Dicer

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Dicer 1, рибонуклеаза III
Mouse dicer.jpg
Структура РНКазы IIIb и дцРНК-связывающего домена мыши (Dicer).
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ DICER1 ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Внешние ID OMIM: 606241 MGI2177178 HomoloGene13251 GeneCards: DICER1 Gene
номер EC 3.1.26.3
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 23405 192119
Ensembl ENSG00000100697 ENSMUSG00000041415
UniProt Q9UPY3 Q8R418
RefSeq (мРНК) NM_001195573 NM_148948
RefSeq (белок) NP_001182502 NP_683750
Локус (UCSC) Chr 14:
95.55 – 95.62 Mb
Chr 12:
104.69 – 104.75 Mb
Поиск в PubMed [1] [2]
Молекула Dicer-подобного белка из Giardia intestinalis. Dicer катализирует разрезание двуцепочечной РНК (dsRNA), при этом образуются малые интерферирующие РНК (siRNA). Домены РНКазы III показаны зеленым цветом, домен PAZ — желтым, домен платформы — красным, соединительная спираль — синим. Расстояние между доменами РНКазы III и PAZ определяется длиной соединительной петли и углом её наклона, что, по-видимому, определяет длину образующихся молекул siRNA[1].

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA), и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце[1].

Dicer содержит два домена RNase III и один домен PAZ. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA[2].

См. также[править | править код]

Примечания[править | править код]

  1. 1 2 Macrae I, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks A, Cande W, Adams P, Doudna J (2006). «Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer». Science 311 (5758): 195–8. DOI:10.1126/science.1121638. PMID 16410517.
  2. Jaronczyk K, Carmichael J, Hobman T (2005). «Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others?». Biochem J 387 (Pt 3): 561–71. DOI:10.1042/BJ20041822. PMID 15845026.