Цинковый палец и BTB-домен, содержащий белок 16: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Следующая правка →
Содержимое удалено Содержимое добавлено
ВизуальныйВики-текст
← Новая страница: «{{GNF_Protein_box | Name = Цинковый палец и домен BTB содержащий 16 | image = Protein_ZBTB16_PDB_1buo.png | i…»
(нет различий)

Версия от 12:19, 21 апреля 2015

Цинковый палец и домен BTB содержащий 16
PDB представлено на примере 1buo.PDB представлено на примере 1buo.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1BUO, 1CS3

Идентификаторы
Символ ZBTB16 ; PLZF; ZNF145
Внешние ID OMIM: 176797 MGI: 103222 HomoloGene: 21214 GeneCards: Ген ZBTB16
Генная онтология
Функция • DNA binding

• double-stranded DNA binding
• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• protein binding
• protein C-terminus binding
• protein domain specific binding
• identical protein binding
• protein homodimerization activity

• metal ion binding
Компонент клетки • nucleus

• cytosol
• plasma membrane
• nuclear body
• PML body
• nuclear speck

• transcriptional repressor complex
Биологический процесс • mesonephros development

• transcription, DNA-templated
• apoptotic process
• central nervous system development
• negative regulation of cell proliferation
• embryonic pattern specification
• anterior/posterior pattern specification
• protein ubiquitination
• hemopoiesis
• myeloid cell differentiation
• positive regulation of chondrocyte differentiation
• protein localization to nucleus
• embryonic hindlimb morphogenesis
• forelimb morphogenesis
• embryonic digit morphogenesis
• positive regulation of apoptotic process
• positive regulation of fat cell differentiation
• negative regulation of myeloid cell differentiation
• positive regulation of ossification
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• positive regulation of transcription, DNA-templated
• male germ-line stem cell asymmetric division
• cartilage development

• positive regulation of cartilage development
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7704 235320
Ensembl ENSG00000109906 ENSMUSG00000066687
UniProt Q05516 A3KMN0
RefSeq (мРНК) NM_001018011 NM_001033324
RefSeq (белок) NP_001018011 NP_001028496
Локус (UCSC) Chr 11:
113.93 – 114.12 Mb		 Chr 9:
48.65 – 48.84 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Цинковый палец и домен ВТВ содержащий белок 16  — белок, кодируемый у человека геном ZBTB16 .

Функция

Этот ген член семейства круппель-белков цинкового пальца типа C2H2 и кодирует транскрипционный фактор цинкового пальца, который содержит девять доменов типа круппель (нем. Krueppel) цинкового палльца на С-конце. Этот белок находится в ядре, участвует в прогрессировании клеточного цикла и взаимодействует с гистондезацетилазой. Конкретные случаи аберрантных перестроек генов в этом локусе были связаны с острым промиелоцитарным лейкозом[1] и физиологические функции были определены у мышей в качестве естественных киллеров Т-клеток[2][3] и гамма-дельта Т-клеток.[4] Существуют альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, которые были охарактеризованы у человека.[5][6]

Взаимодействия

Цинковый палец и ВТВ домен, содержащий белок 16, как было выявлено, взаимодействуют со следующими структурами:

Примечания

  1. ↑ Chen Z, Brand NJ, Chen A, Chen SJ, Tong JH, Wang ZY, Waxman S, Zelent A (1993). "Fusion between a novel Krüppel-like zinc finger gene and the retinoic acid receptor-alpha locus due to a variant t(11;17) translocation associated with acute promyelocytic leukaemia". The EMBO Journal. 12 (3): 1161—7. PMC 413318. PMID 8384553.
  2. ↑ Kovalovsky D, Uche OU, Eladad S, Hobbs RM, Yi W, Alonzo E, Chua K, Eidson M, et al. (2008). "The BTB-zinc finger transcriptional regulator, PLZF, controls the development of iNKT cell effector functions". Nature Immunology. 9 (9): 1055—64. doi:10.1038/ni.1641. PMC 2662733. PMID 18660811.
  3. ↑ Savage AK, Constantinides MG, Han J, Picard D, Martin E, Li B, Lantz O, Bendelac A (2008). "The transcription factor PLZF (Zbtb16) directs the effector program of the NKT cell lineage". Immunity. 29 (3): 391—403. doi:10.1016/j.immuni.2008.07.011. PMC 2613001. PMID 18703361.
  4. ↑ Kreslavsky T, Savage AK, Hobbs R, Gounari F, Bronson R, Pereira P, Pandolfi PP, Bendelac A, von Boehmer H (2009). "TCR-inducible PLZF transcription factor required for innate phenotype of a subset of γδ T cells with restricted TCR diversity". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (30): 12453—8. doi:10.1073/pnas.0903895106. PMC 2718370. PMID 19617548.
  5. ↑ Zhang T, Xiong H, Kan LX, Zhang CK, Jiao XF, Fu G, Zhang QH, Lu L, et al. (1999). "Genomic sequence, structural organization, molecular evolution, and aberrant rearrangement of promyelocytic leukemia zinc finger gene". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (20): 11422—7. doi:10.1073/pnas.96.20.11422. PMC 18049. PMID 10500192.
  6. ↑ ZBTB16 zinc finger and BTB domain containing 16. Entrez (4 октября 2009). Дата обращения: 10 октября 2009.
  7. ↑ Senbonmatsu T, Saito T, Landon EJ, Watanabe O, Price E, Roberts RL, Imboden H, Fitzgerald TG, et al. "A novel angiotensin II type 2 receptor signaling pathway: possible role in cardiac hypertrophy". EMBO J. 22 (24): 6471–82. doi:10.1093/emboj/cdg637. PMC 291832. PMID 14657020.
  8. ↑ Dhordain P, Albagli O, Honore N, Guidez F, Lantoine D, Schmid M, The HD, Zelent A, Koken MH. "Colocalization and heteromerization between the two human oncogene POZ/zinc finger proteins, LAZ3 (BCL6) and PLZF". Oncogene. 19 (54): 6240–50. doi:10.1038/sj.onc.1203976. PMID 11175338.
  9. ↑ Barna M, Merghoub T, Costoya JA, Ruggero D, Branford M, Bergia A, Samori B, Pandolfi PP. "Plzf mediates transcriptional repression of HoxD gene expression through chromatin remodeling". Dev. Cell. 3 (4): 499–510. doi:10.1016/s1534-5807(02)00289-7. PMID 12408802.
  10. ↑ 1 2 Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP. "The acute promyelocytic leukemia-associated protein, promyelocytic leukemia zinc finger, regulates 1,25-dihydroxyvitamin D(3)-induced monocytic differentiation of U937 cells through a physical interaction with vitamin D(3) receptor". Blood. 98 (12): 3290–300. doi:10.1182/blood.v98.12.3290. PMID 11719366.
  11. ↑ Puccetti E, Obradovic D, Beissert T, Bianchini A, Washburn B, Chiaradonna F, Boehrer S, Hoelzer D, et al. "AML-associated translocation products block vitamin D(3)-induced differentiation by sequestering the vitamin D(3) receptor". Cancer Res. 62 (23): 7050–8. PMID 12460926.
  12. ↑ McLoughlin P, Ehler E, Carlile G, Licht JD, Schäfer BW. "The LIM-only protein DRAL/FHL2 interacts with and is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein". J. Biol. Chem. 277 (40): 37045–53. doi:10.1074/jbc.M203336200. PMID 12145280.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  13. ↑ Labbaye C, Quaranta MT, Pagliuca A, Militi S, Licht JD, Testa U, Peschle C. "PLZF induces megakaryocytic development, activates Tpo receptor expression and interacts with GATA1 protein". Oncogene. 21 (43): 6669–79. doi:10.1038/sj.onc.1205884. PMID 12242665.
  14. ↑ Tsuzuki S, Enver T. "Interactions of GATA-2 with the promyelocytic leukemia zinc finger (PLZF) protein, its homologue FAZF, and the t(11;17)-generated PLZF-retinoic acid receptor alpha oncoprotein". Blood. 99 (9): 3404–10. doi:10.1182/blood.v99.9.3404. PMID 11964310.
  15. ↑ 1 2 3 4 Chauchereau A, Mathieu M, de Saintignon J, Ferreira R, Pritchard LL, Mishal Z, Dejean A, Harel-Bellan A. "HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leukaemia-associated protein PLZF". Oncogene. 23 (54): 8777–84. doi:10.1038/sj.onc.1208128. PMID 15467736.
  16. ↑ 1 2 3 David G, Alland L, Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. "Histone deacetylase associated with mSin3A mediates repression by the acute promyelocytic leukemia-associated PLZF protein". Oncogene. 16 (19): 2549–56. doi:10.1038/sj.onc.1202043. PMID 9627120.
  17. ↑ 1 2 3 Wong CW, Privalsky ML. "Components of the SMRT corepressor complex exhibit distinctive interactions with the POZ domain oncoproteins PLZF, PLZF-RARalpha, and BCL-6". J. Biol. Chem. 273 (42): 27695–702. doi:10.1074/jbc.273.42.27695. PMID 9765306.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  18. ↑ 1 2 Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S. "Class II histone deacetylases are directly recruited by BCL6 transcriptional repressor". J. Biol. Chem. 277 (24): 22045–52. doi:10.1074/jbc.M201736200. PMID 11929873.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  19. ↑ Nanba D, Mammoto A, Hashimoto K, Higashiyama S. "Proteolytic release of the carboxy-terminal fragment of proHB-EGF causes nuclear export of PLZF". J. Cell Biol. 163 (3): 489–502. doi:10.1083/jcb.200303017. PMC 2173632. PMID 14597771.
  20. ↑ Nanba D, Toki F, Higashiyama S. "Roles of charged amino acid residues in the cytoplasmic domain of proHB-EGF". Biochem. Biophys. Res. Commun. 320 (2): 376–82. doi:10.1016/j.bbrc.2004.05.176. PMID 15219838.
  21. ↑ Takahashi S, McConnell MJ, Harigae H, Kaku M, Sasaki T, Melnick AM, Licht JD. "The Flt3 internal tandem duplication mutant inhibits the function of transcriptional repressors by blocking interactions with SMRT". Blood. 103 (12): 4650–8. doi:10.1182/blood-2003-08-2759. PMID 14982881.
  22. ↑ Hong SH, David G, Wong CW, Dejean A, Privalsky ML. "SMRT corepressor interacts with PLZF and with the PML-retinoic acid receptor alpha (RARalpha) and PLZF-RARalpha oncoproteins associated with acute promyelocytic leukemia". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (17): 9028–33. doi:10.1073/pnas.94.17.9028. PMC 23013. PMID 9256429.
  23. ↑ Koken MH, Reid A, Quignon F, Chelbi-Alix MK, Davies JM, Kabarowski JH, Zhu J, Dong S, et al. "Leukemia-associated retinoic acid receptor alpha fusion partners, PML and PLZF, heterodimerize and colocalize to nuclear bodies". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94 (19): 10255–60. doi:10.1073/pnas.94.19.10255. PMC 23349. PMID 9294197.
  24. ↑ Melnick AM, Westendorf JJ, Polinger A, Carlile GW, Arai S, Ball HJ, Lutterbach B, Hiebert SW, Licht JD. "The ETO protein disrupted in t(8;21)-associated acute myeloid leukemia is a corepressor for the promyelocytic leukemia zinc finger protein". Mol. Cell. Biol. 20 (6): 2075–86. doi:10.1128/mcb.20.6.2075-2086.2000. PMC 110824. PMID 10688654.
  25. ↑ Melnick A, Carlile GW, McConnell MJ, Polinger A, Hiebert SW, Licht JD. "AML-1/ETO fusion protein is a dominant negative inhibitor of transcriptional repression by the promyelocytic leukemia zinc finger protein". Blood. 96 (12): 3939–47. PMID 11090081.
  26. ↑ Martin PJ, Delmotte MH, Formstecher P, Lefebvre P. "PLZF is a negative regulator of retinoic acid receptor transcriptional activity". Nucl. Recept. 1 (1): 6. doi:10.1186/1478-1336-1-6. PMC 212040. PMID 14521715.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  27. ↑ Hoatlin ME, Zhi Y, Ball H, Silvey K, Melnick A, Stone S, Arai S, Hawe N, et al. "A novel BTB/POZ transcriptional repressor protein interacts with the Fanconi anemia group C protein and PLZF". Blood. 94 (11): 3737–47. PMID 10572087.

Литература

Источник — https://ru.wikipedia.org/w/index.php?title=Цинковый_палец_и_BTB-домен,_содержащий_белок_16&oldid=70222796