Dicer

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Dicer 1, рибонуклеаза III
Mouse dicer.jpg
Структура РНКазы IIIb и дцРНК связывающего домена мыши (Dicer).
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ DICER1 ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Внешние ID OMIM: 606241 MGI2177178 HomoloGene13251 GeneCards: DICER1 Gene
номер EC 3.1.26.3
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 23405 192119
Ensembl ENSG00000100697 ENSMUSG00000041415
UniProt Q9UPY3 Q8R418
RefSeq (мРНК) NM_001195573 NM_148948
RefSeq (белок) NP_001182502 NP_683750
Локус (UCSC) Chr 14:
95.55 – 95.62 Mb
Chr 12:
104.69 – 104.75 Mb
PubMed поиск [1] [2]
Молекула белка Dicer-подобного белка из Giardia intestinalis. Dicer катализирует разрезание двуцепочечной РНК (dsRNA), при этом образуются малые интерферирующие РНК (siRNA). Домены РНКазы III показаны зеленым цветом, домен PAZ показан желтым, домен платформы показан красным, соединительная спираль — синим цветом. Расстояние между доменами РНКазы III и PAZ определяется длиной соединительной петли и углом ее наклона, что, по-видимому, определяет длину образующихся молекул siRNA[1].

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двухцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA), и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3' конце[1].

Dicer содержит два домена RNase III и один PAZ домен. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA[2].

См. также[править | править вики-текст]

Примечания[править | править вики-текст]

  1. 1 2 Macrae I, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks A, Cande W, Adams P, Doudna J (2006). «Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer». Science 311 (5758): 195–8. DOI:10.1126/science.1121638. PMID 16410517.
  2. Jaronczyk K, Carmichael J, Hobman T (2005). «Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others?». Biochem J 387 (Pt 3): 561–71. DOI:10.1042/BJ20041822. PMID 15845026.