Docking@Home

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к: навигация, поиск
Docking@Home
Docking@Home Logo.PNG
Docking atHome.png
Графика из программы-клиента
Тип Распределённые вычисления
Операционная система Кроссплатформенное ПО
Аппаратная платформа x86
Последняя версия • Charmm 34a2: 6.23
Состояние Закрытие 23.05.2014
Сайт docking.cis.udel.edu
Docking@Home
Docking at home screensaver.jpg
Платформа BOINC
Объём загружаемого ПО 7.7 МБ
Объём загружаемых данных задания 1.2 МБ
Объём отправляемых данных задания 75—100 КБ
Объём места на диске 11 МБ
Используемый объём памяти 169 МБ
Графический интерфейс есть
Среднее время расчёта задания 5.5 часов
Deadline 14 дней
Возможность использования GPU нет

Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1] 7 апреля руководство Docking@Home объявило о закрытии проекта, состоявшегося 23 мая 2014 года.[2]

Докинг[править | править код]

Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[3] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]

Детали проекта и статистика[править | править код]

Научные достижения[править | править код]

Примечания[править | править код]

См. также[править | править код]

Ссылки[править | править код]