ETS1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ETS1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1GVJ, 2NNY, 2STT, 2STW, 3MFK, 3RI4, 3WTS, 3WTT, 3WTU, 3WTV, 3WTW, 3WTX, 3WTY, 3WTZ, 3WU0, 3WU1, 4L0Y, 4L0Z, 4L18, 4LG0

Идентификаторы
ПсевдонимыETS1, ETS-1, EWSR2, p54, c-ets-1, ETS proto-oncogene 1, transcription factor
Внешние IDOMIM: 164720 MGI: 95455 HomoloGene: 3837 GeneCards: ETS1
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме ETS1
Расположение в геноме ETS1
Локус11q24.3Начало128,458,761 bp[1]
Конец128,587,558 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме ETS1
Расположение в геноме ETS1
Локус9 A4|9 17.97 cMНачало32,636,221 bp[2]
Конец32,757,820 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001143820
NM_001162422
NM_005238
NM_001330451

NM_001038642
NM_011808

RefSeq (белок)

NP_001137292
NP_001155894
NP_001317380
NP_005229

NP_001033731
NP_035938
NP_001359463
NP_001359464
NP_001359465

NP_001359466

Локус (UCSC)Chr 11: 128.46 – 128.59 MbChr 9: 32.64 – 32.76 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Белок C-ets-1 (англ. Protein C-ets-1) — белок фактор транскрипции, продукт гена человека ETS1[5]. Входит в семейство факторов транскрипции ETS[6].

Фактор трансккрипции, который осуществляет прямой контроль экспрессии цитокинов и хемокинов в ходе множества клеточных процессов. Может контролировать дифференцировку, выживание и пролиферацию клеток лимфоидного ряда. Может регулировать ангиогенез за счёт регулирования экспрессии генов, отвечающих за миграцию и инвазию клеток.

Взаимодействия

[править | править код]

Ets1 взаимодействует с рядом других факторов транскрипции, образуя мультимолекулярные комплексы. При взаимодействии Ets1 с другими факторами транскрипции (Runx1, Pax5, TFE3, USF1) конечный эффект комплекса зависит от статуса фосфорилирования C-концевого домена Ets1 (фосфорилирование инактивирует его). Ацетилтрансферазы CBP и p300 связывают Ets1. трансактивационный домен. AP1, STAT5 и VDR связываются с C-концевым доменом белка.

Кроме этого, Ets1 связывается с TTRAP,[7] UBE2I[8] и DAXX.[9]

Структура и внутриклеточная локализация

[править | править код]

Белок C-ets-1 состоит из 441 аминокислоты, молекулярная масса 50,4 кДа. Локализован в клеточном ядре, может переходить в цитоплазму при связывании изоформы Ets-1 p27.

Экспрессия

[править | править код]

Наиболее высокий уровеь экспрессии обнаружен в клетках лимфоидного ряда. Изоформы c-ETS-1A и Ets-1 p27 обнаружены во всех фетальных тканях. В тканях взрослого организма уровень может сильно различаться, отсутствует в мозге и почках.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134954 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032035 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Delattre O., Zucman J., Plougastel B., Desmaze C., Melot T., Peter M., Kovar H., Joubert I., de Jong P., Rouleau G. Gene fusion with an ETS DNA-binding domain caused by chromosome translocation in human tumours (англ.) // Nature : journal. — 1992. — September (vol. 359, no. 6391). — P. 162—165. — doi:10.1038/359162a0. — PMID 1522903.
  6. Dwyer J., Li H., Xu D., Liu J. P. Transcriptional regulation of telomerase activity: roles of the Ets transcription factor family (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 1114, no. 1). — P. 36—47. — doi:10.1196/annals.1396.022. — PMID 17986575.
  7. Pei H., Yordy J. S., Leng Q., Zhao Q., Watson D. K., Li R. EAPII interacts with ETS1 and modulates its transcriptional function (англ.) // Oncogene : journal. — 2003. — May (vol. 22, no. 18). — P. 2699—2709. — doi:10.1038/sj.onc.1206374. — PMID 12743594.
  8. Hahn S. L., Wasylyk B., Criqui-Filipe P., Criqui P. Modulation of ETS-1 transcriptional activity by huUBC9, a ubiquitin-conjugating enzyme (англ.) // Oncogene : journal. — 1997. — September (vol. 15, no. 12). — P. 1489—1495. — doi:10.1038/sj.onc.1201301. — PMID 9333025.
  9. Li R., Pei H., Watson D. K., Papas T. S. EAP1/Daxx interacts with ETS1 and represses transcriptional activation of ETS1 target genes (англ.) // Oncogene : journal. — 2000. — February (vol. 19, no. 6). — P. 745—753. — doi:10.1038/sj.onc.1203385. — PMID 10698492.

Литература

[править | править код]
  • Bonaldo M. F., Lennon G., Soares M. B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery (англ.) // Genome Res. : journal. — 1997. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
  • Nishihara S., Iwasaki H., Kaneko M. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase 9 (FUT9; Fuc-TIX) preferentially fucosylates the distal GlcNAc residue of polylactosamine chain while the other four alpha1,3FUT members preferentially fucosylate the inner GlcNAc residue (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 462, no. 3. — P. 289—294. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01549-5. — PMID 10622713.
  • Cailleau-Thomas A., Coullin P., Candelier J. J. et al. FUT4 and FUT9 genes are expressed early in human embryogenesis (англ.) // Glycobiology : journal. — 2000. — Vol. 10, no. 8. — P. 789—802. — doi:10.1093/glycob/10.8.789. — PMID 10929005.
  • Nakayama F., Nishihara S., Iwasaki H. et al. CD15 expression in mature granulocytes is determined by alpha 1,3-fucosyltransferase IX, but in promyelocytes and monocytes by alpha 1,3-fucosyltransferase IV (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 19. — P. 16100—16106. — doi:10.1074/jbc.M007272200. — PMID 11278338.
  • Roos C., Kolmer M., Mattila P., Renkonen R. Composition of Drosophila melanogaster proteome involved in fucosylated glycan metabolism (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 5. — P. 3168—3175. — doi:10.1074/jbc.M107927200. — PMID 11698403.
  • Toivonen S., Nishihara S., Narimatsu H. et al. Fuc-TIX: a versatile alpha1,3-fucosyltransferase with a distinct acceptor- and site-specificity profile (англ.) // Glycobiology : journal. — 2003. — Vol. 12, no. 6. — P. 361—368. — doi:10.1093/glycob/12.6.361. — PMID 12107078.
  • Li H., Kong Y., Yan B. [Regulation by ovarian hormones of alpha 1,3-fucosyltransferase gene (FUT9) expression in human endometrium] (англ.) // Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao : journal. — 2003. — Vol. 34, no. 6. — P. 775—779. — PMID 12417923.
  • Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Nishihara S., Iwasaki H., Nakajima K. et al. Alpha1,3-fucosyltransferase IX (Fut9) determines Lewis X expression in brain (неопр.) // Glycobiology. — 2004. — Т. 13, № 6. — С. 445—455. — doi:10.1093/glycob/cwg048. — PMID 12626397.
  • Mungall A. J., Palmer S. A., Sims S. K. et al. The DNA sequence and analysis of human chromosome 6 (англ.) // Nature : journal. — 2003. — Vol. 425, no. 6960. — P. 805—811. — doi:10.1038/nature02055. — PMID 14574404.
  • Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A. et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Bogoevska V., Horst A., Klampe B. et al. CEACAM1, an adhesion molecule of human granulocytes, is fucosylated by fucosyltransferase IX and interacts with DC-SIGN of dendritic cells via Lewis x residues (англ.) // Glycobiology : journal. — 2006. — Vol. 16, no. 3. — P. 197—209. — doi:10.1093/glycob/cwj057. — PMID 16282604.