytacka S, Arciszewska J, Jałowińska K, Ossowski A (2019). "Is MPS always the answer? Use of two PCR-based methods for Y-chromosomal haplotyping in highly and moderately degraded bone material". Forensic Science International: Genetics: 181–189. doi:10.1016/j.fsigen.2019.07.016.

• Daniels-Higginbotham J, Gorden EM, Farmer SK, Spatola B, Damann F, Bellantoni N, Parson W (2019). "DNA Testing Reveals the Putative Identity of JB55, a 19th Century Vampire Buried in Griswold, Connecticut". Genes: 1–11. doi:10.3390/genes10090636.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)

• Jannuzzi J, Ribeiro J, Alho C, Arão G, Cicarelli R, Corrêa H, Mota MF (2020). "Male lineages in Brazilian populations and performance of haplogroup prediction tools". Forensic Science International: Genetics. 44. doi:10.1016/j.fsigen.2019.102163.

• Fóthi E, Gonzalez A, Fehér T, et al. (2020). "Genetic analysis of male Hungarian Conquerors: European and Asian paternal lineages of the conquering Hungarian tribes". Archaeol Anthropol Sci. 12 (31): 77–83. doi:10.1007/s12520-019-00996-0.

См. также

• Генеалогический ДНК-тест
• Общество сербских генеалогов «Порекло»

Ссылки

• Сербский ДНК проект
• Разноврсно генетско наслеђе  (серб.)