Bat SARS-like coronavirus RsSHC014: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интерактивная навигация по истории
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
м VladXe переименовал страницу SHC014-CoV в Bat SARS-like coronavirus RsSHC014: такое название зафиксированно в АИ
уточнение, оформление, +категория
Строка 1: Строка 1:
{{Таксон
{{Таксон
⚫
| name = ''Bat SARS-like coronavirus'' RsSHC014
| name = SHC014-CoV<!--для прямого начертания-->
| image file =
| image file =
| image descr =
| image descr =
Строка 6: Строка 6:
| parent = Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
| parent = Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
| rang = Штамм
| rang = Штамм
| latin = SHC014-CoV
| latin = ''Bat SARS-like coronavirus'' RsSHC014
| syn =
| syn =
* SHC014-CoV{{нет АИ|22|03|2020}}
⚫
* ''Bat SARS-like coronavirus'' RsSHC014
| wikispecies = Severe acute respiratory syndrome coronavirus
| wikispecies = Severe acute respiratory syndrome coronavirus
| ncbi = 1415851
}}
}}
⚫
'''''Bat SARS-like coronavirus'' RsSHC014''' — штамм [[SARS-CoV|SARS-подобного]] [[коронавирус]]а, который заражает [[Подковоносые|подковоносых летучих мышей]] (Rhinolophidae). Обнаружен в Китае, описан в 2013 году<ref name="Xing-Yi_et_al_2013">Ge X., Li J., Yang X. et al. (2013). Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. ''Nature'' '''503''': 535—538. {{doi|10.1038/nature12711}}.</ref>.

⚫
'''SHC014-CoV''' ({{lang-en|Bat SARS-like coronavirus}} RsSHC014) — [[SARS-CoV|SARS-подобный]] [[коронавирус]] (SL-COV), который заражает [[Подковоносые|подковоносых летучих мышей]] (Rhinolophidae). Обнаружен в Китае, описан в 2013 году<ref name="Xing-Yi_et_al_2013">Ge X., Li J., Yang X. et al. (2013). Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. ''Nature'' '''503''': 535—538 {{doi|10.1038/nature12711}}.</ref>.


== Обнаружение вируса ==
== Обнаружение вируса ==
В апреле 2011 — сентябре 2012 годов в колонии летучих мышей [[Подковоносы|Rhinolophus sinicus]] в округе [[Куньмин]] (провинция [[Юньнань]] на юго-западе [[Китай|Китая]]) было собрано 117 анальных мазков и образцов фекалий летучих мышей<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. 27 из 117 образцов (23 %) содержали семь различных штаммов [[SARS-CoV|SARS-подобных]] [[коронавирус]]ов, среди которых была два ранее неизвестных штамма, получивших название RsSHC014 и [[Rs3367]]<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />.
В апреле 2011 — сентябре 2012 годов в колонии летучих мышей ''[[Rhinolophus sinicus]]'' в округе [[Куньмин]] (провинция [[Юньнань]] на юго-западе [[Китай|Китая]]) было собрано 117 анальных мазков и образцов фекалий летучих мышей<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. 27 из 117 образцов (23 %) содержали семь различных штаммов SARS-подобных [[коронавирус]]ов, среди которых была два ранее неизвестных штамма, получивших название RsSHC014 и Rs3367<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />.


== Описание вируса RsSHC014 ==
== Описание ==
Вирус RsSHC014 содержит 29 787 пар нуклеотидов (за исключением [[Полиаденилирование|поли(А)-хвоста]])<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. Общая идентичность нуклеотидной последовательности генома RsSHC014 с человеческим коронавирусом [[SARS-CoV]] (штамм Tor2) составляет 95 %, что выше, чем наблюдаемое ранее для всех других SL-CoV летучих мышей как в Китае (88-92 %), так и в Европе (76 %)<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. Филогенетический анализ показал, что RsSHC014 является потомком рекомбинации линий, которые в конечном итоге приводят к появлению человеческих коронавирусов [[SARS-CoV]] и SL-CoV Rs672<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />.
Вирус RsSHC014 содержит 29 787 пар нуклеотидов (за исключением [[Полиаденилирование|поли(А)-хвоста]])<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. Общая идентичность нуклеотидной последовательности генома RsSHC014 с человеческим коронавирусом [[SARS-CoV]] (штамм Tor2) составляет 95 %, что выше, чем наблюдаемое ранее для всех других SL-CoV летучих мышей как в Китае (88—92 %), так и в Европе (76 %)<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />. Филогенетический анализ показал, что RsSHC014 является потомком рекомбинации линий, которые в конечном итоге приводят к появлению человеческих коронавирусов SARS-CoV и SL-CoV Rs672<ref name="Xing-Yi_et_al_2013" />.


Тем менее, несмотря на близкое сходство, коронавирус летучих мышей RsSHC014 не способен заражать человека<ref name="Lau-2015">{{публикация|статья|автор=Lau, S. K., Feng, Y., Chen, H., Luk, H. K., Yang, W. H., Li, K. S., Zhang, Y. Z., Huang, Y., Song, Z. Z., Chow, W. N., Fan, R. Y., Ahmed, S. S., Yeung, H. C., Lam, C. S., Cai, J. P., Wong, S. S., Chan, J. F., Yuen, K. Y., Zhang, H. L., & Woo, P. C.|заглавие=Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination|издание=Journal of virology|год=2015|номер=89(20)|pages=10532–10547|doi=10.1128/JVI.01048-15}}</ref>. Предположительно, им были заражены [[циветы]], в которых вирус несколько лет мутировал (в частности его белок ORF8) прежде чем превратиться в [[SARS-CoV]]<ref name="Lau-2015" />.
Тем менее, несмотря на близкое сходство, коронавирус летучих мышей RsSHC014 не способен заражать человека<ref name="Lau-2015">{{публикация|статья|автор=Lau S. K., Feng Y., Chen H., Luk H. K., Yang W. H., Li K. S., Zhang Y. Z., Huang Y., Song Z. Z., Chow W. N., Fan R. Y., Ahmed S. S., Yeung H. C., Lam C. S., Cai J. P., Wong S. S., Chan J. F., Yuen K. Y., Zhang H. L., & Woo P. C. |заглавие=Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination |издание=Journal of virology |язык=en |год=2015 |том=89 |номер=20 |pages=10532–10547 |doi=10.1128/JVI.01048-15}}</ref>. Предположительно, им были заражены [[циветы]], в которых вирус несколько лет мутировал (в частности его белок ORF8) прежде чем превратиться в SARS-CoV<ref name="Lau-2015" />.


== Химерный SARS-подобный коронавирус SHC014-MA15 ==
== Химерный SARS-подобный коронавирус SHC014-MA15 ==
В 2015 году исследователи из [[Университет штата Северная Каролина|Университета Северной Каролины]] (США) и [[Институт вирусологии в Ухани|Института вирусологии в Ухани]] (Китай) сообщили, что они методом [[Обратная генетика|обратной генетики]] создали [[химерный вирус|химерный коронавирус]] SHC014-MA15, состоящий из поверхностного белка SHC014 и основной цепи вируса SARS, и продемонстрировали надёжную репликацию данного вируса как ''in vitro'', так и ''in vivo''<ref name="Menachery_et_al_2015">Menachery, V., Yount, B., Debbink, K. et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nat Med 21, 1508—1513 (2015) https://doi.org/10.1038/nm.3985</ref>.
В 2015 году исследователи из [[Университет штата Северная Каролина|Университета Северной Каролины]] (США) и [[Институт вирусологии в Ухани|Института вирусологии в Ухани]] (Китай) сообщили, что они методом [[Обратная генетика|обратной генетики]] создали [[химерный вирус|химерный коронавирус]] SHC014-MA15, состоящий из поверхностного белка SHC014 и основной цепи вируса SARS, и продемонстрировали надёжную репликацию данного вируса как ''in vitro'', так и ''in vivo''<ref name="Menachery_et_al_2015">Menachery V., Yount B., Debbink K. et al. (2015). A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nat Med '''21''': 1508—1513. {{doi|10.1038/nm.3985}}.</ref>.


[[In vitro]] вирус мог инфицировать как опухолевую ткань человека (клеточная линия [[HeLa]]), так и эпителий дыхательных путей человека (клеточные линии Calu-3 2B4 и HAE)<ref name="Menachery_et_al_2015" />.
[[In vitro]] вирус мог инфицировать как опухолевую ткань человека (клеточная линия [[HeLa]]), так и эпителий дыхательных путей человека (клеточные линии Calu-3 2B4 и HAE)<ref name="Menachery_et_al_2015" />.
Строка 29: Строка 29:
[[In vivo]] вирус оказался способен вызывать пневмонию у мышей. Инфекция SHC014-MA15 приводила к значительной потере веса (10 %), но без летальности у мышей<ref name="Menachery_et_al_2015" />. У мышей, инфицированных SHC014-MA15, наблюдалось снижение окрашивания антигена дыхательных путей, а в паренхиме или в общем гистологическом балансе дефицита окрашивания антигена не наблюдалось, что свидетельствует о дифференциальной инфекции легочной ткани при инфекции данным химерным коронавирусом<ref name="Menachery_et_al_2015" />. У более восприимчивых старых (12-месячных) мышей инфекция SHC014-MA15 вызывала устойчивую потерю веса, но имела минимальную летальность<ref name="Menachery_et_al_2015" />. Тенденции в гистологии и картинах окрашивания антигенов, которые наблюдались у молодых мышей, были сохранены и у более старых животных<ref name="Menachery_et_al_2015" />.
[[In vivo]] вирус оказался способен вызывать пневмонию у мышей. Инфекция SHC014-MA15 приводила к значительной потере веса (10 %), но без летальности у мышей<ref name="Menachery_et_al_2015" />. У мышей, инфицированных SHC014-MA15, наблюдалось снижение окрашивания антигена дыхательных путей, а в паренхиме или в общем гистологическом балансе дефицита окрашивания антигена не наблюдалось, что свидетельствует о дифференциальной инфекции легочной ткани при инфекции данным химерным коронавирусом<ref name="Menachery_et_al_2015" />. У более восприимчивых старых (12-месячных) мышей инфекция SHC014-MA15 вызывала устойчивую потерю веса, но имела минимальную летальность<ref name="Menachery_et_al_2015" />. Тенденции в гистологии и картинах окрашивания антигенов, которые наблюдались у молодых мышей, были сохранены и у более старых животных<ref name="Menachery_et_al_2015" />.


Исследователи также установили, что доступные иммунотерапевтические и профилактические методы лечения [[Атипичная пневмония|атипичной пневмонии]] (использование [[Моноклональные антитела|моноклональных антител]] или имеющихся [[вакцина|вакцин]]) не смогли нейтрализовать химерный коронавирус или защитить от инфицирования им<ref name="Menachery_et_al_2015" />. Тем не менее, в 2018 году была обнаружена вакцина (dNSP16/ExoN), которая могла нейтрализовать химерный коронавирус SHC014-MA15<ref>{{публикация|статья|заглавие=Combination Attenuation Offers Strategy for Live Attenuated Coronavirus Vaccines|ссылка=|год=2018|автор=Menachery, V. D., Gralinski, L. E., Mitchell, H. D., Dinnon, K. H., 3rd, Leist, S. R., Yount, B. L., Jr, McAnarney, E. T., Graham, R. L., Waters, K. M., & Baric, R. S.|ref=|язык=|издание=Journal of virology|место=|издательство=|номер=92(17)|месяц=|pages=e00710-18|doi=10.1128/JVI.00710-18}}</ref>.
Исследователи также установили, что доступные иммунотерапевтические и профилактические методы лечения [[Атипичная пневмония|атипичной пневмонии]] (использование [[Моноклональные антитела|моноклональных антител]] или имеющихся [[вакцина|вакцин]]) не смогли нейтрализовать химерный коронавирус или защитить от инфицирования им<ref name="Menachery_et_al_2015" />. Тем не менее, в 2018 году была обнаружена вакцина (dNSP16/ExoN), которая могла нейтрализовать химерный коронавирус SHC014-MA15<ref>{{публикация|статья|заглавие=Combination Attenuation Offers Strategy for Live Attenuated Coronavirus Vaccines|ссылка=|год=2018|автор=Menachery V. D., Gralinski L. E., Mitchell H. D., Dinnon K. H. 3rd, Leist S. R., Yount B. L. Jr, McAnarney E. T., Graham R. L., Waters K. M., & Baric R. S.|язык=en|издание=Journal of virology|место=|издательство=|том=92|номер=17|pages=e00710-18|doi=10.1128/JVI.00710-18}}</ref>.


=== Критика ===
=== Критика ===
В ноябре 2015 года в журнале [[Nature]] была опубликована статья, в которой высказывалась обеспокоенность данным экспериментом, который дал мало пользы для понимания вирусов, но представляет большой риск, если химерный коронавирус, способный заражать человека, вырвется за пределы лаборатории<ref name="butler-2015">{{статья|заглавие=Engineered bat virus stirs debate over risky research: Lab-made coronavirus related to SARS can infect human cells|ссылка=https://www.nature.com/news/engineered-bat-virus-stirs-debate-over-risky-research-1.18787?WT.mc_id=TWT_NatureNews|издание=[[Nature|Nature]]|издательство=Nature|doi=10.1038/nature.2015.18787|accessdate=2020-03-14|язык=en|тип=journal|автор=Butler, Declan|число=12|месяц=11|год=2015}}</ref>. В статье отмечалось, что если вирус летучих мышей RsSHC014 представляет лишь потенциальную опасность, то искусственно созданный химерный коронавирус SHC014-MA15 является уже реальной угрозой для людей<ref name="butler-2015" />. Однако, в 2016 году профессор департамента микробиологии и иммунологии [[Колумбийский университет|Колумбийского университета]] {{iw|Раканиелло, Раканиелло|Винсент Раканиелло|en|Vincent Racaniello}}, в обзоре новейших исследований потенциально пандемических вирусов, в том числе и SHC014-MA15, заявил<ref>{{публикация|статья|автор=Racaniello V.|заглавие=Moving beyond metagenomics to find the next pandemic virus|издание=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|год=2016|номер=113(11)|pages=2812–2814|doi=10.1073/pnas.1601512113}}</ref>: «Критики экспериментов с искусственным усилением функции вирусов часто приводят апокалиптические сценарии, включающие высвобождение изменённых вирусов и последующее катастрофическое воздействие на человека. Однако такие заявления представляют собой частные мнения, которые предназначены лишь для того, чтобы напугать общественность и подтолкнуть нас к ненужному регулированию. Вирусологи годами манипулировали вирусами […] и ни один изменённый вирус не вызвал эпидемию среди людей».
В ноябре 2015 года в журнале [[Nature]] была опубликована статья, в которой высказывалась обеспокоенность данным экспериментом, который дал мало пользы для понимания вирусов, но представляет большой риск, если химерный коронавирус, способный заражать человека, вырвется за пределы лаборатории<ref name="butler-2015">{{статья|заглавие=Engineered bat virus stirs debate over risky research: Lab-made coronavirus related to SARS can infect human cells|ссылка=https://www.nature.com/news/engineered-bat-virus-stirs-debate-over-risky-research-1.18787?WT.mc_id=TWT_NatureNews|издание=[[Nature|Nature]]|издательство=Nature|doi=10.1038/nature.2015.18787|accessdate=2020-03-14|язык=en|тип=journal|автор=Butler, Declan|число=12|месяц=11|год=2015}}</ref>. В статье отмечалось, что если вирус летучих мышей RsSHC014 представляет лишь потенциальную опасность, то искусственно созданный химерный коронавирус SHC014-MA15 является уже реальной угрозой для людей<ref name="butler-2015" />. Однако, в 2016 году профессор департамента микробиологии и иммунологии [[Колумбийский университет|Колумбийского университета]] {{iw|Раканиелло, Раканиелло|Винсент Раканиелло|en|Vincent Racaniello}}, в обзоре новейших исследований потенциально пандемических вирусов, в том числе и SHC014-MA15, заявил<ref>{{публикация|статья|автор=Racaniello V.|заглавие=Moving beyond metagenomics to find the next pandemic virus|издание=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|год=2016|том=113|номер=11|pages=2812—2814|doi=10.1073/pnas.1601512113}}</ref>: «Критики экспериментов с искусственным усилением функции вирусов часто приводят апокалиптические сценарии, включающие высвобождение изменённых вирусов и последующее катастрофическое воздействие на человека. Однако такие заявления представляют собой частные мнения, которые предназначены лишь для того, чтобы напугать общественность и подтолкнуть нас к ненужному регулированию. Вирусологи годами манипулировали вирусами […] и ни один изменённый вирус не вызвал эпидемию среди людей».


В 2018 году вышла статья<ref name="Cockrell-2018">{{публикация|статья|автор=Cockrell, A. S., Leist, S. R., Douglas, M. G., & Baric, R. S.|заглавие=Modeling pathogenesis of emergent and pre-emergent human coronaviruses in mice|издание=Mammalian genome: official journal of the International Mammalian Genome Society|год=2018|номер=29(7-8)|pages=367–383|doi=10.1007/s00335-018-9760-9}}</ref>, в которой критиковалась практика оценки ''in vivo'' патогенности для человека коронавирусов (и в частности, химерного коронавируса SHC014-MA15) на чистых линях лабораторных мышей. В частности, для исследования in vivo опасного для человека вируса [[SARS-CoV]], потребовалось выведение нового штамма MA15 SARS-CoV летального для генетической линии мышей MA15. Однако исследование патогенности других SARS-подобных коронавирусов на мышах линии MA15 может привести к недооценке опасности этих вирусов, так как эти вирусы могут оказаться безопасными лишь для этой генетической линии<ref name="Cockrell-2018" />. Кроме того, исследования патогенности на чистых линиях мышей приводит к трудности воспроизвести и изучить сопутствующие заболевания (диабет, хронические заболевания лёгких, болезни сердца и почек), которые связаны со смертельным респираторным заболеванием, наблюдаемым у людей<ref name="Cockrell-2018" />.
В 2018 году вышла статья<ref name="Cockrell-2018">{{публикация|статья|автор=Cockrell A. S., Leist S. R., Douglas M. G., & Baric R. S.|заглавие=Modeling pathogenesis of emergent and pre-emergent human coronaviruses in mice|издание=Mammalian genome: official journal of the International Mammalian Genome Society|год=2018|том=29|номер=7—8|pages=367—383|doi=10.1007/s00335-018-9760-9}}</ref>, в которой критиковалась практика оценки ''in vivo'' патогенности для человека коронавирусов (и в частности, химерного коронавируса SHC014-MA15) на чистых линях лабораторных мышей. В частности, для исследования in vivo опасного для человека вируса [[SARS-CoV]], потребовалось выведение нового штамма MA15 SARS-CoV летального для генетической линии мышей MA15. Однако исследование патогенности других SARS-подобных коронавирусов на мышах линии MA15 может привести к недооценке опасности этих вирусов, так как эти вирусы могут оказаться безопасными лишь для этой генетической линии<ref name="Cockrell-2018" />. Кроме того, исследования патогенности на чистых линиях мышей приводит к трудности воспроизвести и изучить сопутствующие заболевания (диабет, хронические заболевания лёгких, болезни сердца и почек), которые связаны со смертельным респираторным заболеванием, наблюдаемым у людей<ref name="Cockrell-2018" />.


=== Конспирологическая теория о связи SHC014-MA15 с пандемией COVID-19 ===
=== Конспирологическая теория о связи SHC014-MA15 с пандемией COVID-19 ===
В конце 2019 года года в [[Ухань|Ухани]] произошла внезапная вспышка нового коронавируса [[SARS-CoV-2]], к 2020 году превратившуюся в [[Пандемия COVID-19|пандемию]], что породило конспирологические теории о том, что этот вирус является искусственным и связан с SHC014-MA15.
В конце 2019 года года в [[Ухань|Ухани]] произошла внезапная вспышка нового коронавируса [[SARS-CoV-2]], к 2020 году превратившуюся в [[Пандемия COVID-19|пандемию]], что породило конспирологические теории о том, что этот вирус является искусственным и связан с SHC014-MA15.


Однако в марте 2020 года, в научном журнале «Emerging Microbes & Infections» была опубликована статья<ref>Shan-Lu Liu, Linda J. Saif, Susan R. Weiss & Lishan Su (2020) No credible evidence supporting claims of the laboratory engineering of SARS-CoV-2, Emerging Microbes & Infections, 9:1, 505—507, https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20200302035224/https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 |date=2020-03-02 }}</ref> исследователей из [[Университет Огайо|Университета Огайо]], [[Пенсильванский университет|Университета Пенсильвании]] и [[Университет штата Северная Каролина|Университета Северной Каролины]], в которой опровергается конспирологическая теория о тождественности химерного коронавируса SHC014-MA15 и коронавируса SARS-CoV-2, тем, что, согласно статьям китайских исследователей<ref>{{публикация|статья|автор=Zhu, N., et al.|заглавие=A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019|издание=New England Journal of Medicine|год=2020|номер=382(8)|pages=727—733|doi=10.1056/NEJMoa2001017}}</ref><ref>{{публикация|статья|автор=Wu, F., Zhao, S., Yu, B. et al.|заглавие=A new coronavirus associated with human respiratory disease in China|издание=Nature|год=2020|номер=579|pages=265–269|doi=10.1038/s41586-020-2008-3}}</ref>, коронавирус SHC014-MA15 отличается более чем на 6000 нуклеотидов от коронавируса SARS-CoV-2. Впрочем, в указанных статьях генетический кода коронавируса [[SARS-CoV-2]] сравнивался с генетическим кодом коронавируса летучих мышей RsSHC014, а не с химерным коронавирусом SHC014-MA15, полный генетический код которого нигде не опубликован.
Однако в марте 2020 года, в научном журнале «Emerging Microbes & Infections» была опубликована статья<ref>Shan-Lu Liu, Linda J. Saif, Susan R. Weiss & Lishan Su (2020). No credible evidence supporting claims of the laboratory engineering of SARS-CoV-2, ''Emerging Microbes & Infections'' 9(1): 505—507, https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20200302035224/https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 |date=2020-03-02 }}</ref> исследователей из [[Университет Огайо|Университета Огайо]], [[Пенсильванский университет|Университета Пенсильвании]] и [[Университет штата Северная Каролина|Университета Северной Каролины]], в которой опровергается конспирологическая теория о тождественности химерного коронавируса SHC014-MA15 и коронавируса SARS-CoV-2, тем, что, согласно статьям китайских исследователей<ref>{{публикация|статья|автор=Zhu N., et al.|заглавие=A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019|издание=New England Journal of Medicine|год=2020|том=382|номер=8|pages=727—733|doi=10.1056/NEJMoa2001017}}</ref><ref>{{публикация|статья|автор=Wu F., Zhao S., Yu B. et al.|заглавие=A new coronavirus associated with human respiratory disease in China|издание=Nature|год=2020|номер=579|pages=265—269|doi=10.1038/s41586-020-2008-3}}</ref>, коронавирус SHC014-MA15 отличается более чем на 6000 нуклеотидов от коронавируса SARS-CoV-2. Впрочем, в указанных статьях генетический кода коронавируса [[SARS-CoV-2]] сравнивался с генетическим кодом коронавируса летучих мышей RsSHC014, а не с химерным коронавирусом SHC014-MA15, полный генетический код которого нигде не опубликован.


== Примечания ==
== Примечания ==
Строка 45: Строка 45:


== Ссылки ==
== Ссылки ==
* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC881005 Полный геном SARS-подобного коронавируса летучих мышей RsSHC014]
* [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC881005 Полный геном SARS-подобного коронавируса летучих мышей RsSHC014].


{{изолированная статья}}
{{изолированная статья}}


⚫
[[Категория:Вирусы по алфавиту]]
[[Категория:Nidovirales]]
[[Категория:Nidovirales]]
⚫
[[Категория:Штаммы вирусов]]

Версия от 14:31, 22 марта 2020

Bat SARS-like coronavirus RsSHC014
Научная классификация
Группа:
Вирусы[1]
Реалм:
Riboviria
Царство:
Orthornavirae
Тип:
Pisuviricota
Класс:
Pisoniviricetes
Порядок:
Nidovirales
Подпорядок:
Cornidovirineae
Семейство:
Коронавирусы
Подсемейство:
Коронавирусы
Род:
Betacoronavirus
Подрод:
Sarbecovirus
Вид:
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
Штамм:
Bat SARS-like coronavirus RsSHC014
Международное научное название
Bat SARS-like coronavirus RsSHC014
Синонимы
  • SHC014-CoV[источник не указан 1522 дня]

Bat SARS-like coronavirus RsSHC014 — штамм SARS-подобного коронавируса, который заражает подковоносых летучих мышей (Rhinolophidae). Обнаружен в Китае, описан в 2013 году[2].

Обнаружение вируса

В апреле 2011 — сентябре 2012 годов в колонии летучих мышей Rhinolophus sinicus в округе Куньмин (провинция Юньнань на юго-западе Китая) было собрано 117 анальных мазков и образцов фекалий летучих мышей[2]. 27 из 117 образцов (23 %) содержали семь различных штаммов SARS-подобных коронавирусов, среди которых была два ранее неизвестных штамма, получивших название RsSHC014 и Rs3367[2].

Описание

Вирус RsSHC014 содержит 29 787 пар нуклеотидов (за исключением поли(А)-хвоста)[2]. Общая идентичность нуклеотидной последовательности генома RsSHC014 с человеческим коронавирусом SARS-CoV (штамм Tor2) составляет 95 %, что выше, чем наблюдаемое ранее для всех других SL-CoV летучих мышей как в Китае (88—92 %), так и в Европе (76 %)[2]. Филогенетический анализ показал, что RsSHC014 является потомком рекомбинации линий, которые в конечном итоге приводят к появлению человеческих коронавирусов SARS-CoV и SL-CoV Rs672[2].

Тем менее, несмотря на близкое сходство, коронавирус летучих мышей RsSHC014 не способен заражать человека[3]. Предположительно, им были заражены циветы, в которых вирус несколько лет мутировал (в частности его белок ORF8) прежде чем превратиться в SARS-CoV[3].

Химерный SARS-подобный коронавирус SHC014-MA15

В 2015 году исследователи из Университета Северной Каролины (США) и Института вирусологии в Ухани (Китай) сообщили, что они методом обратной генетики создали химерный коронавирус SHC014-MA15, состоящий из поверхностного белка SHC014 и основной цепи вируса SARS, и продемонстрировали надёжную репликацию данного вируса как in vitro, так и in vivo[4].

In vitro вирус мог инфицировать как опухолевую ткань человека (клеточная линия HeLa), так и эпителий дыхательных путей человека (клеточные линии Calu-3 2B4 и HAE)[4].

In vivo вирус оказался способен вызывать пневмонию у мышей. Инфекция SHC014-MA15 приводила к значительной потере веса (10 %), но без летальности у мышей[4]. У мышей, инфицированных SHC014-MA15, наблюдалось снижение окрашивания антигена дыхательных путей, а в паренхиме или в общем гистологическом балансе дефицита окрашивания антигена не наблюдалось, что свидетельствует о дифференциальной инфекции легочной ткани при инфекции данным химерным коронавирусом[4]. У более восприимчивых старых (12-месячных) мышей инфекция SHC014-MA15 вызывала устойчивую потерю веса, но имела минимальную летальность[4]. Тенденции в гистологии и картинах окрашивания антигенов, которые наблюдались у молодых мышей, были сохранены и у более старых животных[4].

Исследователи также установили, что доступные иммунотерапевтические и профилактические методы лечения атипичной пневмонии (использование моноклональных антител или имеющихся вакцин) не смогли нейтрализовать химерный коронавирус или защитить от инфицирования им[4]. Тем не менее, в 2018 году была обнаружена вакцина (dNSP16/ExoN), которая могла нейтрализовать химерный коронавирус SHC014-MA15[5].

Критика

В ноябре 2015 года в журнале Nature была опубликована статья, в которой высказывалась обеспокоенность данным экспериментом, который дал мало пользы для понимания вирусов, но представляет большой риск, если химерный коронавирус, способный заражать человека, вырвется за пределы лаборатории[6]. В статье отмечалось, что если вирус летучих мышей RsSHC014 представляет лишь потенциальную опасность, то искусственно созданный химерный коронавирус SHC014-MA15 является уже реальной угрозой для людей[6]. Однако, в 2016 году профессор департамента микробиологии и иммунологии Колумбийского университета Винсент Раканиелло[англ.], в обзоре новейших исследований потенциально пандемических вирусов, в том числе и SHC014-MA15, заявил[7]: «Критики экспериментов с искусственным усилением функции вирусов часто приводят апокалиптические сценарии, включающие высвобождение изменённых вирусов и последующее катастрофическое воздействие на человека. Однако такие заявления представляют собой частные мнения, которые предназначены лишь для того, чтобы напугать общественность и подтолкнуть нас к ненужному регулированию. Вирусологи годами манипулировали вирусами […] и ни один изменённый вирус не вызвал эпидемию среди людей».

В 2018 году вышла статья[8], в которой критиковалась практика оценки in vivo патогенности для человека коронавирусов (и в частности, химерного коронавируса SHC014-MA15) на чистых линях лабораторных мышей. В частности, для исследования in vivo опасного для человека вируса SARS-CoV, потребовалось выведение нового штамма MA15 SARS-CoV летального для генетической линии мышей MA15. Однако исследование патогенности других SARS-подобных коронавирусов на мышах линии MA15 может привести к недооценке опасности этих вирусов, так как эти вирусы могут оказаться безопасными лишь для этой генетической линии[8]. Кроме того, исследования патогенности на чистых линиях мышей приводит к трудности воспроизвести и изучить сопутствующие заболевания (диабет, хронические заболевания лёгких, болезни сердца и почек), которые связаны со смертельным респираторным заболеванием, наблюдаемым у людей[8].

Конспирологическая теория о связи SHC014-MA15 с пандемией COVID-19

В конце 2019 года года в Ухани произошла внезапная вспышка нового коронавируса SARS-CoV-2, к 2020 году превратившуюся в пандемию, что породило конспирологические теории о том, что этот вирус является искусственным и связан с SHC014-MA15.

Однако в марте 2020 года, в научном журнале «Emerging Microbes & Infections» была опубликована статья[9] исследователей из Университета Огайо, Университета Пенсильвании и Университета Северной Каролины, в которой опровергается конспирологическая теория о тождественности химерного коронавируса SHC014-MA15 и коронавируса SARS-CoV-2, тем, что, согласно статьям китайских исследователей[10][11], коронавирус SHC014-MA15 отличается более чем на 6000 нуклеотидов от коронавируса SARS-CoV-2. Впрочем, в указанных статьях генетический кода коронавируса SARS-CoV-2 сравнивался с генетическим кодом коронавируса летучих мышей RsSHC014, а не с химерным коронавирусом SHC014-MA15, полный генетический код которого нигде не опубликован.

Примечания

  1. ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. ↑ 1 2 3 4 5 6 Ge X., Li J., Yang X. et al. (2013). Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature 503: 535—538. doi:10.1038/nature12711.
  3. ↑ 1 2 Lau S. K., Feng Y., Chen H., Luk H. K., Yang W. H., Li K. S., Zhang Y. Z., Huang Y., Song Z. Z., Chow W. N., Fan R. Y., Ahmed S. S., Yeung H. C., Lam C. S., Cai J. P., Wong S. S., Chan J. F., Yuen K. Y., Zhang H. L., & Woo P. C. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination : [англ.] // Journal of virology. — 2015. — Т. 89, № 20. — P. 10532–10547. — doi:10.1128/JVI.01048-15.
  4. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Menachery V., Yount B., Debbink K. et al. (2015). A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nat Med 21: 1508—1513. doi:10.1038/nm.3985.
  5. ↑ Menachery V. D., Gralinski L. E., Mitchell H. D., Dinnon K. H. 3rd, Leist S. R., Yount B. L. Jr, McAnarney E. T., Graham R. L., Waters K. M., & Baric R. S. Combination Attenuation Offers Strategy for Live Attenuated Coronavirus Vaccines : [англ.] // Journal of virology. — 2018. — Т. 92, № 17. — P. e00710-18. — doi:10.1128/JVI.00710-18.
  6. ↑ 1 2 Butler, Declan. Engineered bat virus stirs debate over risky research: Lab-made coronavirus related to SARS can infect human cells (англ.) // Nature : journal. — Nature, 2015. — 12 November. — doi:10.1038/nature.2015.18787.
  7. ↑ Racaniello V. Moving beyond metagenomics to find the next pandemic virus // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. — 2016. — Т. 113, № 11. — P. 2812—2814. — doi:10.1073/pnas.1601512113.
  8. ↑ 1 2 3 Cockrell A. S., Leist S. R., Douglas M. G., & Baric R. S. Modeling pathogenesis of emergent and pre-emergent human coronaviruses in mice // Mammalian genome: official journal of the International Mammalian Genome Society. — 2018. — Т. 29, № 7—8. — P. 367—383. — doi:10.1007/s00335-018-9760-9.
  9. ↑ Shan-Lu Liu, Linda J. Saif, Susan R. Weiss & Lishan Su (2020). No credible evidence supporting claims of the laboratory engineering of SARS-CoV-2, Emerging Microbes & Infections 9(1): 505—507, https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1733440 Архивировано 2 марта 2020 года.
  10. ↑ Zhu N., et al. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019 // New England Journal of Medicine. — 2020. — Т. 382, № 8. — P. 727—733. — doi:10.1056/NEJMoa2001017.
  11. ↑ Wu F., Zhao S., Yu B. et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China // Nature. — 2020. — № 579. — P. 265—269. — doi:10.1038/s41586-020-2008-3.

Ссылки

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Bat_SARS-like_coronavirus_RsSHC014&oldid=105845083