Гаплогруппы

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск

Гаплогруппапопуляционной генетике человека — науке, изучающей генетическую историю человечества) — группа схожих гаплотипов, имеющих общего предка, у которого в обоих гаплотипах имела место одна и та же мутация однонуклеотидный полиморфизм. Термин «гаплогруппа» широко применяется в генетической генеалогии, где изучаются гаплогруппы Y-хромосомные (Y-ДНК), митохондриальные (мтДНК) и ГКГ-гаплогруппы. Генетические маркеры Y-ДНК передаются с Y-хромосомой исключительно по отцовской линии (то есть от отца сыновьям), а маркеры мтДНК — по материнской линии (от матери всем детям). Таким образом, мужчины являются носителями маркеров Y-ДНК.

Популяционная генетика гаплогрупп[править | править вики-текст]

Y-хромосомные гаплогруппы мировой популяции в доколониальный период

Предположительно, естественный отбор не действует или действует очень слабо в отношении мутации, приведшей к образованию гаплогруппы и находимой в наши дни. Тогда кроме скорости мутаций, варьирующейся от маркера к маркеру, основная причина изменения соотношения гаплотипов в популяции — это генетический дрейф, случайные флуктуации, вызванные количеством потомков соответствующего пола, которым был передан данный маркер. Это приводит к постепенному изменению пропорции данного маркера либо до 100 %, либо к его полному исчезновению из популяции. В большой популяции генетический дрейф распространённых аллелей очень мал, но в малой популяции, где скрещивание проходит между близкородственными особями, пропорция аллелей изменяется относительно быстро. Таким образом, наблюдаемая географическая разница в гаплогруппах вызвана эффектом бутылочного горлышка и/или эффектом основателя, за которыми последовали разделение популяции на отдельные группы или значительное увеличение числа особей. В более недавних популяциях обнаруживаются не все аллели, которые были в предыдущей популяции: генетический дрейф приводит к исчезновению некоторых аллелей из популяции. Стоимость определения гаплотипа ограничивает количество используемых образцов, поэтому достоверность выводов ограничивается возможной статистической ошибкой.

Классификация[править | править вики-текст]

Существует чёткая номенклатура классификации гаплогрупп в научном мире.

Гаплогруппы Y-ДНК[править | править вики-текст]

Дерево гаплогрупп Y-ДНК выглядит следующим образом:

Y-хромосомный Адам
A00 A0’1'2’3'4
A0 A1’2'3’4
A1 A2’3'4
A2’3 A4=BCDEF
A2 A3 B CT 
|
DE CF
D E C F
D1 D2 E1 E2 C1 C2 G IJK H
| | | | | | | |
D1a D1b D1c E1a E1b E2a E2b C1a C1b C1c C2a C2b C2c C2d C2e C2f G1 G2 IJ K H1 H2 H3
| | |
I J L K(xLT) T H1a H1b H1c
| | | |
I1 I2 J1 J2 L1 L2 M NO P S
| | | | | | |
I1a I1b I2a I2b I2c J2a J2b L1a L1b L1c M1 M2 M3 N O Q R
| | | |
N1 O1 O2 O3 Q1 R1 R2
| | |
N1a N1b N1c Q1a Q1b R1a R1b
  1. van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2013). «Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome». Human Mutation. DOI:10.1002/humu.22468. PMID 24166809.


В 2002 году сообщество генетиков (Y Chromosome Consortium) выработало общую классификацию и номенклатуру по линиям Y-хромосомы. Выделено 18 основных мутационных кластеров в хромосоме, так называемые клады, обозначаемые латинскими буквами от A до R. Порядок букв отражает последовательность возникновения мутаций. Эти клады в свою очередь разветвляются на гаплогруппы, которые нумеруются цифрами и буквами.

До 2002 года применялись более простые обозначения по номерам гаплогрупп: НG1, HG2 и т. д. Таблица позволяет перевести старые обозначения, используемые в научных статьях, в современную номенклатуру.

Устаревшие HG1 HG2 HG3 HG8 HG9 HG12 HG16 HG21
YCC R1b I R1a E3a J K N3 E3b

Гаплогруппы мтДНК[править | править вики-текст]

Дерево гаплогрупп мтДНК человека

Митохондриальная Ева
|
L0 L1 L2 L3 L4 L5 L6 L7
|
M N
| |
CZ D E G Q R A S X Y N1 N2
| | | |
C Z B F R0 pre-JT P UK I N1a W
| | |
HV JT U K
| |
H V J T Устаревшие кластеры IWX


Ссылки[править | править вики-текст]

См. также[править | править вики-текст]